7 января 1598 года царь Фёдор умер, с его смертью пресекся царственный род Рюриковичей. Старший сын Ивана Грозного Иван Иванович был жестоко избит отцом и умер 19 ноября 1581 года, заступившийся за царевича Борис Годунов тоже был избит царем и проболел несколько месяцев. Младший — Дмитрий, погиб 15 мая 1591 года. Остальные дети Грозного умерли еще при жизни отца.
Один из первых консулов Римской республики Луций Юний Брут казнил своих сыновей за участие в заговоре против республики. Царь Иудеи Ирод I Великий убил тестя, жену и двух своих сыновей. Золотоордынский хан Джанибек и его двенадцать детей были убиты его старшим сыном Бердибеком. Султан Селим I (1512–1520) придя к власти после свержения отца, приказал его отравить, а трех своих братьев и десятерых племянников задушить. Султан и халиф Мухаммед III (1595–1603) приказал удавить 19 своих родных братьев. Иранский шах Аббас I (1587–1628) казнил своего старшего сына, заподозрив того в заговоре на свою жизнь, и ослепил двух других сыновей. Король Кастилии Энрике II (1369–1379) собственноручно убил своего брата короля Педро Жестокого (1350–1369). По приказу Чингисхана был убит его старший сын Джучи. "Старший, Джучи, не ладил с отцом, пытался оказывать милость побежденным и в начале 1227 г. был убит подосланными убийцами" (11, с. 165). Литовский князь Ягайло (1377–1392) злодейски умертвил дядю Кейстута и изгнал его сына Витовта. И в истории других народов можно найти множество примеров, когда отец убивает сына или сын убивает отца, или король (султан, хан и т. п.) убивает своих родственников. Нашим соотечественникам, знающим поверхностно историю России и не знающих историю других стран и народов, убийство Иваном Грозным своего сына кажется запредельной жестокостью, но убийство было случайным, царь очень сильно раскаивался, хотел отказаться от царствования и уйти в монастырь. Грозный остался у власти по настоянию бояр не хотевшим лишиться царя во время Ливонской войны.
17 февраля 1598 года в Кремле открылась Дума земская, или Государственный Собор, который провозгласил царем Бориса Федоровича Годунова (Царь всея Руси в 1598–1605 гг.). После нескольких отказов Борис согласился принять царский венец и 1 сентября, в праздник Нового года, совершил царское венчание.
Во времена правления и царствования Бориса Годунова Россия окончательно завоевала Сибирь. Были воздвигнуты новые города как на завоеванных землях — Уфа, Самара, Царицын, Тюмень, Тобольск, Сургут, так и на русских — Архангельск, Воронеж, Березов, Белгород и другие. Отвоеваны утраченные по договору 1583 г. берега Финского залива и русские города Ям, Копорье, Ивангород, Корела. В 1589 г. было утверждено патриаршество. Русская церковь получила самостоятельность, ее роль и влияние возросли. Экономика страны, подорванная длительной Ливонской войной, постоянными набегами крымцев, освоением и заселением новых территорий, требовала огромных денежных средств и людских ресурсов. Для пополнения казны Борис в начале правления ввел заповедные годы, в течение которых крестьянам запрещалось переходить от одного помещика к другому, а в 1597 г. издал указ о пятилетнем сроке сыска беглых крестьян.
В конце периода, когда все идет наперекосяк, в людях поселяется демон разрушения и безумства, шапка Мономаха становиться тяжкой. Трудно быть правителем, особенно если ты предназначен Судьбой на закланье. Все, что бы хорошего не сделал Борис, в конце обратилось против него и его семейства. Все, что он сделал плохого, ему пришлось пожать с седмерицею. Даже природа выступила против новой династии.
Венчаясь на царство, Годунов обещал, что в его царствование не будет ни сирого, ни бедного. Но первые три года XVII века Россию поразил небывалый неурожай. Дожди и мороз уничтожили все крестьянские посевы. Разразился страшный голод. Годунов попытался накормить голодных, но запасы вскоре иссякли. Карамзин пишет, что люди "подобно скоту щипали траву и питались ею; у мертвых находили во рту сено. Мясо лошадиное казалось лакомством: ели собак, кошек, стерво, всякую нечистоту. Люди сделались хуже зверей: оставляли семейства и жен, чтобы не делиться с ними куском последним. Не только грабили, убивали за ломоть хлеба, но и пожирали друг друга. Путешественники боялись хозяев, и гостиницы стали вертепами душегубства: давили, резали сонных для ужасной пищи! Мясо человеческое продавалось в пирогах на рынках! Матери глодали трупы своих младенцев!.." [25, т. XI, гл. II, с. 66]. Только в Москве от голода погибло 120 тысяч человек. Шайки голодных людей занялись разбоем и грабежами. Под Москвой образовались отряды беглых под предводительством атамана Хлопка, для разгона которых царь был вынужден послать целое войско.