Когда началась борьба между Новгородом и Швецией за территории, лежащие между ними, Ладога стала местом частых вооруженных столкновений. Это объяснялось тем, что для «свеев» (шведов) и их союзников путь в Новгородскую Русь лежал мимо этой крепости на Волхове.
Так, согласно Новгородской летописи, в 1142 году Ладожская крепость подвергалась вражеским нападениям дважды:
«Въ то же лето приходиша Емь (одно из двух племен — сумь и емь, населявших тогда Финляндию. — А.Ш.), и воеваша область Новогородьскую, избиша я Ладожане 400, и не пустиша ни мужъ.
В то же лето приходи Свьискеи князь с епископомъ в 60 шнекъ на гость, иже изъ заморья шли в 3 лодьях; и бишася, не успеша ничто же, и отлучиша ихъ 3 ладьяхъ, избиша ихъ полутораста».
В первом случае к русской крепости подступил шедший по Волхову воинский отряд финского племени емь. Число убитых — 400 человек — свидетельствует о том, что нападавшие на Ладогу финны были многочисленны. По всей вероятности, небольшая по размерам Ладожская крепость гарнизона в четыре сотни воинов иметь просто не могла. Из летописного свидетельства не ясно, был ли штурм крепости, или битва состоялась под ее стенами.
Во втором случае к ней подошел авангард из трех судов огромной мореходной флотилии шведов, состоявшей из 60 шнеков, на которых могло находиться до трех тысяч воинов. Ладожане уничтожили все три авангардных судна, причем было убито 150 шведов, составлявших их экипажи. Гибель их заставила «свейских» князя и епископа («бискупа») не испытывать судьбу, прекратить военный поход и уйти восвояси.
В 1164 году шведское войско попыталось захватить Ладогу, на выручку которой пришло новгородское ополчение во главе с князем Святославом и посадником Захарием. Ладожане во главе с посадником Нежатой выдержали осаду, и шведы сумели только сжечь городской посад. Кульминацией тех событий стала битва на реке Воронай, впадающей в Ладогу. Скандинавы потеряли 43 шнека и «мало их убежаша».
Ладожане принимали участие под знаменами новгородского князя Александра Ярославича в Невской битве со шведами 15 июля 1240 года. Не будь ее, флотилия, шедшая под знаменами ярла Ульфа Фаси и королевского родственника Биргера, могла оказаться под ладожскими стенами.
Новгородская летопись свой рассказ о событиях лета 1240 года на берегах Невы и впадающей в нее реки Ижоры начинала так:
«...Придоша Свей въ силе велице, и Мурмане, и Сумь, и Емь, в кораблихъ, множьство много зело, Свей съ княземъ и с пискупы своими и сташа въ Неве устье Ижеры, хотяче восприяти Ладогу, просто же реку и Новгородъ и всю область Новгородьскую...»
В 1338 году крепость подверглась нападению «немцев с карелою много». Но неприятель не смог взять крепость, хотя и сжег городской посад.
Каменная крепость была настолько мощна и современна, что длительное время не нуждалась в подновлении. Однако появление пушек заставило новгородского владыку архиепископа Евфимия развернуть в Старой Ладоге большое строительство: заложить монастырь святого Георгия и усилить каменную крепостную ограду.
Совсем иной вид приняла древняя Ладога, ставшая частью московских владений, при великом князе Иване III. Крепость поменяла свое каменное одеяние. Толщина стен теперь составила 7 метров, а высота от 7 до 12 метров, и они могли выдерживать пальбу из тяжелых орудий.
Крепостную ограду усилили пять мощных башен: круглые Климентовская, Стрелочная и Раскатная, полукруглая Тайничная и прямоугольная Воротная. Все они имели по три яруса для ведения огневого боя и деревянную кровлю. В одной из башен на случай вражеской осады был устроен потайной колодец.
Последние военные события у Ладожской крепости случились в Смутное время, когда город был захвачен шведами, которые разорили в округе все церкви и монастыри. По Столбовскому мирному договору Старая Ладога осталась в составе Русского царства. В 1703 году в устье Волхова была основана Новая Ладога, ставшая административным центром округи. А город Старая Ладога в скором времени превратился в селение с каменной крепостью, уже навсегда утратившей свое былое оборонительное значение.
...Новгородская земля, в отличие от древнерусских княжеств, отличалась наличием целой системы крепостей (сперва деревянных, потом каменных), которые зорко оберегали ее границы. Усиленное фортификационное строительство было связано прежде всего с тем, что Новгороду приходилось соседствовать с агрессивно настроенными соседями: Немецким орденом в Ливонии, Швецией и Великим княжеством Литовским (затем с Речью Посполитой).