В отличие от рептилий амфибии в меньшей степени способны преодолевать водные преграды, поэтому их фауна здесь весьма бедная. Кроме упомянутых уже лептодактилид (см. с. 44), берегов Кубы достиг всего 1 вид огромного семейства квакш, а также 5 видов семейства жаб. Исключительная бедность острова квакшами объясняется тем, что они, заселяя Большие Антильские острова, двигались из Южной Америки. В цепочке островов Малых и Больших Антил, по которым, как по мосту, квакши продвигались на север, Куба оказалась последним островом. Даже на маленькую Ямайку проникло 4 вида квакш. Кубинский вид Osteopilus [=Hyla] septentrionalis встречается повсеместно, будучи обычным на всем острове. Водится квакша в сырых местах: около луж, под камнями; часто поселяется в пазухах банановых листьев.
Настоящие жабы встречаются реже. Одна из них — Bufo peltocephalus — примечательна своими размерами. Считается, что это самая крупная жаба Антильских островов: у крупных экземпляров расстояние от вершины головы до анального отверстия равняется 11 см. Животное имеет широкую морду с выступающими за глазами двумя крупными железами эллиптической формы. Вся спинная поверхность тела покрыта бугорками разного размера и имеет оливковый цвет с кирпично-красными пятнами, обведенными белым. Брюшная сторона светлая, однотонная.
Жабы обитают во влажных местах, селятся обычно по берегам небольших рек и ручьев. В течение дня они прячутся под камнями, стволами деревьев, во всевозможных пещерках и ходах. Ночью, а также после дождя покидают свои убежища. В это время далеко разносятся их крики, удивительно напоминающие кудахтанье кур. Ориентируясь по звуку, можно подойти к жабам довольно близко, но при малейшем шуме, шорохе они замолкают. Если «ощупать» лучом фонаря все ближайшие предметы, то можно увидеть сидящую неподвижно жабу; тело ее расположено вертикально, а немигающие глаза уставлены на источник света.
Кроме амфибий, описанных выше, необходимо также упомянуть о недавно вселенной на Кубу лягушко-быке (Rana catesbeiana). Она прекрасно акклиматизировалась здесь и в настоящее время обычна в западных районах и центральной части острова. Лягушка-бык — единственный кубинский представитель обширного семейства настоящих лягушек, распространенного практически всесветно и включающего более 400 видов!
Млекопитающие как группа обладают по сравнению с амфибиями еще худшими возможностями для преодоления морских барьеров и заселения островов, хотя внутри класса также имеются градации: одни группы более приспособлены к морским путешествиям, другие — менее.
Лучшими путешественниками оказались грызуны, которые наряду с летучими мышами и щелезубом составляют исконную фауну млекопитающих Кубы. Многочисленные теперь на острове мыши и крысы попали сюда благодаря человеку, но еще до того, как первые испанцы высадились на ее берега, здесь уже обитали грызуны семейства нутриевых (относятся к роду цепкохвостых хутий — Capromys). Хутия — народное их название. По внешнему виду они напоминают громадных крыс; могут достигать размеров 55 см, без учета хвоста, и массы в несколько килограммов. Тело покрыто грубым серовато-коричневым мехом и заканчивается почти голым хвостом. Большую часть времени хутии проводят на деревьях, питаясь листьями и плодами; могут при случае поедать и животную пищу.
В настоящее время на Кубе обитает 4 вида хутий. Один из них — C. nana — до последнего времени был известен только по ископаемым остаткам, и его считали вымершим. Но сравнительно недавно несколько экземпляров было обнаружено на небольшой площади п-ова Сапата. Несомненно, что это самая редкая из хутий Кубы. Все четыре вида — C. pilorides, C. prehensilis, C. melanurus и C. nana — эндемики островов Куба и Пинос.