Преподавательскую деятельность М.В. Клочков совмещал со службой в Сенатском архиве в должности архивариуса старшего оклада (редактирующий издания архива). В связи с этим фактом несколько позже о Клочкове писал его наставник, профессор Санкт-Петербургского университета С.Ф. Платонов: «…хорошо знает литературу и привык к архивному материалу». Работа в Сенатском архиве послужила толчком к обширной научной деятельности историка: его последующие публикации основываются исключительно на архивных документах: в 1912 г. он напечатал в сенатской типографии работы «Генерал-прокуроры при Павле I», «Дворянское самоуправление в царствование Павла I», опубликовал в «Историческом вестнике» большую статью «Муниципалитет и комиссары Москвы, учрежденные французами в 1812 году». «Конечно, – писал он, – я пользовался и другими материалами, например, письмами современников и мемуарами, но эти последние имели для меня лишь второстепенное значение.». В 1911 г. М.В. Клочков защитил в Петербургском университете магистерскую диссертацию на тему «Население России при Петре Великом» и после достаточно долгих обсуждений ученым советом занял должность профессора истории в Харьковском университете. В 1916 г. в Петрограде отдельным изданием вышла его докторская диссертация «Очерки правительственной деятельности времени Павла I», которую он приготовил к защите в Харьковском университете. При этом ученый активно участвовал в политической жизни города, читая публичные лекции на различные темы в университете и в городской общественной библиотеке: 18 февраля 1917 г. им была прочитана лекция «Константинополь и проливы в русской политике», в апреле 1917 г. он прочитал доклад «Великий Новгород. Его социальный быт и народоправство», в августе 1919 г. – публичную лекцию «Внешняя политика России в ее историческом освещении». К этому времени полностью сформировались политические убеждения М.В. Клочкова: как гражданин и как историк он полностью не приемлет большевизм, выступая за единую и неделимую Россию.
Покинув Харьков вместе с отступавшей Добровольческой армией, Михаил Васильевич оказался на Кубани, с которой он связал свою дальнейшую жизнь. Здесь он не только формально принял идеологию советской власти, но и нашел в ней рациональное зерно, изменив своим старым убеждениям и коренным образом сменив полярность своей гражданской позиции (по принуждению обстоятельств или по собственной доброй воле – сейчас трудно об этом судить).
Во всяком случае, в 1926 г. М.В. Клочков, уже в качестве заведующего Краснодарским рабочим университетом (открыт 14 декабря 1925 года), писал, что определил для себя «высокую цель – связать науку с практикой, способствовать просвещению трудовых масс, поднять квалификацию работающих в производстве и тем содействовать социалистическому строительству в нашем Великом Союзе Республик», и опубликовал в 1927 г. в Краснодаре работу «Марксизм в русской исторической науке». Преподавательскую деятельность М.В. Клочков продолжил в Кубанском педагогическом институте, сочетая ее с научной работой. Изменился также и аспект его научно-исторических интересов: в 1929–1933 гг. Клочков работал над темами «Иногородние на Кубани (половина Х1Х и начало ХХ вв.)», «Положение крестьянского хозяйства в конце Х1Х – начала ХХ вв.», «Историзм драмы А.С. Пушкина "Борис Годунов" (к 100-летию напечатания драмы)». В 1941 г. он окончил работу над книгой «М.В. Ломоносов», в которой основательно ссылается на работы классиков марксизма-ленинизма. К этому времени он состоял председателем Литературно-исторического и этнологического общества, совмещая эту почетные обязанность с председательством в Кубанском охранном бюро краеведения[11].
11
Балышев М.А. Профессор истории Михаил Васильевич Клочков: документально-биографический очерк // Университеты. Киев. 2005. № 2.