После переворота в России осенью 1917 г. и особенно после включения Кокандской автономии в состав РСФСР (декабрь 1917 г.), в Средней Азии появились и усилились принципиальные новации, во многом не понятные местным жителям, противоречащие правилам ислама, что чаще всего вызывало протест среди верующих мусульман. Например, с 1917 г. существовало юридическое равноправие мужчин и женщин, в 1921 г. в Узбекистане запретили многоженство и выкуп за невесту (калым), с 1920-х гг. женщин обязали в общественных местах снимать паранджу (мусульманская женская верхняя одежда, представляющая собой халат с ложными рукавами, покрывающий женщину с головой, носится с чачваном – черной густой сеткой из конского волоса, закрывающей лицо; ношение паранджи соответствует нормам ислама). Началась масштабная антирелигиозная кампания, стали высмеивать и унижать имя Аллаха (а мусульмане веками привыкли все делать во имя Аллаха и прославления его имени), происходило массовое закрытие мечетей и медресе, преследованиям подвергались служители мусульманского культа – муллы, имамы, муфтии и др., власти творили препятствия традиционному празднованию мусульманских праздников и сохранению мусульманских религиозных традиций. Все это и многое другое было неприемлемым для большинства жителей Узбекистана, основная масса которых оставалась правоверными мусульманами. Но наряду с этим открывали бесплатные школы для детей и взрослых, бесплатные простейшие медицинские лечебные учреждения; однако в них врачами, медицинскими сестрами, акушерами были мужчины и женщины, а мусульманские правила требуют, чтобы только женщины в медицинском плане помогали мусульманкам. Очень многие узбекистанцы встретили в штыки бóльшую часть нововведений, а другую их часть приняли с опаской и не поверили в их действенность и полезность им. В результате часть наиболее активных, решительных мужчин-мусульман стала объединяться в группы, оказывавшие противодействие новой власти и ее новациям, стала способствовать ослаблению и свержению неугодной им власти.
После начала введения советских новаций, разгрома Кокандской автономии и ее включения в РСФСР, в Ферганской долине началась гражданская война. Началось кровопролитное противостояние мусульман – басмачей и «иноверных», т. е. немусульман, – большевиков, коммунистов, интернационалистов, врагов низверженного царизма и местных среднеазиатских властей и олигархов того времени. Ряды басмачей были неоднородными (см. текст ранее), среди них были: 1) сторонники восстановления независимости мусульманских государственных образований (что противоречило интересам коммунистов, задачей которых была ликвидация таких государств); 2) сторонники непримиримого джихада – борьбы с неверными («священная война», предписание ислама, предусматривающее его распространение и утверждение любыми методами среди иноверцев, «священная война» мусульман против иноверцев); 3) обыкновенные разбойники, видевшие в грабежах и насилии средство для существования. Басмачество, как уже отмечалось ранее, представляло собой в основном националистическое движение, главным образом феодально-байских элементов, мусульманского духовенства, других недовольных советским режимом людей. Главной целью басмачества было недопущение установления советской власти в Средней Азии. Басмачество поддерживалось иностранными империалистическими странами. При всех противоречиях и сложностях существования Узбекистана в первые годы советской власти удалось в 1922 г. разгромить основные силы басмачества и окончательно ликвидировать его в начале 1930-х гг.
Как и в России, в Узбекистане неверной оказалась политика по отношению к состоятельным, преуспевающим крестьянам, их называли в Узбекистане баями (в России – кулаками); во второй половине 1920-х гг. у баев отобрали «излишки» земли, которые передали создаваемым и созданным колхозам и совхозам. В 1920—1930-е гг. провели решительную массовую и повсеместную индустриализацию, что было сопряжено со многими сложностями и непредсказуемыми последствиями, ведь до 1917 г. узбекский край был преимущественно аграрным. На созданных новых промышленных предприятиях резко не хватало квалифицированных рабочих рук, по властной указке коммунистического руководства СССР в Узбекистан из разных частей СССР переехали добровольно и не совсем добровольно квалифицированные кадры в разных профессиональных сферах.
В первые годы советской власти была проведена земельно-водная реформа. Проведенная с большими ошибками коллективизация сельского хозяйства, носившая часто насильственный и еще несвоевременный характер, все-таки способствовала окончательному уничтожению докапиталистических феодально-патриархальных отношений в кишлаках. В большой мере отошли на второй план внутренние этнографические различия между отдельными группами населения, в основном произошло разрушение замкнутости некоторых родов и племен.