Теофраст описал около 550 видов растений, произрастающих в Греции, близлежащих ее колониях, и даже растения тропических стран: смоковницу, бамбук, бананы, пальмы, лимоны, мимозы, хлопчатник, лотос, папирус и другие. Он стремился описать растительность всех известных грекам стран, при этом он пользовался наблюдениями собирателей и продавцов лекарственных трав, садоводов и дровосеков. Теофраст, как и многие ученые того времени, изучал растения прежде всего с точки зрения их полезности для человека. Описания растений он дает в следующем порядке: какова роль того или иного растения в жизни людей, технические приемы обработки растительных продуктов, как добывать, например, древесный уголь, смолу, пряности, действие лекарственных растений на организм человека и т. п. Вместе с тем он говорит и о среде обитания, географическом распространении растений, дает горизонтальную зональность, климатические условия обитания и другие экологические данные.
Ученый заложил основы органографии, морфологии, анатомии, а также элементы физиологии, эмбриологии и систематики растений. В строении стебля он различает три основные части: кору, древесину и сердцевину, которые построены из волокон (сосудистых пучков) и «мяса» (паренхимы) и заключают в себе сок. Растение, согласно его мнению, питается не только при помощи корней, но и при помощи листьев (этим он предвосхитил открытие воздушного питания растений — фотосинтез, сделанное в конце XVIII — начале XIX века). Теофраст знал о наличии пола у растений и хорошо разобрался в значении частей цветка как плодовых органов. Он писал, например: «У мидийского яблока плод дают те цветы, из средины которых растет нечто вроде веретена (пестик. — В. Ф.); цветы, у которых этого нет — бесплодны». Называет ряд раздельнополых двудомных растений (финиковая пальма и фисташка) и однодомных (грецкий орех, дуб, огурцы, дыня); у последних отмечает наличие мужских цветов — пустоцвета. Он установил перекрестное опыление у пальмы, смоковницы. Наконец, Теофраст создал первую классификацию растений. Он делил растительный мир на деревья, кустарники и травы, отличал растения наземные от водных, а среди последних описал морские и пресноводные формы.
Теофраст возражал против некоторых идеалистических и ненаучных представлений Аристотеля. Например, он критиковал высказывание своего учителя, в котором корни растений сравнивались с головой животных, и доказывал, что корни являются своего рода пищеварительным трактом растений. Он выступал и против признания Аристотелем «конечных причин», то есть абсолютной целесообразности в природе. По мнению Аристотеля, природа ничего не делает напрасно, бесполезно. Теофраст же утверждал, что целесообразность в природе лишь относительна. В доказательство он говорил о совершенно бесполезных рудиментарных органах, о чрезвычайном и тоже бесцельном развитии некоторых частей тела (например, огромные ветвистые рога у оленя, мешающие ему пробираться среди деревьев).
Теофраст, как и большинство философов-материалистов Древней Греции, был атеистом. Его обвинили в безбожии, и он должен был временно удалиться из Афин. Но будучи крупнейшим ученым и талантливым философом, он вскоре завоевал большую любовь и признательность у афинской молодежи. Это помогло ему вернуться в свою школу. В школе собирались до тысячи слушателей, чтобы послушать лекции наделенного «божественным даром красноречия» Теофраста.
Одновременно с расцветом различных течений греческой философской мысли в V веке до нашей эры замечается и серьезный самостоятельный интерес к медицине и сопричастным ей наукам. Эпоха расцвета древнегреческой медицины тесно связана с именем знаменитого врача и мыслителя Гиппократа (около 460–377 гг. до нашей эры). Гиппократу, которого называли «отцом медицины», приписывают очень много научных работ. В основу своей врачебной деятельности он положил обстоятельное и всестороннее изучение человеческого организма и природы. В своих трудах он неоднократно поучал, что познать природу и человека возможно только путем опытного исследования, в то время как различные умозрения ведут ученого по ложному пути. Влияние Гиппократа на развитие медицины его времени и последующих эпох было огромно. Им впервые была создана медицинская школа, которая возглавила борьбу против «философствующей медицины», то есть умозрительной медицины.