Конклав открылся вечером 19 июня 1963 года. Через два дня, после пятого голосования, семидесятипятилетний кардинал Джованни Баттиста Монтини был избран папой и принял имя Павел VI. Интронизация состоялась через девять дней. Первым решением нового папы было назначение масона Ортолани «Рыцарем Его Святейшества» в благодарность за его гостеприимство.
Человек, который помог Крунославу Драгановичу устроить так называемый «Ватиканский коридор», один из самых высокопоставленных членов курии, замешанных в операции «Монастырь», способствовавший бегству военных преступников, нацистов и хорватов после окончания Второй мировой войны, занимал теперь престол святого Петра. Секретные службы Ватикана, Священный Альянс и Sodalitium Pianum,должны были опять, словно возродившись из пепла, заработать в полную силу. Эту трудную задачу Павел VI передал в руки простого священника. Звали его Паскуале Макки. Этот человек, ныне доверенное лицо римского папы, познакомился с кардиналом Монтини, когда тот был назначен главой Миланского архиепископата. Макки стал его личным секретарем и, кроме того, его основным источником информации. Теперь, став папой, Павел VI отдал в руки Макки одну из самых могущественных информационных структур в мире, Священный Альянс. Этой структуре, созданной когда-то по приказу генерала инквизиции кардинала Микеле Гизлиери, вскоре после этого ставшего папой Пием V, через несколько лет должно было исполниться, четыре века.
Некоторые источники рисуют Макки высшим иерархом шпионских служб государства Ватикан, другие же отмечают, что Паскуале Макки так никогда и не стал руководителем Священного Альянса, что он был всего лишь ничтожным фильтром между главой католической церкви и кардиналом, который отвечал за работу разведывательных служб. Тем почти пятнадцати годам, в течение которых Павел VI занимал престол святого Петра, суждено было стать одним из самых плодотворных периодов деятельности Священного Альянса.
Микеле Синдона, Роберто Кальви, Пол Марцинкус, Карлос Шакал, Голда Меир, Моссад, «Черный сентябрь» вот некоторые имена людей и названия организаций, с которыми пришлось столкнуться разведке Святого престола. Но враги находились не только вне Ватикана, а и внутри него — такие, как, например, масонство.
Одну из самых эффектных своих операций контрразведка Ватикана, Sodalitium Pianum,осуществила в первые годы понтификата Павла VI. Так как государство Ватикан, несомненно, представляло огромный интерес для Москвы и КГБ, советским разведывательным службам удалось внедрить своего «крота» в высшие сферы Римской курии, в ближайшее окружение самого папы.
Алигьеро Тонди окончил семинарию иезуитов и, благодаря своим деловым качествам, стал секретарем и личным помощником монсеньора Монтини. Когда Монтини был избран папой и перебрался из Милана в Ватикан, он захватил с собой и юного Тонди.
На самом деле иезуит Тонди был тайным агентом КГБ в Ватикане — возможно, одним из самых активных агентов. Окончив семинарию в 1936 году, Тонди решил начать сотрудничать с католическими издательствами, где и познакомился с группой коммунистов. Коммунистическая партия Италии даже выбрала его кандидатуру для обучения в Ленинском университете в Москве. А там советская разведка завербовала его для работы в Ватикане.
Тонди начал действовать в качестве советского агента в 1944 году. Он сообщал о священниках из отдела Russicum, которых тайно отправляли в Советский Союз для подпольной миссионерской деятельности. Согласно подсчетам Священного Альянса, Алигьеро Тонди выдал КГБ около двухсот пятидесяти священников — членов Russicum, многие из которых закончили свои дни в советских лагерях или были расстреляны по обвинению в шпионаже против Советского Союза.
В 1967 году некий агент Sodalitium Pianumсообщил, что Тонди видели в кафе в обществе человека, которого Священный Альянс классифицировал как предполагаемого агента КГБ: это был один из сотрудников советского посольства в Риме. Контрразведка Ватикана моментально установила за отцом Алигьеро Тонди постоянное наблюдение, хотя и без ведома папы Павла VI. Священный Альянс стремился установить, насколько глубоко Тонди проник в службы безопасности Ватикана. Наконец однажды вечером, в 1968 году, в контрразведку поступило срочное сообщение о том, что секретарь Его Святейшества просил, чтобы ему дали разрешение ознакомиться с некими документами, которые хранились в Тайном архиве. Не теряя времени, контрразведка обратилась к кардиналу Эжену Тиссерану с просьбой оттянуть дело до появления агентов Священного Альянса. В папке, которой интересовался Тонди, хранились послания папы Пия VI своим нунциям и легатам в странах Восточной Европы, по ту сторону «железного занавеса». Если бы эти послания попали в руки Тонди, некоторые агенты Священного Альянса в Венгрии, Польше, Чехословакии и Румынии были бы раскрыты.