Изменилась и основная хозяйственно-производственная единица: вместо прежнего двора (ко) ею стала большая патриархальная семья, во главе которой стоял владелец именного надела (мёсю) — юридическое лицо, ответственное перед владельцем поместья как налогоплательщик.
Однако эти и другие меры могли лишь на какое-то время задержать процесс разложения системы сёэн, но не предотвратить его, ибо самой системе был органически присущ существенный порок, состоявший в том, что номинальные, отсутствующие владельцы поместий ограничивали свои экономические интересы получением доходов, не утруждая себя заботами о развитии сельскохозяйственного производства, тем более что они получали фиксированный налог с поместий, который взимался ежегодно без какой-либо скидки на неурожай. Все это неминуемо должно было привести и действительно привело к окончательному разложению и гибели этой системы. Сюго, обладавшие несравненно большими правами, чем дзито, быстро поняли, откуда ветер дует, и начали, используя влияние и силу, присваивать сёэн. Так из опоры центральной власти они довольно скоро превратились в ее разрушителей, подтачивая и размывая саму экономическую основу сёгуната. Именно из сюго в основном вырастали новые даймё, которые все меньше считались с центральной властью, оказавшейся настоящей пленницей у себя в стране, и все больше стремились к собственной автономии.
Таким образом, внутри класса феодалов выделяется слой, связанный с более передовой формой собственности и более высоким уровнем производства. И хотя многие из новых даймё как по своему происхождению, так и по социально-классовой принадлежности были выходцами из старых аристократических домов и в силу этого придерживались старых правил, традиций, обычаев и взглядов, они в известной мере отражали новые процессы и явления, порожденные новой эпохой.
Процесс образования крупных самостоятельных феодальных княжеств имел свои отличительные особенности и в разных районах страны протекал по-разному. Это было обусловлено неодинаковым уровнем развития производительных сил в отдельных ее частях, характером, размахом и интенсивностью крестьянской борьбы, положением, личными качествами того или иного нового даймё, средой, его окружавшей. Такой, например, фактор, как отдаленность от столицы, приобретал важное значение, поскольку сильно ослабленные междоусобными войнами правительственные войска не могли с таким же успехом, как прежде, подавлять мятежи вышедших из повиновения местных феодалов. Они едва справлялись с поддержанием относительного порядка в столице и провинциях, расположенных в непосредственной близости от нее. Сюго, назначенные в свое время центральным правительством для выполнения военно-полицейских функций, воспользовавшись выгодной для них ситуацией, сами становились «возмутителями спокойствия», выступали против системы феодальных отношений, которую были призваны защищать, способствовали ее разрушению и гибели.
Вначале, пользуясь своей властью и опираясь на военную силу, они присваивали часть земельных владений в своих провинциях. Но постепенно их аппетиты росли, и они расширяли свои владения за счет более слабого соседа, «округляя» их настолько, что нередко эти владения включали несколько провинций.
Таким образом, новые даймё — это в основном вчерашние военные администраторы в провинциях, которые постепенно превращались в крупных земельных собственников. Вот несколько наиболее характерных примеров такого превращения.
Из века в век должность сюго в провинции Каи, расположенной на востоке страны, переходила по наследству к представителям клана Такэда, который происходил от знаменитого рода Минамото как одна из его боковых ветвей. Во время войны Онин этот клан выступил на стороне Восточной коалиции, поддержал вице-сёгуна Хосокава. Такэда Нобутора, занимавший в то время должность военного губернатора этой провинции, раньше, чем многие другие его соратники по правительственной коалиции, понял всю бесперспективность этой войны. И поэтому, как только представился случай, он немедленно вернулся со своими войсками из столицы в провинцию Каи и, воспользовавшись общей сумятицей и неразберихой, немедленно приступил к завоеванию чужих земель, в том числе и принадлежавших его вчерашним союзникам, армии которых продолжали оставаться в столице. Ему удалось довольно быстро прибрать к рукам всю провинцию Каи и стать единовластным ее владетелем.