После оппозиционного выступления сейма в 1547 году права его особенно были урезаны. В частности предствительство от горожан' (мещан) было сведено почти на нет. Напряженное положение в Чехии привело в 1609 году к восстанию. Сейм от имени чешских сословий заявил, что Чехия не признает своим королем Рудольфа II, если он не подтвердит политические и религиозные права чехов. В ответ на это Рудольф II должен был 9 июля 1609 года подписать особую «грамоту величества» (Маестат), в которой подтверждал чешским панам, рыцарям, мещанам и крестьянам свободу церковной организации.
Чехам предоставлялось право совершать свободно богослужение по их обрядам, строить беспрепятственно протестантские церкви, основывать школы и т. д. В руки чешских протестантов перешел Пражский университет. Сословия получили право выбирать особых тридцать дефенсоров (защитников) для защиты своих прав и контроля над выполнением Маестата. Но эта уступка Габсбурга была временной. Несмотря на королевскую грамоту, пражский католический архиепископ, паны-католики и королевская администрация в лице крайских (краевых) гетманов и судей продолжали притеснять чехов как в религиозном, так и в политическом отношении.
Император Матвей всячески этой политике покровительствовал. Летом 1617 года бездетный император Матвей передал чешскую корону принцу Фердинанду Штирийскому, являвшемуся вместе с Максимилианом Баварским воспитанником иезуитов. Эрцгерцог Фердинанд Штирийский славился своей преданностью католицизму и нетерпимостью к протестантам. Монахи всегда были его ближайшими друзьями. «Если бы я встретил одновременно ангела и монаха, я бы в первую очередь приветствовал монаха»,— говорил эрцгерцог. Чешский сейм не воспротивился предложению императора. Значительная часть участников заседаний предпочла не явиться в сейм, чтобы не голосовать за Фердинанда. Попытки оппозиций протестовать против кандидатуры эрцгерцога потерпели поражение. Император Матвей покинул Прагу и уехал в Вену.
Провозглашение Фердинанда Штирийского королем Чехии вызвало в Чехии взрыв нового недовольства Габсбургами. Был усилен контроль королевских чиновников над городским самоуправлением, в городских советах протестантов заменяли католиками. В некоторых городах жители получили предписание перейти в католицизм под угрозой изгнания.
Экономическое положение Чехии к концу второго десятилетия XVII века было весьма тяжелым. Торговля и промышленность переживали упадок, отражавший частью общее неблагоприятное положение центральной и восточной Европы этого времени, а частью являвшийся результатом политики правления в Чехии Габсбургов.
Политический и религиозный гнет Габсбургов дополнял общую картину кризиса Чехии.
ЧЕШСКО-ПФАЛЬЦСКИЙ ПЕРИОД ВОЙНЫ
Чешский (или чешско-пфальцский) период охватывает 1618—1623 годы. Он начинается с восстания в Чехии против Габсбургов. К восстанию примкнули Моравия, Силезия, Лужица, Венгрия, Верхняя и Нижняя Австрия.
Помощь восставшим оказали Уния протестантских немецких князей, Трансильвания, Голландия, Англия, Савойя. Габсбурги с помощью Лиги Католических немецких князей, Испании, Римского Папы, Польши, Тосканы, Генуи подавили восстание и разгромили войска Евангелической унии.
Восстание началось с так называемой «дефенестрации» (этим словом в Чехии называли выбрасывание властей из окон во время восстаний) 23 мая 1618 года: из окон пражского замка были выброшены три королевских советника, управлявшие Чехией в отсутствие короля. Упавшие с 15 метровой высоты в замковый ров сановники отделались испугом и ушибами. Через несколько месяцев они бежали за границу и направились к императорскому дворцу.
Так произошла знаменитая «Пражская дефенестрация» 23 мая 1618 года, которую считают началом Тридцатилетней войны. Акт «дефенестрации» означал разрыв Чехии с Австрией.
Чехи-дворяне образовали временное правительство — Директорию из 30 человек во главе с графом Турном. Началось формирование армии. Сейм объявил «дефензию» — военное положение.
Иезуиты и ряд высших лиц католической церкви в Чехии были изгнаны из страны. Чехия вышла вторично из-под власти Габсбургов. Когда в 1619 году Фердинанд II сменил на престоле Матвея, чешский сейм в противовес ему выбрал королем Чехии Фридриха Пфальцского, руководителя Евангелической унии. Фердинанд был низложен незадолго перед коронованием. Еще ранее из страны были изгнаны иезуиты.
Королю Фридриху Пфальцскому нелегко пришлось на новом престоле. Представители его окружения не знали чешского языка, при пфальцском дворе был принят французский язык. Многие чехи были возмущены новым королем, чешская знать признала нового короля заносчивым. Распространилось насмешливое прозвище Фридриха «Зимний король», означающее, что ему предстоит царствовать только одну зиму.