В 1995 году Государственная Дума РФ приняла постановление об обращении в Конституционный Суд для получения заключения о соответствии Постановления Президиума Верховного Совета РСФСР 1948 года Конституции Российской Федерации. Позиция Государственной Думы состояла в утверждении их непротиворечивости.
В 1996 году в связи с принятием Государственной Думой Федерального закона «О прекращении раздела Черноморского флота», поддержанного Советом Федерации, было представлено обращение к парламенту Украины, в котором заявлялось о российском статусе Севастополя. На уровне Совета Федерации по инициативе Ю.М. Лужкова было принято постановление о создании комиссии «по подготовке вопроса о правовом статусе города Севастополя».
Однако действия российских законодательных органов в 1990-е годы блокировались позицией МИД РФ. Его руководство придерживалось позиции о необходимости уступки Украине, признанию украинской принадлежности Севастополя. Эта позиция была публично озвучена следующим образом: «Ссылки на указы 40-х годов… не имеют под собой никакого правового основания….Наша задача — не заниматься казуистикой и не вынимать документы 40-х, 50-х годов». Заключенный в 1997 году российско-украинский договор «О дружбе, сотрудничестве и партнерстве» заявлял о нерушимости существующих между Россией и Украиной границ. Подразумевалось, что Россия отказывается от претензий на Севастополь. Но то обстоятельство, что этот отказ не был непосредственно оговорен в предмете договора, оставлял российской стороне основания для оспаривания украинской юрисдикции. Отсутствовал соответствующий отказ от российской юрисдикции и в договоре 2010 года.
Запад в дискуссии по Севастополю поддерживал украинскую сторону. Еще в 1993 году в ответ на запрос Украины Совет Безопасности ООН осудил попытки Верховного Совета России обосновать российскую принадлежность Севастополя. Украина, оспаривая решение о вхождении Крыма и Севастополя в состав России, выступила с воззванием к государствам — гарантам Будапештского меморандума, состоявшего в отказе от ядерного оружия под гарантии неприкосновенности существующих границ Украины. Действительно, Будапештский меморандум предоставлял такие гарантии со стороны США, Великобритании и России. Однако в пункте 2 содержалась оговорка о возможности применения силы против Украины «в целях самообороны или каким-либо иным образом в соответствии с Уставом Организации Объединенных Наций». Нападение на российскую военную базу, а также на российских граждан предоставляет России такое право вмешательства.
Цивилизационное самовосстановление
Эскалация политического кризиса на Украине в конце 2013 — начале 2014 года вновь поставила вопрос о государственной принадлежности Крыма. Процесс был инициирован с двух сторон: во-первых, вновь активизировались пророссийские настроения большинства крымчан; во-вторых, новая политическая элита Украины в националистическом угаре начала очередной виток русофобской политики. Это выразилось, в частности, в лишении русского языка статуса государственного. Данное решение предопределило последующие события на территории Крыма. Кроме того, в условиях политической нестабильности националистические активисты крымских татар провозглашали открыто русофобские лозунги и угрожали русскому населению Крыма физической расправой. Группы националистов с Украины собирали силы для вторжения на полуостров, что было предотвращено лишь своевременным сбором крымского народного ополчения и выставлением блок-постов. Обсуждалась перспектива превращения Крыма в «непотопляемый авианосец» НАТО.
В этих условиях 23–24 февраля под давлением пророс-сийских активистов была осуществлена смена исполнительных органов власти Севастополя. Тремя днями позже, 27 февраля, депутаты Верховного Совета АР Крым, собравшиеся в здании парламента, приняли решение о проведении общекрымского референдума о расширении автономии полуострова в составе Украины. Новое правительство Крыма возглавил лидер партии «Русское единство» Сергей Аксенов, заявивший о непризнании нового руководства Украины и обратившийся к руководству России за «содействием в обеспечении мира и спокойствия на территории Автономной Республики Крым».
1 марта Совет Федерации РФ удовлетворил обращение президента Владимира Путина о разрешении на использование российских войск на территории Украины. Отрядами добровольцев и российскими военнослужащими были блокированы все объекты и воинские части ВС Украины на территории полуострова, командование которых отказалось подчиниться правительству Крыма. 16 марта был проведен референдум о статусе Крыма, на основании результатов которого была провозглашена независимая Республика Крым, подписавшая с Россией договор о вхождении в состав РФ. На референдуме в поддержку вхождения Крыма в состав России высказались 96,8 % населения. Столь высокий процент позволяет говорить о фактической легитимности совершившегося события. В составе России возникли два новых субъекта Федерации: Автономная республика Крым (столица — Симферополь) и город федерального значения Севастополь.