1 декабря 1918 г. местные советы и их исполкомы, казалось бы, могли праздновать победу: руководство ВЧК подписало, правда, в «окончательно проредактированном»[835] (т.е. исправленном) виде, утверждённую 2-й Всероссийской конференцией чрезвычайных комиссий «Инструкцию о чрезвычайных комиссиях на местах», в которой, в т.ч., была прописана организационно-штатная структура губернских и уездных ЧК, окружных транспортных органов, железнодорожных отделений и пограничных отделов ЧК[836]. В «Инструкции…», казалось бы, признавалось, что местные чрезвычайные комиссии будут находиться на равном двойном подчинении: местным советам и их исполкомам, с одной стороны, и ВЧК — с другой[837]. Более того, признавалось, что председатели и заместители председателей местных ЧК будут назначаться местными исполкомами и только утверждаться Всероссийской ЧК[838], а кредиты на отряды при комиссии будут отпускаться «в общем сметном порядке» через местные исполкомы[839]. Однако два параграфа ставили двойное подчинение под большое сомнение: «Постановления местных ЧК могут быть приостановлены и отменены чрезвычайными комиссиями высших инстанций»[840]; «Все ассигнования ЧК получают через свои исполкомы от ВЧК»[841]. Таким образом, вопрос в полном объёме решён не был, серьёзные конфликты чекистов с руководством местных советов продолжались, и у руководства ВЧК оставался шанс на реванш.