Как и в других океанах, различные районы весьма отличаются друг от друга по природным условиям.
Северное пассатное течение образуется в восточной части океана, юго–западнее островов Ревилья — Хихедо в результате соединения вод холодного Калифорнийского течения, приходящего с северо–востока, и теплых вод северной струи Экваториального противотечения, которая при разделении противотечения у берегов Центральной Америки поворачивает на север.
Так как в потоке преобладает погружение вод, продуктивность их невелика, особенно на западе. Крупные скопления тунцов и других рыб здесь редки. Продуктивность вод существенно возрастает в местах подъема вод близ островов и подводных возвышенностей, например западнее Гавайских островов.
Западная часть района, лежащая между Филиппинскими островами и 150° в. д., испытывает влияние муссонов Восточной Азии. Поэтому летом северо–восточный пассат втягивается областью низкого давления над Азией, меняет направление и превращается в юго–восточный ветер — летний муссон. Зимой он сменяется северным ветром, дующим из Азии. В теплый сезон, летом и осенью здесь зарождаются тайфуны.
В пределах северной пассатной зоны по природным условиям выделяется Калифорнийский район. С севера сюда входит холодное Калифорнийское течение. В основном оно движется на юг, но поток малоустойчив, в нем наблюдаются противотечения и многочисленные вихревые круговороты вод. Во многих местах происходит подъем вод. Новые исследования показали, что поднимающиеся с глубины воды в виде языков плодородных вод вытягиваются по поверхности океана на юго–запад.
В этих водах обилен пелагический краб Pleuroncodes. Им питаются тунцы, морские млекопитающие и птицы.
Экваториальный район чрезвычайно разнороден по характеру движения вод. Здесь находится поверхностное Экваториальное противотечение, часть Южного пассатного течения, подповерхностное течение Кромвелла. Циркуляция вод очень сложна. В пределах Экваториального противотечения и на его границе происходит подъем вод, очень интенсивный на самом экваторе. На огромных просторах мигрируют в поисках пищи крупные пелагические рыбы. Каждый вид находит для себя подходящую температуру на той или иной глубине, в зависимости от положения слоя скачка.
В этой зоне множество островов, преимущественно коралловых атоллов Микронезии и Полинезии — Каролинские, Маршалловы, Гилберта и др.
Восточная часть экваториального пояса, прилегающая к берегам Южной и Центральной Америки, имеет ряд особенностей. С запада сюда входят воды поверхностного Экваториального противотечения и подповерхностного течения Кромвелла, с юга — струп Перуанского течения. Близ берегов течения поворачивают. Создается множество завихрений потоков, возникают области подъема и погружения вод. Области подъема вод имеются к юго–западу от берегов Коста — Рики, западнее Галапагосских островов, около залива Теуантепек и в некоторых других местах. Биологическая и промысловая продуктивность этой части экваториального пояса очень высокая.
Обширный Южный пассатный район составляет зона Южного пассатного течения. В восточной части океана это единый и устойчивый поток, в западной части многочисленные острова и архипелаги Полинезии и Меланезии разбивают течение на отдельные потоки, создают завихрения и противотечения.
У северо–восточного берега Австралии находится уникальное творение природы — Большой Барьерный риф Австралии. В последние годы он привлекает пристальное внимание ученых разных стран, в том числе и советских, работающих на экспедиционном судне «Витязь». Интерес этот не случаен. Большой риф — самая грандиозная коралловая постройка в мире, созданная мельчайшими живыми организмами и соизмеримая по протяженности и объему (16 тыс. км 3) с крупными формами рельефа тектонического происхождения. Риф протягивается вдоль северо–восточного (и частично восточного) берега Австралии на 3 тыс. км от 10 до 24° ю. ш. В целом это гигантское скопление отдельных мелководных коралловых плато, рифов, небольших коралловых и песчаных островов. Общая площадь рифа 200 тыс. км 2. Здесь обитает самое большое число видов животных, встречающихся на Земле в одном районе (коралловых полипов, рыб, моллюсков, иглокожих и др.).