Когда в Швейцарии стали распространяться идеи Лютера, Цвингли переехал в Цюрих, где начал проповедовать свое учение, основанное на прямом толковании текстов Евангелия, как и учение Лютера. В то же время на формирование взглядов Цвингли большое влияние оказали идеи Эразма Роттердамского.
Цвингли представлял реорганизацию церкви иначе, чем Лютер. Он считал, что церковь должна быть реформирована полностью; все церковные обряды следовало упразднить. Цвингли призывал не только к церковным, но и к политическим реформам в швейцарских кантонах. Он выступал за отмену наемничества и крепостного права, сохранившегося в лесных кантонах.
В Цюрихе, где Цвингли жил с 1518 года, у него появилось множество сторонников. По их инициативе в городе произошли большие перемены — Цюрих вышел из-под власти католической церкви, в 1523 году началась секуляризация церковных земель, было отменено наемничество.
Учение Цвингли привлекало многих своей мягкостью и осторожностью. Вскоре сторонники этого учения появились даже в Германии. Ульрих Цвингли больше внимания уделял моральным, а не церковным нормам и утверждал, что каждый достойный человек, независимо от его веры, имеет надежду на спасение после смерти. Цвингли достаточно спокойно относился к последователям других учений, не принуждал никого насильно принимать его идеи, стараясь убеждать людей проповедью.
Цвингли не считал, что вся человеческая жизнь должна проходить только в заботах о спасении души. Он учил людей умеренности, но в то же время не запрещал светских развлечений. Цвингли старался всем догматам религии найти рациональное объяснение, в отличие от католических священников, которые часто лишь ссылались на Божественные чудеса. Блестящие ораторские способности Цвингли позволили ему завоевать огромную популярность в народе.
Большинство городских кантонов Швейцарии приняли учение Цвингли, но лесные кантоны, по-прежнему оставшиеся верными католицизму, опасались, что протестантский Цюрих станет претендовать на главенство в конфедерации. Вдобавок ко всему, отношения между католическими и протестантскими кантонами обострились из-за крестьянских выступлений, вспыхнувших на религиозной почве. Восставшие выдвигали те же требования, что и участники Крестьянской войны в Германии.
Крестьянское движение в Швейцарии скоро было подавлено, причем в борьбе с ним католические и протестантские кантоны принимали одинаковое участие, на время прекратив раздоры. Однако вскоре после окончания беспорядков противоречия между католиками и протестантами переросли в военные столкновения. Сторонники Цвингли стремились объединить Швейцарию под властью Цюриха, чего совершенно не желали католические кантоны. Ульрих Цвингли принял активное участие в войне и погиб в 1531 году в сражении при Каппеле. Цюрихские войска потерпели в этой битве сокрушительное поражение, и Цюрих перестал быть центром Реформации.
Реформационное движение стало теперь развиваться в Женеве, где действовал самый выдающийся деятель Реформации в Швейцарии Жан Кальвин (1509–1564).
Кальвин родился во Франции, в городе Нуайоне. С детства он проявлял большие способности к наукам, но был довольно замкнутым мальчиком. Отец Жана, желая сыну лучшего будущего, решил сделать из него церковнослужителя и отправил учиться в Париж. Несколько лет спустя желание отца изменилось, и он велел Жану заниматься юриспруденцией. Послушный сын без возражений выполнил волю отца и начал учиться на юриста.
После смерти отца Кальвин прекратил занятия юриспруденцией и стал изучать гуманитарные науки. В 1531 году, окончив курс наук в Бурже, Кальвин возвратился в Париж, где познакомился с учением Лютера. Через год после возвращения Кальвин стал ревностным защитником Реформации.
Жан Кальвин.
Деятельность сторонников Лютера в Париже вызвала недовольство короля, протестантов стали преследовать, и в 1535 году Кальвину пришлось покинуть Францию. Он переехал в Базель, где стал жить под чужим именем. Во время пребывания в этом швейцарском городке Кальвин работал над переводом Библии на французский язык и над своим трудом «Наставление в христианской вере», в котором постарался систематизировать положения новой религии. В 1536 году Жан Кальвин переехал в Женеву, где его произведение было опубликовано.
«Наставление в христианской вере» являлось изложением идей Кальвина, которые отличались от учения Лютера большей строгостью и определенностью. Теория Кальвина, изложенная им в «Наставлении», впоследствии дала начало новому направлению в протестантстве — кальвинизму.