Минск разбогател. Через него шли два больших торговых тракта – северная дорога через Логойск, Борисов, Оршу и Смоленск в Москву; и южная дорога через Слуцк на Волынь к Константинополю. Была важная дорога на Запад – через Брест.
Минском управляли магистрат – два бургомистра, рада и войт, назначавшийся Великим князем Литовским. Все управление обычно сосредотачивалось в ратуше. Впервые минская ратуша упоминается в 1582 году. Каменное здание ратуши было закончено строительством в 1600 году – на Верхнем рынке. Тогда же на ней были установлены первые городские часы.
После пожаров и войн XVI, XVII, XVIII веков минская ратуша была восстановлена в середине XVIII века, а в конце века перестроена в стиле классицизма. В ратуше работали городской магистрат, суд, архив, полиция, небольшая тюрьма. В XIX веке на втором этаже здания проходили театральные представления.
Минск, как и многие древние белорусские города, славился своими мастерами, объединенными в ремесленные цеха. Слово «мастер» происходит от латинского слова «magister» – начальник, учитель, наставник, слово «цех» – от немецкого слова «zeichen» – «знамя». С XI века в Минске работали кузнецы, портные, оружейники, гончары, даже ювелиры. Ремесленные цеха действовали в Минске с XVI века – «каждый ремесленник в городе нашем живущий, работал бы записавшись в цех». В городе работали швейные, кузнечные, шорные, малярные, гончарные, часовые, оружейные, парикмахерские, инструментальные, многие другие. Цеха возглавляли старосты – цехмистеры, члены цехов носили звание «мастеров». Им помогали «подмастерья». После учебы, поездки за границу для совершенствования образования, подмастерье сдавал экзамен на звание мастера цеховой комиссии. Ученики мастеров – наибольшая часть ремесленнических цехов – также в зависимости от мастерства могли подниматься по «мастерской» лестнице.
Ремесленники одного цеха обычно жили в одном районе и даже на одной улице, они подчинялись городскому магистрату, нормам магдебургского права. Их жизнь и работа регламентировались цеховыми уставами. Все цеха имели стяги – хоругви.
В результате административно-территориальной реформы Великого княжества Литовского 1564–1566 годов было образовано Минское воеводство с центром в Минске. Воеводство было разделено на два уезда: в Минский входили Гайна, Докшицы, Дукора, Заславль, Землин, Ивенец, Илья, Койданово, Кривичи, Куренец, Логойск, сам Минск, Могильно, Налибоки, Раков, Радошковичи, Смолевичи, Смиловичи, Холопеничи; в Речицкий – Бобруйск, Брагин, Гомель, Горваль, Глуск, Лоев, Пропойск, Рогачев, Речица, Свислочь, Чечерск. В 1569 году в Минское воеводство из Киевского был передан Мозырский уезд – из Копаткевичей, Лахвы, самого Мозыря, Петрикова, Скрыгалова. Такой порядок существовал до 1772 года. Минск получил право проведения двух ярмарок в год.
В 70-е годы XVI века Минский замок был восстановлен. Итальянский путешественник А. Гваньини писал:
«Минск – большой деревянный город и замок, построенный из дерева, место довольно хорошо приспособленное к обороне природой и трудом, окруженное глубоким рвом-перекопом, по которому течет река, густо уставленная мельницами».
В середине XVI века в Минске было 35 улиц, на которых жили более 2000 жителей. В Минске насчитывалось 80 ремесел, минские купцы торговали мясом, смолой, воском, железом, стеклом, кожей, мехами, привозили соль, пряности, вино, ткани.
В период русско-польской войны второй половины XVI и русско-шведской войны начала XVIII века Минск несколько раз осаждали и штурмовали, в 1655 и 1706 годах город был взят, в 1694 году – сгорел, в 1710–1711 годах пережил сильную эпидемию чумы. Город был разорен и медленно восстанавливался. В конце XVIII века в Минске было 6000 жителей и 1000 домов.
С 1793 года Минск – в составе Российской империи, центр наместничества, а с 1796 года – губернский город Минской губернии. В 1798 году Минск посетил император Павел I, в 1802 году – император Александр I. В 1811 году в Минске жило около 12000 жителей.
Во время Отечественной войны 1812 года с 8 июля по 16 ноября Минск был занят французскими войсками, стал одной из штаб-квартир армии Наполеона, в городе было введено французско-польское правление. Перед уходом французы полностью разрушили и сожгли город. В конце 1812 года в Минске проживало около 3 000 жителей.
Минск начал восстанавливаться в середине XIX века. В 1846 году было построено Московско-Варшавское шоссе. В 1856 году в Минске побывал императора Александр II. Исследователь белорусской культуры и быта П. М. Шпилевский писал в это время в своей работе «Путешествие по Полесью и белорусскому краю»: