Выступление горожан Рима заставило сплотиться Фридриха Барбароссу и папу. В ходе мятежа был убит один кардинал, после чего только что избранный понтифик Адриан IV наложил на Рим интердикт (запрет на проведение богослужений). Это событие произошло в страстную неделю, и суеверный страх взял верх над гневом восставших — они согласились изгнать Арнольда из Рима. Еретик покинул пределы города, но был пойман людьми Фридриха Барбароссы и казнен. Его прах развеяли над Тибром, опасаясь, что останки могут стать для последователей Арнольда святыми реликвиями.
Несмотря на оказанную ему помощь, папа поспешил заручиться поддержкой норманнов и пойти на конфликт с императором. Война продолжалась в течение двадцати лет. Непокорный император обзавелся послушным ему антипапой и решительно штурмовал итальянские города, оказывавшие поддержку Адриану IV. После смерти понтифика началась жестокая борьба между двумя претендентами на мантию наместника святого Петра. Бывший антипапа и сторонник Барбароссы Виктор IV понял, что ему не удастся победить, однако ему предоставили другую мантию (очень символично, что он случайно надел ее наизнанку). Законный понтифик Александр III вынужден был бежать, однако обстоятельства обернулись против Фридриха и антипапы: эпидемия подкосила ряды императорской армии.
Фридрих Барбаросса не сложил руки и, собрав новую армию, возобновил военные действия, но в 1176 году потерпел поражение при Леньяно. Реальные результаты противостояния не дали особого преимущества ни одной из сторон, оставив повод для его продолжения. Единственной выигравшей стороной оказались итальянские города: они сумели отстоять свои права в борьбе против императора, что в будущем дало обильные плоды. Со временем города стали основной движущей силой развития европейской культуры и цивилизации.
Одной из ярчайших исторических фигур XIII века был Папа Иннокентий III. Он был скорее политиком, чем священником, и сделал все возможное для усиления могущества церкви. Показательной явилась его проповедь, в которой он так определил свою миссию цитатой из Писания: «Смотри, я поставил тебя в сей день над народами и царствами, чтобы искоренять и разорять, губить и разрушать, созидать и насаждать». Папа именовал себя «царем царей, владыкой владык, священником во веки веков по чину Мельхиседека».
Крестоносцы.
Понтифик подчинил своей политической власти практически всю Европу. Только Венецианская республика смогла противостоять его воле и отстоять свои интересы, скорее коммерческие, чем политические. Из соображений коммерческой выгоды венецианцы хитростью направили военные силы, собранные для IV Крестового похода, против Византии, в результате чего пал Константинополь и было образовано новое государство крестоносцев — Латинская империя. Иннокентий III, поначалу разгневанный своеволием венецианцев, отлучил их от церкви, но постепенно успокоился и стал искать в сложившейся ситуации выгоду. Папа надеялся, что после падения Византийской империи не составит особого труда подчинить восточную церковь, но оказалось, что это далеко не так.
К «подвигам» Иннокентия III относится Крестовый поход против альбигойцев, собравший кровавую жатву в южных провинциях Франции. При нем произошло падение нравов духовенства, утвердившегося во мнении о своем особом социальном статусе, вкусившего вседозволенности и власти. Папа произвел кодификацию канонического права, его кодекс удостоился от современников эпитета «самая мерзкая книга, которую когда-либо произвел на свет ад».
Иннокентий III был опекуном Фридриха II, возведенного в 1212 году на императорский престол. Воспитанник папы стал со временем злейшим врагом папства. Фридрих поражал современников остротой ума и свободомыслием, его называли «чудом мира и изумительным творцом нового». Императору приписывали авторство не существовавшей на самом деле книги «О трех обманщиках», приписываемой то одному, то другому врагу католичества. В книге якобы шла речь о Моисее, Христе и Магомете, которые и назывались тремя обманщиками.