Оценив сложившуюся ситуацию, стоявшие на вахте вахтенный моторист матрос Марат Абдуллин и вахтенный трюмный матрос Анатолий Заяц загерметизировались в 4-м отсеке и, угрожая прекратить вентилирование аккумуляторной батареи, что грозило взрывом газовой смеси, потребовали связи с командиром или со старпомом. Захват корабля и переприсягание не удались. Лупаков и Петренко вынуждены были покинуть лодку.
Замечу, что попытка захвата боевого корабля в зарубежных базах Великобритании или США была бы поводом для ввода войск для наведения порядка. Так было и в XIX, и в XX веках. Соответственно, Россия, послав в Севастополь хотя бы одну Псковскую воздушно-десантную дивизию, навсегда могла бы решить вопрос с Севастополем и Крымом вообще. Но, увы, у нас правил «всенародно избранный» выпивоха, для которого приказ из Вашингтона был куда важнее интересов русского народа.
В сентябре 1993 г. вышел приказ командующего Черноморским флотом, в котором после формулировки: «Ввиду невозможности дальнейшего использования по прямому назначению боевых кораблей… нецелесообразности их восстановления… исключить из состава 14-й дивизии подводных лодок большие подводные лодки Б-6, Б-36, Б-41, Б-105 пр. 641, среднюю подводную лодку СС-128 пр. 633…» Причём Б-36 поставили в судоремонтный завод № 13 для использования в качестве запасных частей при ремонте Б-435.
В июле 1994 г. в свой последний парад на День Военно-морского флота в Севастополе вышла С-384 — последняя подводная лодка проекта 613. Она гордо пронесла советский Военно-морской флаг по Севастопольской бухте, погрузилась под перископ и вышла на внешний рейд главной базы флота. Эта лодка честно служила стране 42 года, в том числе 33 года на Черноморском флоте.
В конце 1994 г. командование флота принимает решение упразднить базу подводных лодок в Балаклаве. Казарменно-жилищный фонд и коммунальные сооружения, всего 29 зданий, были безвозмездно переданы в постоянное пользование Исполкому Севастопольского Совета народных депутатов.
16 февраля 1995 г. 155-я бригада подводных лодок была передислоцирована из Балаклавской бухты в Южную бухту. В составе бригады были подводные лодки Б-435, Б-871, «Горьковский комсомолец», Б-9, средняя подводная лодка-лаборатория СС-533.
В принадлежавшем 155-й бригаде балаклавском военном городке стала дислоцироваться воинская часть национальной гвардии Украины.
С начала 1995 г. в составе Черноморского флота уже не было ни одной боеспособной подводной лодки. Лишь 22 мая 1996 г. в состав «сил постоянной готовности» формально ввели подводную лодку Б-871.
В итоге в составе Черноморского флота осталась одна действующая подводная лодка — Б-871. Это вызвало необходимость сокращения 155-й бригады подводных лодок. В январе 2002 г. был создан отдельный дивизион подводных лодок.
Подводная лодка Б-435 проекта 641 была передана Украине и получила название «Запоріжжя».
11 июля 1997 г. на подводной лодке был торжественно поднят Военно-морской флаг Украины, а 21 июля субмарина вошла в боевой состав ВМС Украины. 1 августа 1997 г., когда впервые праздновали День ВМС Украины, на Графской пристани Севастополя министр обороны Украины торжественно вручил командиру подводной лодки капитану 3-го ранга Ивану Джемеле Военно-морской флаг, освящённый во Владимирском соборе в Киеве. 3 августа субмарина была переведена под буксирами в Балаклавскую бухту. После этого «Запоріжжя» была опять же на буксире отправлена в Килен-бухту Севастополя на принадлежавший России судостроительный завод № 13.
Командование УВМС не пожелало покупать аккумуляторы для подводной лодки в России. Посему их закупили у греческой компании «Germanos S. А.». По такому случаю в Грецию сгонял БДК «Константин Ольшанский». Сумма сделки составила около 3,5 млн долларов США (18 млн гривен). После доставки батарей выяснилось, что они не соответствуют по габаритным размерам и клеммам.