Широкую известность в церковной среде – как в Греции, так и за ее пределами – митрополит Серафим получил благодаря многочисленным статьям, книгам, выступлениям и проповедям в защиту чистоты православной веры, священных канонов и святоотеческого наследия. Во многих публикациях владыки – юриста по образованию и многолетнего работника церковных судов – проявилось его глубокое знание канонического права, умение просто, доступно и аргументированно отстаивать свою позицию. В этой связи его работы, посвященные украинскому вопросу, заслуживают особого внимания.
Константинопольский Патриархат начал решительное вмешательство в дела Украины в апреле 2018 года. Вскоре после визита на Фанар президента Украины П. А. Порошенко и его встречи с патриархом Варфоломеем Священный Синод этой Церкви опубликовал коммюнике, в котором сообщалось, что «Вселенский Патриархат… обстоятельно изучил вопрос церковной ситуации на Украине, как изучал его и на предыдущих синодальных заседаниях, принял обращение от украинских церковных и политических лиц, представляющих миллионы православных украинцев, о даровании автокефалии православным верующим Украины – и принял решение войти в тесное общение с другими братскими Православными Церквами для оповещения и координации». Важно отметить, что упомянутые в коммюнике так называемые церковные лица в действительности были представителями украинского раскола и не имели отношения к канонической Украинской Православной Церкви, которая также не уполномочивала государственные власти страны на переговоры по теме автокефалии.
В последующие несколько месяцев делегация Константинопольского Патриархата посетила Предстоятелей большинства Поместных Православных Церквей, в том числе Архиепископа Афинского Иеронима, для переговоров по украинскому вопросу. В то же время на Фанар была направлена официальная делегация Украинской Православной Церкви в составе четырех митрополитов, которые сообщили патриарху Варфоломею об обеспокоенности канонической Церкви слухами о возможности одностороннего предоставления автокефалии и скорой легализации украинского раскола. Наконец, 31 августа в Стамбул для встречи с Предстоятелем Константинопольской Церкви специально прибыл Патриарх Московский и всея Руси Кирилл, просивший своего собрата не предпринимать непоправимых действий на Украине.
Однако уже через неделю Константинополь внезапно перешел от декларации неканонических намерений к их реализации. 7 сентября 2018 года Генеральный секретариат Священного Синода Константинопольского Патриархата объявил о назначении двух иерархов этой Церкви «экзархами» Фанара в Киеве в рамках процедуры подготовки к предоставлению автокефалии Украине. В ответ на это Русская Православная Церковь была вынуждена приостановить молитвенное поминовение Патриарха Константинопольского Варфоломея и предупредила о полном прекращении общения с этой Церковью в случае продолжения ею антиканонических действий.
Митрополит Пирейский Серафим одним из первых в греческом церковном мире публично выступил против вмешательства Константинополя в дела Украинской Православной Церкви. В статье «Подлинные масштабы украинского церковного вопроса» он не только показал необоснованность притязаний Фанара на Украину, но и обратил внимание на крайнюю политизацию украинского вопроса. По мнению владыки, за этим вмешательством стоят внешние, враждебные Церкви силы, которые стремятся «использовать Православную Церковь как инструмент для достижения своих геополитических задач и добиться полной церковной независимости и отчуждения Украинской Православной Церкви от Московского Патриархата, в состав которого она входит уже много веков». Конечная их цель – «расколоть единство Православной Церкви – нешвенный хитон Христов, чтобы таким образом ослабить ее роль в мире».
Несмотря на это Константинополь продолжил наступление на Украину и решился на действия, сделавшие дальнейшее разделение в Православии неизбежным. 11 октября 2018 года Священный Синод Константинопольского Патриархата принял целый ряд неканонических решений по украинскому вопросу. В частности, был «восстановлен» в сане бывший Киевский митрополит Филарет (Денисенко), который почти тридцать лет назад за учинение раскола и другие канонические преступления был извержен из сана Архиерейским Собором Русской Православной Церкви, а позднее и отлучен от Церкви. Низложение Филарета с самого начала неизменно признавалось всеми Поместными Православными Церквами, в том числе Константинопольской Церковью. На том же заседании был «восстановлен» в архиерейском сане лидер другой раскольнической структуры на Украине Макарий Малетич, который на самом деле и не имел канонической хиротонии. Этот человек покинул каноническую Церковь в сане протоиерея и был «рукоположен» во «епископа» уже в расколе.