5. Летом 1554 г. военные действия возобновились. Объединенные отряды татар и марийцев стали оказывать сопротивление русским войскам, шедшим с карательными целями. Попытки русских воевод послать против восставших жителей присягнувших России районов, принужденных к этому шагу зимой, полностью провалились, ибо покоренные вновь примкнули к восставшим; вся территория Казанского ханства представляла зону военных действий. Восставшие стали убивать всех, кто сотрудничал с русской властью, они подошли к самой Казани и разбили стоявший там сторожевой полк русской армии.
6. Тогда царское правительство отправило новый крупный отряд под началом князя И.Ф. Милославского, который оккупировал и опустошил 22 волости в центральной части страны, сровнял с землей несколько десятков сел. В плен было захвачено около 50 тыс. чел., и все они были казнены.
Летописи не в состоянии были зафиксировать и перечислить хотя бы часть происходивших в разных пунктах ханства многочисленных сражений. Достаточно сказать, что один только князь Курбский отмечает, что его отряд имел в 1554 г. свыше 20 сражений с восставшими.
7. В Арском крае (Удмуртия) был построен ряд острогов, в которых были оставлены военные гарнизоны, чтобы не ослаблять контроля над населением.
8. Однако все это не привело к ликвидации повстанческих отрядов Мамыш-Берды, они сохраняли свою боеспособность и численность.
9. В 1555 г. обе стороны сделали передышку. Царские войска устали. Население же было подавлено не только военными репрессиями, но и экономической разрухой — в стране два года подряд срывался сев и уничтожался в ходе войны скудный урожай. Работоспособное население было угнано в плен.
10. Но весной 1556 г. Мамыш-Берды начал наступление со своим верным, отважным 2-тысячным войском. Однако и русские военачальники готовились целый год не зря. В апреле 1556 г. армия боярина П.В. Морозова подошла к столице восставших Чалыму и обложила ее. Как и ранее Казань, крепость была взята в результате серии подкопов, минирования и гигантских взрывов (до 300 пудов пороха одновременно!). Был убит хан Али-Акрам, а Мамыш-Берды захвачен хитростью, отвезен в Москву и казнен. Сменивший его богатырь Ахмед (Ахметек-батыр) также был пленен и казнен.
11. Разгромив восстание в Центральном районе Казанского ханства, русское правительство обратилось против второго района восстания — в Удмуртии. Вся эта область была опустошена войском П.В. Морозова уже в мае 1556 г. Как и обычно, всех мужчин убивали, женщин и детей брали в плен. В результате Удмуртия, а затем и все Прикамье (пермяцкие и башкирские районы) были опустошены.
12. В 1557 г. народ, лишенный руководителей, обескровленный уничтожением мужской части населения и пленением всех работоспособных, доведенный до отчаяния многолетним непрерывным разорением страны, отказался от продолжения борьбы. Война окончилась, никакого мира не заключалось. Страна была попросту присоединена к России, в ней введена русская администрация.
13. Из Казани были выселены ее последние жители — татары, им отвели место в Кураншевой слободе, за р. Булак, а в опустевший город, пришедший в совершенный упадок, вселили 7000 русских. Это было все, что осталось от почти стотысячного населения татарской столицы в 40-х годах XVI в. Вокруг Казани образовалась 50-километровая полоса-кольцо из опустевших, брошенных земель, которые в ближайшие же годы были розданы царем русской знати, выводившей крестьян из Центральной России для обжития этих земель.
Примечание:
Ликвидация Казанского ханства вызвала глубокое уныние и возмущение у всех мусульманских государств: Турция, Крымское и Астраханское ханства, а также Ногайская Орда не признали российских завоеваний. Однако они не были готовы к единству действий и не могли организовать совместного военного похода на Москву. Наоборот, вследствие их внутренних противоречий Московскому правительству Ивана IV удалось без всякого перерыва продолжить политику завоеваний в Поволжье, и следующим объектом захвата стало Астраханское ханство.
7. Хронологическая таблица правления ханов Казанского ханства (1437—1556 гг.)
| Ханы | Годы правления | В какой раз занимают престол |
| 1. Улу-Мухаммед (Мухаммед Великий) | 1437—1446 | |
| 2. Махмуд, сын Улу-Мухаммеда | 1446—1463 | |
| 3. Халиль, внук Улу-Мухаммеда | 1463—1467 | |
| 4. Ибрагим, брат Халиля | 1467—1479 | |
| 5. Али, сын Ибрагима от 1-й жены | 1479—1484 | 1-й раз |
| 6. Мухаммед-Эмин, сын Ибрагима от 2-й жены | 1484—1485 | 1-й раз |
| 7. Али | 1485—1487 | 2-й раз |
| 8. Мухаммед-Эмин | 1487—1495 | 2-й раз |
| 9. Мамук (Тюменский) | 1495—1496 | |
| 10. Абдул-Латиф (Касимовский) | 1496 — 1502 | |
| 11. Мухаммед-Эмин (конец династии Мухаммеда Великого) | 1502—1518, дек. | 3-й раз |
| 12. Шах-Али (династия Тимур-Кутлу) | 1519, март — 1521 | 1-й раз |