Руководить таким сложным научным коллективом для Сатпаева было ново. Хорошо, что и прежде он не замыкался в рамках своей специальности, стремился быть человеком разносторонне подготовленным, всегда интересовался историей, художественной литературой, театром. Иначе ему пришлось бы еще труднее.
Нужно было сочетать работу и по долговременным проблемам организации науки в Казахстане, и по выполнению учеными каждодневных задач, чаще всего связанных с нуждами военного времени.
Ему оставались буквально крохи времени на личную научную работу. Он старался использовать их особенно целеустремленно. Конечно, в его сферу входило научно-методическое руководство Джезказганской геологоразведочной экспедицией. Ведь под монографией «Рудные месторождения Джезказганского района» стояла дата: 1941 год. Противники его гипотезы гидротермального происхождения медного пояса нет-нет да и подымали голос, отстаивая свою осадочную версию. Надо было им отвечать, вооружаясь новыми фактами.
Большую, научную поддержку Сатпаев оказывал молодым ученым. Вот книга Герасимова — «Современные проблемы геоморфологии Казахстана», лекции для аспирантов, прочитанные в Алма-Ате весною 1943 года. Обстоятельное предисловие к лекциям написал Каныш Имантаевич. Следует прибавить и многочисленные доклады, покоряющие ясностью анализа и логической стройностью.
— Когда же он писал? — спросил я Таисию Алексеевну.
— Все спали, а Каныш работал, — отвечала она.
В годы Отечественной войны Каныш Имантаевич еще энергичнее, чем в джезказганские годы, сотрудничал в печати, выступал по казахскому радио. По всей стране прозвучала его пламенная речь на антифашистском митинге представителей народов Советского Востока в Ташкенте.
Предисловие Каныша Имантаевича в книжке Яновского-Максимова «Опыт стахановцев-горняков Лениногорска» обобщало достижения новаторов производства Хайдина, Тайжанова и других работников свинцово-цинкового комбината, возглавлявшегося тогда инженером Динмухамедом Ахмедовичем Кунаевым.
4 мая 1945 года в «Казахстанской правде» была опубликована статья Каныша Имантаевича «Подлинная весна человечества». Вместе со всеми он чувствовал, что враг повержен и считанные дни отделяют нас от последнего выстрела на фронте.
9 мая в Алма-Ате, как и повсюду, было днем всеобщего ликования, безмерной радости. В новой статье — «Народ-исполин, народ-богатырь» — Каныш Имантаевич поделился своими чувствами с соотечественниками, с воинами Советской Армии.
Город в мае омывали грозовые ливни, блестела на солнце молодая листва, запахи сирени и яблоневого цвета кружили голову.
Когда Сатпаев приходил в свой кабинет, его уже дожидалась пачка поздравительных писем и телеграмм.
— С победой, дорогой Каныш Имантаевич! — писали джезказганцы. — Приезжайте в Джезказган. Поставим юрту в предгорьях Улутау, будет свежий кумыс, молодая баранина. Поживите у нас, отдохните от забот.
Да разве в одном этом письме приглашали его на отдых. Разве из Баянаула не писали, что он, награжденный как воин и орденом Ленина и орденом Отечественной войны, теперь получил право отбросить хоть на несколько дней все заботы.
Он вспоминал тихие озера и спокойные светлые реки, вспоминал друзей, проводы на берегу Джезды, путь в Алма-Ату.
Четыре года прошли, как один. Какое это неповторимое и всеобъемлющее слово — Победа!
Что же, если сказать самому себе по совести, он действительно поработал неплохо. Но время ли подводить итоги, время ли вспоминать? Время ли ставить юрту для отдыха? Нет, сейчас он не может уйти от дел даже на месяц. Впереди — завершение организации Академии наук, самая трудная работа.
Сохранился проект письма заместителю Председателя Совета Народных Комиссаров Союза ССР, написанный рукой Сатпаева.
«Советский Казахстан, — сказано, в частности, в письме, — имеет сейчас многотысячные кадры казахской интеллигенции, высоко поднявшие культуру своего народа. Фактическим центром науки в Казахстане стал Казахский филиал Академии наук СССР, созданный в 1932 году и особенно интенсивно развернувший свои научно-исследовательские работы в годы Отечественной войны. В научно-исследовательских институтах Казахского филиала работают свыше 40 докторов и профессоров и более 100 кандидатов наук и доцентов. Достижения Казахской ССР в развитии экономики и культуры позволяют высказать мысль о том, что казахский народ имеет достаточные предпосылки ознаменовать приближающийся 25-летний юбилей Советского Казахстана организацией Академии наук Казахской ССР».