Морелль отправился во Францию, где учился в Гренобле и Париже – будучи приглашённым студентом в акушерском институте Торнье, он изучал паразитологию с декабря 1909 года до середины следующего года, а затем вернулся в Германию, в Мюнхен. Его личные дела стали наполняться отзывами за стажировки по иммунологии, психиатрии в ушной клинике, а в августе 1910 года – в гинекологической клинике.
Он не закончил специализацию. В 1913 году Морелль написал докторскую диссертацию по гинекологии, и Королевское баварское государственное министерство выдало ему лицензию практикующего врача.
Тео Морелль начал зарабатывать на жизнь помощником врача в Бад-Кройцнахе, но после недолгого пребывания там поступил судовым врачом в судоходную компанию "Верман", затем перевёлся сначала на "Гамбург-Южная Америка", а затем на северогерманские линии "Ллойда". В последующие годы он таинственно намекал, что практикуемые им методы лечения были результатом опыта работы судовым врачом в тропиках.
Через некоторое время он стал чем-то вроде специалиста по заболеваниям мочевыделительной системы. Он приобрёл небольшую практику в Диценбахе, недалеко от Оффенбаха. Во время Первой мировой войны он недолгое время служил батальонным медиком на западном фронте, а затем армейским врачом в лагере для военнопленных в Ордруфе в Тюрингии. В январе 1919 года он приобрёл практику в Берлине, где и проживал на Байройтерштрассе в течение следующих 17 лет.
В 1920 году он женился на состоятельной актрисе Иоганне Меллер. Брак обещал быть бездетным.
С помощью значительных средств жены Морелль оборудовал роскошную практику. В последующие годы ему предлагали должности придворного врача персидского шаха и короля Румынии. Но он отказался от них, потому что приятнее было жить в Берлине. Он смог вообще отказаться от коллективных пациентов и принимать только частных, у которых были средства для оплаты его гонораров.
К началу 30-х годов Тео Морелль был известным и модным врачом. Блокнот с рецептами 1932 года среди его бумаг может похвастаться напечатанной подписью: "Рентгеновские лучи, высокая частота, диатермия, облучение, гальванические процедуры, анализы мочи и серологические исследования крови". Его годовой доход в 1932 году составлял около 150 тыс. рейхсмарок (около 12 000 фунтов стерлингов). В его приемной встречались богатые и знаменитые. Трезвый анализ клиентуры позволил бы предположить, что к нему обращались в основном громкие имена сцены и экрана, не считая ряда ипохондриков и политических деятелей – людей, о которых его ассистент, доктор Рихард Вебер, позже пренебрежительно заметит: “Вряд ли их можно назвать критичными или умными людьми”.
Когда нацисты пришли к власти в январе 1933 года, это привело к неприятным последствиям для Морелля. Табличка с именем его врача была исписана словом "еврей", возможно, из-за его еврейской клиентуры; позже он предположит, что из-за своей смуглой внешности его самого могли принять за еврея. Какова бы ни была причина, его практика пришла во временный упадок.
Не-еврей Морелль не замедлил принять меры. Он вступил в партию в апреле 1933 года, но продолжал лечить пациентов-евреев, по крайней мере, в течение следующих 5 лет. Два года спустя он переехал через весь Берлин на шикарную Курфюрстендамм, где его практика в доме № 216 специализировалась на венерических заболеваниях.
Именная табличка здесь гласила “Врач общей практики”. Среди его ультрасовременного оборудования был рентгеновский кабинет с новейшими приборами, ультрафиолетовой лампой и тремя аппаратами для диатермии.
Весной 1936 года его экранные друзья представили Мореллю нового пациента, фотографа Генриха Гофмана – близкого друга Гитлера.
Гофман начал пить после смерти первой жены и предавался скрытой гомосексуальности; он остро нуждался в Морелле, поскольку страдал гонореей, которую Морелль тактично называл на допросах пиелитом. На самом деле Мореллю не хотелось ехать в Мюнхен, потому что в Берлине у него было более чем достаточно клиентов. Но Гитлер прислал за ним в Мюнхен личный самолет, и так получилось, что доктора представили рейхсканцлеру на вилле Гофмана в элегантном пригороде Богенхаузен.
В то время Гитлера одолевала меланхолия. Его бессменный шофер Юлиус Шрек только что умер, и он боялся, что, возможно, потеряет и своего друга Гофмана.
Друг Морелля Алоис Беккер позже вспоминал: “Гитлер был очень привязан к Мореллю и сожалел, что его не было рядом, чтобы лечить и Шрека”.