Последнее событие, имевшее место 3 июня 1993 года (референдум был назначен на 5 июня), расценивается многими как начало гражданской войны. После этого Автурханов создал антидудаевское ополчение в Знаменском, Гантамиров собрал свои отряды в Урус-Мартане, и тот и другой попросили помощи у Москвы.
6 сентября на торжества, посвященные второй годовщине независимости Чечни, прилетел специальный самолет из Москвы, в котором находились лидер ЛДПР Жириновский и глава Русского национального собора генерал КГБ Стерлигов.
После проведенных с ними встреч Дудаев сказал, что «талантливая команда Жириновского способна вылечить Россию», а Стерлигов заявил, что с президентом Чечни найден общий язык о месте республики в составе будущей России.
Дальнейшие действия объединенной оппозиции привели к созданию в июне 1994 года Временного Совета, объявившего о низложении Дудаева. Москва почти сразу же выделила для этой новой структуры 150 млрд рублей, которые официально предназначались для выплат пенсий и пособий. Однако эти деньги пошли на формирование оппозиционной армии, после комплектования которой вооруженные стычки между противоборствующими силами стали регулярными и в конце концов привели к большой войне, о скрытых рычагах которой еще пойдет речь.
Как отмечалось, одним из составляющих ичкерийской системы было криминальное сообщество, которое тесно смыкалось с другим ее компонентом — спецслужбами.
Главной советской, а затем и российской спецслужбой, как известно, был КГБ и он формально просуществовал в Чеченской Республике до апреля 1992 года. Его штаб-квартира была разгромлена, чекисты разбрелись кто куда, и дальнейшая служебная перспектива рисовалась им в тумане.
Одновременно с ликвидацией КГБ новые власти предпринимали попытки создать собственную спецслужбу с привлечением советников из числа профессионалов. Для нее лично Дудаевым было подобрано название: Служба национальной безопасности (СПБ) при президенте Чеченской Республики, и ее директором специальным указом был назначен известный борец Салман Хасимиков.
Наименование «Ичкерия» еще не было введено в политическую лексику, и оно появилось спустя примерно год с подачи того же Дудаева.
Основатели СНБ пытались привлечь в новую структуру чекистские кадры, что нечасто удавалось. Зато с предложением своих услуг навязывались различные сомнительные личности, которые принимались на службу по ходатайствам «весомых персон». Системы специальной проверки кандидатур не было, и попытки ввести ее заканчивались неудачей, поскольку «свои» проверке не подлежали. В результате получилась спецслужба, в которой на одного чекиста приходилась дюжина бандитов. Не вписавшиеся в столь непривычную среду чекисты-профессионалы покинули службу.
Параллельно с президентским СНБ существовал еще комитет национальной безопасности (КНБ) при парламенте под руководством полковника Советской Армии Ибрагима Сулейменова, который одновременно руководил и парламентским комитетом по обороне и безопасности. Надо сказать, что парламент ЧР имел и другие исполнительные структуры, которые конкурировали с министерствами. Принцип разделения властей для многих больших столоначальников был пустым звуком, и это не могло не сказываться на управляемости системы. Парламентские и президентские спецслужбы жестко соперничали между собой, дело доходило до взаимных арестов и разборок.
Президент на все происходящее смотрел сверху вниз и периодически выпадал из поля зрения соратников и общественности. Если выразиться более конкретно, он время от времени просто исчезал. Не знали о местонахождении главы республики ни президентская канцелярия, ни СНБ с КНБ, ни персональная его служба безопасности во главе со скандальным Абу Арснукаевым, ни домочадцы и близкие. Это и порождало различные легенды вокруг его деятельности. Говорили, в частности, что он отправляется на секретные встречи с высокопоставленными представителями российских или иностранных разведывательных служб. Циркулировали также слухи о наличии в ведении президента еще одной особо законспирированной структуры, которая занимается его важными секретными визитами и другими тайными делами.