Взаимодействие организовывалось также в оперативном и войсковом звеньях тыла. В частности, предварительному согласованию между органами управления тылом соответствующих фронтов (военных округов) и объединений (соединений) других видов Вооруженных Сил подлежали организация обеспечения последних материальными средствами общевойсковой номенклатуры, совместного использования транспортных коммуникаций для подвоза и эвакуации, а также местных ремонтных и лечебных учреждений. Органы управления тылом соседних оперативных объединений организовывали взаимодействие по оказанию двусторонней помощи материальными средствами и транспортом, по использованию местных ресурсов, ведению тыловой разведки и т.п.
В годы Великой Отечественной войны значительно возросла роль надежной охраны и обороны тыла и транспортных коммуникаций. Известно, что немецко-фашистское командование делало ставку на дезорганизацию работы нашего тыла всеми силами и средствами. Не случайно многие советские фронты проводили специальные операции по очистке своих тыловых районов от врага. В результате таких операций, например, 1-м Белорусским, 1-м и 3-м Украинскими фронтами в 1944 г. были выявлены тысячи одиночных диверсантов, разгромлены сотни крупных диверсионных групп. В январе 1945 г. только на восточно-прусском направлении гитлеровцы забросили в тыловые районы наступающих фронтов 150, а в марте — 250 диверсантов, ликвидация которых потребовала соответствующих усилий.
Охрана и оборона тыловых соединений, частей, учреждений и транспортных коммуникаций осуществлялись прежде всего силами и средствами тыла. Кроме того, для этих целей использовалось большое количество специальных соединений и частей охраны тыла НКВД, а нередко и боевые войска. На нашей территории большую помощь в охране и обороне важнейших тыловых объектов оказывали также различные советские организации, предприятия и местное население.
Неоценимое значение в успешном решении огромных задач Тылом Вооруженных Сил в годы войны имела активная и целеустремленная политическая работа в войсках (силах) и среди личного состава тыловых соединений, частей, учреждений и органов управления тылом. Главным содержанием этой работы было воспитание личного состава тыла в духе беззаветной любви к Советской Родине и безграничной преданности Коммунистической партии, в духе дружбы народов СССР, пролетарского интернационализма и жгучей ненависти к фашистским захватчикам; привитие ему высоких морально-боевых качеств; формирование у воинов правильного понимания своей роли в обеспечении победы над врагом и мобилизация их на успешное выполнение стоящих перед ними задач. Большое место занимала выработка у личного состава тыла таких качеств, как честность, бережливость и рациональное расходование доверенных ему материальных ценностей.
Много внимания уделялось мобилизации личного состава Тыла на поддержание четкой взаимосогласованной работы всех тыловых соединений, частей и учреждений в каждом оперативном объединении (соединении, части) и в целом на театрах военных действий; развитию у воинов чувства нового при осуществлении тылового обеспечения войск и сил флота; выработке у них навыков самостоятельного принятия правильных решений и инициативных, сноровистых действий при выполнении задач в отрыве от своих соединений, частей и учреждений; приобретению ими умения храбро и мужественно действовать в любой, самой сложной обстановке. Личный состав Тыла воспитывался также в духе поддержания правильных взаимоотношений с местным населением, проявления заботы о сохранении имущества граждан, материальных, культурных ценностей и памятников в районах действий тыловых соединений, частей и учреждений.
Формы и методы политической работы в органах управления тылом, тыловых соединениях, частях и учреждениях в ходе войны применялись в основном такие же, как и в войсках (силах флота). Вместе с тем опыт войны учит, что в связи с чрезвычайно большой разобщенностью, самостоятельностью в выполнении задач и различной спецификой деятельности органов Тыла их политотделы и политические работники должны больше опираться на широкий партийный и комсомольский актив, партийные и комсомольские организации, на нештатных пропагандистов, на коммунистов и комсомольцев. Война показала необходимость наличия во всех тыловых частях, учреждениях и подразделениях полнокровных партийных и комсомольских организаций. Однако надо учитывать проявившуюся тенденцию вынужденного обстановкой откомандирования лучших солдат и сержантов тыла для пополнения боевых частей. В годы Великой Отечественной войны оправдала себя некоторая централизация партийного руководства в тылу, особенно введение института назначаемых парторгов и комсоргов частей, учреждений и подразделений, а также проведение делегатских собраний коммунистов и комсомольцев там, где по условиям обстановки невозможно было организовывать общие партийные и комсомольские собрания.
Великая Отечественная война показала большую важность правильного решения вопроса подбора и подготовки кадров для Вооруженных Сил вообще и для их Тыла в частности. Чтобы успешно справиться с теми задачами, которые встали перед Тылом в минувшей войне, необходимо было иметь достаточное количество высококвалифицированных кадров командно-штабной специальности тыла и всех служб обеспечения. Особенно высокие требования были предъявлены к генералам, адмиралам и офицерам командно-штабной специальности Тыла, как к основным организаторам тылового обеспечения войск и сил флота. Они должны были не только обладать хорошей оперативной (боевой) и оперативно (тактико)-тыловой подготовкой, но и знать особенности организации обеспечения войск (сил флота) по различным службам. Наши средние и высшие военно-учебные заведения в ходе войны в полной мере удовлетворяли потребности Советской Армии и Военно-Морского Флота в кадрах тыла. Это подтвердило правильность сложившейся системы подготовки кадров.
Неиссякаемым источником побед наших Вооруженных Сил и важнейшим условием успешной работы их Тыла в годы Великой Отечественной войны явилось нерушимое единство Коммунистической партии, советского народа и его армии, постоянная помощь местных партийных и советских организаций военному командованию и органам Тыла Советской Армии и Военно-Морского Флота. Внеплановый выпуск боеприпасов, вооружения и различного военного имущества на предприятиях осажденных городов и прифронтовых районов и передача продукции непосредственно органам тыла действующей армии, организация ремонта вооружения и боевой техники на местных предприятиях, разносторонняя помощь военным госпиталям, организация сбора теплых вещей для воинов, мобилизация местной рабочей силы на строительство оборонительных рубежей, аэродромов, железных и автомобильных дорог и другие мероприятия, проводимые по указанию ЦК ВКП(б) и в порядке инициативы местных партийных организаций, сыграли немаловажную роль в бесперебойном обеспечении боевых действий войск и сил флота. Особенно велико было значение этой помощи в первый, наиболее трудный период Великой Отечественной войны. Воодушевленные коммунистами, в чрезвычайно сложных условиях, подчас под огнем врага, рабочие, колхозники, советская интеллигенция работали не жалея ни сил, ни времени, чтобы оказать максимальную помощь Вооруженным Силам в достижении победы над врагом.