Население национальных окраин Российской империи, в том числе и население Туркестана, в меньшей мере страдало от рекрутской повинности, чем остальные российские подданные. В рекруты и на длительный срок забирали главным образом православных подданных: русских, украинцев, белорусов. Кроме того, представители неправославных народов, прежде всего городские купцы и мещане, пребывали в более выгодных экономических и юридических условиях, обладая определенной хозяйственной самостоятельностью и некоторыми личными правами. Но царское правительство изыскивало возможности ущемлять интересы среднеазиатского населения, что вызывало увеличение недовольства царем и царским правительством. Неудивительно, что в 1916 г. произошло Среднеазиатское восстание (см. текст далее).
Иногда кое-что в мирных интересах своих среднеазиатских подданных неспешно творили незначительные, но добрые дела русские цари. В 1868 г. при императоре Александре II, во время землетрясения в Ташкенте сильно разрушилась мечеть Джами (XV в.), в оставшиеся 13 лет его царствования мечеть так и не восстановили; только на седьмом году царствования нового императора Александра III, в 1888 г. эту мечеть восстановили (после ее 20-летнего пребывания в полуразрушенном виде) на средства, пожертвованные лично Александром III, который уважал религиозные чувства и потребности всех своих подданных, в том числе и мусульман. В 1903 г. император Николай II подарил ташкентскому женскому Свято-Троицкому монастырю участок земли в 524 га в 25 км от Ташкента. Когда в 1912 г. заканчивали строительство нового дворца Нуруллабая, то Николай II подарил Хиве для этого дворца хрустальные люстры. Николай II первым из русских царей при последних бухарских амирах Абдуллахаде (правил в 1885–1910 гг.) и Алим-хане (правил в 1919–1920 гг.) намечал свой визит в Туркменистан и прежде всего – в Ташкент, но революционные беспорядки в Центральной России не позволили ему покинуть Петербург и приехать в Среднюю Азию.
Присоединение Туркестана (Туркестанского края) к Российской империи способствовало расширению изучения природы, природно-ресурсного потенциала этих мест. К середине XIX в. мало было известно о наличии полезных ископаемых на узбекских землях. Природные богатства оставались слабо исследованными и почти не использовались. Добывалась только нефть, да и то в минимальных размерах (1913 г. – 13 тыс. т). Русские ученые и путешественники начали собирать и обобщать материалы о природе Средней Азии. Особенно много в этом плане сделали А.П. Федченко (1844–1873 гг., путешествовал по Средней Азии в 1868–1871 гг.), П.П. Семенов Тян-Шанский (1827–1914 гг., инициатор ряда экспедиций в Азию, А.Н. Северцов (1827–1885 гг., в 1857–1879 гг. исследовал Среднюю Азию), создал труды по зоогеографическому районированию и птицам Туркестана), И.В. Мушкетов (1850–1902 гг.), дал геологическое и орографическое описание Средней Азии, предложил первую схему ее геологического строения, в 1881 г. совместно с Г.Д. Романовским составил первую геологическую карту Туркестана, труды «Туркестан» – 1886–1906 гг., «Физическая геология» – 1888–1891 гг.), А.Н. Краснов (1862–1914) и некоторые другие.
П.П. Семенов Тян-Шанский
Присоединенные к России среднеазиатские территории стали сырьевым придатком России, на них начался процесс капитализации хозяйств. Русский капитализм вовлек Узбекистан и его экономику в общероссийскую систему хозяйства, что дало толчок развитию в Узбекистане капиталистических отношений. В Туркестан по распоряжениям свыше приехали военные, чиновники, казацкие переселенцы. В Среднюю Азию поехали купцы и их приказчики, начался процесс создания среднеазиатских филиалов купеческих контор. Российским предпринимателям были созданы условия наибольшего благоприятствования в хозяйственных делах в Средней Азии. В Средней Азии начали не только масштабно направлять сырье в Россию, но и добывать нефть. Резко увеличилась площадь посевов хлопка и производство хлопкосырья. Процесс проникновения русских на новые среднеазиатские российские земли особенно усилился после строительства Закаспийской и Оренбургской (1906) железных дорог, а также после революционных беспорядков 1905–1907 гг. и Столыпинской аграрной реформы (буржуазная реформа крестьянского надельного землевладения, означавшая переворот в аграрной политике империи, названа по имени руководителя этой реформы министра внутренних дел и председателя Совета министров с 1906 г. П.А. Столыпина, 1862–1911 гг.). При этом нужно отметить, что переселенцы в Среднюю Азию – в основном русские и украинцы – оседали в районах Туркестанского генерал-губернаторства и меньше – в вассальных ханствах. В 1917 г. Узбекистан оставался заброшенной окраиной Российской империи, был краем со слаборазвитой ремесленно-кустарной промышленностью. В нем небольшие фабрики и заводики вели первичную обработку сельскохозяйственного сырья, в основном – хлопка.