Старец считал частью монастыря Симонопетра и все его подворья: Вознесения в Афинах, св. Харалампия в Салониках, прп. Никодима в Пендалофо (Гуменисская митрополия), а также св. Антония, Преображения Господня и Покрова Пресвятой Богородицы — во Франции. Ко всем этим подворьям он проявлял интерес, любовь и оказывал всемерную поддержку, потому что многие люди, приходя туда, обретали для себя Церковь.
Особенную заботу и попечение отец Эмилиан проявлял к приезжавшим из-за границы инославным христианам, многих из которых он обратит в православие, крестил и постриг в монашество. Среди них особое место занимают архимандриты отец Плакида (Дезей) и отец Илия (Раго) с их общинами. Из этих общин в период с 1979-го по 1984 год, при постоянном руководстве и поддержке старца, возникли, как мы уже упомянули, три подворья монастыря Симонопетра во Франции: одно мужское — св. Антония и два женских — Покрова Пресвятой Богородицы и Преображения Господня, которые ныне вносят свой вклад в распространение православного монашества на Западе. С 1980 года отец Эмилиан несколько раз ездил на подворья во Францию, чтобы наставить и укрепить молодые общины. Тогда же он навестил в монастыре Честного Предтечи (графство Эссекс в Англии) и приснопамятного старца Софрония (Сахарова), с которым его соединяла взаимная любовь и глубокая духовная связь. В 1988 году отец Эмилиан присутствовал на проходивших в Эссексе торжествах прославления прп. Силуана Афонского и освящения храма в честь новопрославленного святого, а в 1993 году, незадолго до кончины старца Софрония, откликнулся на его приглашение освятить новопостроенную крипту, которой предстояло стать местом последнего упокоения отца Софрония.
Как игумен, старец участвовал в общественных делах Святой горы, в заседаниях ее высших законодательных органов, в регулярных и внеочередных заседаниях Священного Кинота, охотно содействуя своим опытом и рассудительностью разрешению многих святогорских проблем. Многократно отец Эмилиан представлял Святую гору перед Вселенским патриархом, государственными органами и в других местах как член комитетов Священного Кинота и прочих церковных делегаций.
Все силы своей души старец отдавал духовничес- кому служению, являясь отцом для братства Симонопетра и сестринства Ормилии, не оставляя при этом сладчайшее уединение и умное безмолвие монашеской жизни. Однако любовь к народу Божию и Церкви заставляла его по временам откликаться на
приглашения епархиальных архиереев и прочих лиц и проводить беседы или участвовать в богословско- монашеских съездах в Греции, на Кипре и в других странах, для наставления христоименной паствы.
«Всегда видя перед собой Господа», старец принимал любые затруднения свободно и естественно, с абсолютным спокойствием и радостью, как Божие благословение. С таким же мирным расположением духа он воспринял и большой пожар в августе 1990 года, который охватил большие территории на Святой горе и стал серьезной угрозой для монастыря Симонопетра.
Уход на покой в монастырь Ормилия
С начала 1995 года серьезное заболевание заставило досточтимого старца постепенно устраниться от исполнения игуменских обязанностей и покинуть любимый монастырь и дорогую для него Святую гору. В 2000 году старец передал игуменский жезл в руки нынешнего настоятеля монастыря Симонопетра преподобного архимандрита Елисея, который с сыновней преданностью продолжает его дело. Сам же старец удалился на покой в монастырь Ормилия, со многим терпением «восполняя недостаток в плоти своей страстей Христовых, ради тела Христа, которое есть Церковь».
Из богатого духовного наследия старца лишь малое количество текстов было опубликовано в период его деятельности, так как сам он, имея единственной целью воспитание и душевное благоустроение своих чад или церковной паствы, смиренно избегал издания своих книг.
Слова старца Эмилиана обнаруживают опытное знание обсуждаемых вопросов, его поучения отличаются глубоким анализом разбираемых тем и непосредственностью в манере изложения. Беседы старца составляют многоценное наследие и духовную сокровищницу для монахов его братства. Этот «сосуд», наполненный «вином неразбавленным», который из-за вынужденного молчания старца в последние годы стал позолоченным и посеребренным, оберегается обеими монашескими общинами как драгоценнейшая святыня и изливается в Церкви Божией как служение любви.
Труд записать многочисленные беседы и слова старца взяли на себя сестры монастыря Ормилия, которые и приступили к их изданию в 1995 году. Они выпустили пятитомную серию «Слова и наставления», а также толкования творений прп. Исаии Отшельника, прп. Исихия Иерусалимского; толкование жития прп. Нила Калабрийского; толкование монашеских канонов, беседы об отношениях между старцем и послушником. Часть работ издана на английском, французском, румынском, русском и сербском языках.