Судьба замка, не в пример подобным фортификационным творениям в европейских странах, оказалась недолговечной. После смерти его владельца Боголюбово взял и разорил рязанский князь Глеб. Монголы же, разграбив замок, полностью разрушили его каменные стены и сожгли деревянную ограду.
...Во Владимиро-Суздальской земле каждый город был крепостью, но военная судьба их разнилась. К числу тех городов, которым выпали наиболее серьезные испытания, относится Переяславль-Залесский (с ним связана история петровского Российского военно-морского флота, он родина Святого князя Александра Невского).
Столица Переяславского княжества находится у озера Плещеева (в древности — Клещина). Ранее здесь существовал укрепленный княжеский городок Клещин, защищенный валами с деревянной оградой окружностью в 500 метров и имевший четверо ворот. Однако он чем-то не приглянулся суздальскому князю Юрию Долгорукому, и он в 1152 году построил новый град, в устье небольшой речушки Трубеж, впадающей в озеро. После этого город Клещин захирел, а потом прекратил само свое существование.
Считается, что Переяславль-Залесский получил наиболее мощные укрепления среди тех городов, которые строил или обновлял Юрий Долгорукий. Его валы протянулись более чем на два километра, а их высота достигала 10—16 метров, при ширине по верху — 6 метров. Они и сейчас производят сильное впечатление. По верху вала тянулись не просто традиционные для Руси рубленые стены с 12 башнями, а двойные стены. Перед валом шел ров. В одной из башен был тайник с колодцем.
Новый город был «мысовым» укреплением. Он занимал угол, образуемый рекой Трубеж и впадающей в нее речкой Мураш. С юга и запада на низменности Переяславль-Залесский охватывал вал, носящий название «Гробля». В старину через Трубеж был перекинут постоянный мост.
Переяславль-Залесский находился в центре Владимиро-Суздальской земли, и потому удельные правители о нем заботились особо. Только этим можно объяснить то, что уже в 1194 году сын Юрия Долгорукого князь Всеволод III перестроил переяславскую деревянную ограду.
Во время Батыева нашествия крепость была взята приступом и сожжена. Случилось это в 1238 году. В 1252 году она вновь была взята ханским войском и разорена. В 1293 году золотоордынская «Дюденева рать» снова опустошила город.
Эти разорения привели к тому, что крепостная ограда столицы небольшого удельного града была перестроена. В 1369 году был срочно укреплен его кремль. Теперь протяженность стены составила 2,5 километра, и площадь города превысила территорию современного Московского Кремля.
В самом начале XIV столетия Переяславль-Залесский стал объектом нешуточной борьбы между Москвой и Тверью, оспаривавшими между собой перед Золотой Ордой право на великое княжение. То есть схватка шла за главенство среди княжеств Северо-Востока Руси. Эта борьба не раз приводила к серьезному вооруженному противостоянию.
Нападение на город тверская рать совершила в 1304 году. Воевода князя Михаила Тверского боярин Акинф, ранее служивший в Москве, осадил Переяславль-Залесский. Но брат Юрия Московского, который со своим противником в споре за великое княжение отправились в Золотую Орду — Иван Данилович (будущий Калита), — был предупрежден лазутчиками о готовящемся нападении, Прибыв в крепость с небольшой дружиной, он сумел организовать оборону города.
Тверская рать держала «спорную» крепость в осаде три дня. За это время из Москвы успело подойти значительное войско, и под стенами города произошла битва. Осажденный гарнизон тоже вышел в поле. Дело закончилось гибелью боярина Акинфа и разгромом тверичей. Больше они подобных нападений не совершали.
Новое вражеское нападение Переяславль-Залесский перенес в 1372 году. На этот раз его обложило войско князя Кейстута — брата великого князя Литовского Ольгерда. Летописец сообщает, что литовцы напали на город «изгоном», то есть внезапно, конной ратью. Однако стража успела затворить крепостные ворота. По набатному зову гарнизон и вооруженные горожане заняли свои места на крепостной стене, изготовившись к бою.
Видя такое дело, литовцы не пошли на штурм крепости, но взяли ее в осадное кольцо. За короткое время округа была опустошена, городской посад и церкви сожжены. Стороны не раз состязались между собой в лучном бое. В итоге князю Кейстуту пришлось уйти, «а града не взяша».
Переяславль-Залесский был сожжен в четвертый раз в своей истории ханским войском в 1382 году. Новый правитель Золотой Орды хан Тохтамыш повел степные полчища на Русь, чтобы отомстить ей, и особенно московскому князю Дмитрию Донскому, за страшное поражение золотоордынцев в Куликовской битве 8 сентября 1380 года и снова заставить русские княжества платить дань Сараю.