Век магистра был довольно короток. Так, в течение двух столетий в ордене сменилось около 20 магистров. К примеру, после смерти Роберта Сабле в конце сентября 1193 года его место занял Жильбер Эраль, который в 1194 году вошел в число магистров ордена. Этот человек был призван с Запада. Новый магистр уехал со Святой земли еще 10 лет назад (1184 году). Первые шесть лет после этого Жильбер провел в Испании и Провансе, где так же исполнял обязанности магистра. Затем он отправился на Запад.
Особенно тяжелым для ордена оказался период с 1186 по 1193 год. Именно в это время популярность и слава ордена значительно угасли. Весной 1194 года тамплиерам был пожалован Арагонский замок. Этот шаг был вызван не столько великодушием короля, сколько осознанием того, что защитить от вражеских набегов стены этого здания смогут только тамплиеры.
Перед новоизбранным магистром стояла нелегкая задача — обобщение итогов деятельности Дома ордена Храма. Внешне создавалось впечатление, что дела в нем идут просто прекрасно, но, это только казалось. После того как Святая земля приобрела статус места, вокруг которого разгораются политические споры между различными государствами Запада, у ордена появилась необходимость в международной поддержке и сотрудничестве.
В 1198 году на пустующий престол святого Петра взошел Иннокентий III. Этот человек в течение 18 лет издал около 50 булл. В них содержались распоряжения, направленные на благо тамплиеров. Следует отметить тот факт, что многие из указов были изданы по несколько раз. Каждый из них служил как бы подтверждением предыдущего.
С самого своего зарождения орден Храма был взят под покровительство иерусалимским патриархом. Не меньший интерес к нему проявила и епископская власть, которая так же выказывала ему свое расположение. Процедура принятия в орден была довольно интересной. Сначала претендент на членство в ордене представал перед очами архиерея, которому он каялся во всех грехах своих. После того как грешник был прощен, ему предстояло отправится к магистру и двум братьям ордена Храма.
С 1139 года в орден могли входить братья-капелланы, давшие клятву тамплиеров. Все члены организации находились в подчинении магистра и папы. Теперь тамплиерами было получено разрешение на создание кладбищ и часовен. На выбранной для этих целей территории было разрешено захоронение не только самих тамплиеров, но и их слуг. При этом обязательным условием было сохранение епископом права производить захоронение и причастие. Так же они сохраняли права на десятину.
Ситуация изменилась в 60-х годах XII века, когда тамплиеры стали производить на своих кладбищах захоронения всех желающих. При этом главным условием была выплата приходских сборов. Таким образом на тамплиерском кладбище появились захоронения граждан, которые были отлучены от церкви. Этот факт вызвал негативную реакцию у властей.
Поэтому в 1175 году Папа Александр III издал указ об обязательном подчинении тамплиеров распоряжениям святого престола. За точностью их исполнения был призван следить архиепископ Кентерберийский. Благодаря этому указу белое духовенство получило возможность влиять на жизнь внутри ордена. Данное распоряжение было отменено в 1180 году.
В 1199 году по приказу Иннокентия III белое духовенство более не имело права отлучать от церкви членов ордена тамплиеров. В то же время был введен запрет на наложение интердикта. Это решение было принято после весьма интересного инцидента. Между епископом Тивериадским и членами ордена Храма разгорелся спор. Его предметом стал вопрос о средствах городского округа.
Согласно имеющимся данным, на эти цели было выделено 1300 золотых монет, которые предшественник епископа отдал членам ордена на хранение. Теперь же тамплиеры отказывались вернуть их. Епископ назначил разбирательство, на которое пригласил Жильбера Эраля и двух судей (Сидона и Библиса). Последний из приглашенных был в отъезде, а потому суд было решено перенести в город Тир.
Магистр ордена за неимением времени отправил вместо себя двух своих представителей, членов ордена тамплиеров. Явившись на суд, рыцарям пришлось выслушать множество угроз. Епископ пообещал отлучить от церкви всех храмовников, если на третий день после суда деньги не будут возвращены.
Через четыре дня все тамплиеры были отлучены от церкви. На этот раз члены ордена нашли защиту в лице папы, который убрал епископа с кафедры, обвинив в самоуправстве. Чтобы загладить вину церкви перед тамплиерами, было решено поставить его членов вне власти епископа.