В послевоенные годы А. И. Молодчий окончил Военную академию Генерального штаба Вооруженных Сил СССР. Свои знания, огромный боевой и летный опыт передает молодым летчикам, способствуя укреплению боеготовности, освоению современной авиационной техники.
В 1965 году дважды Герой Советского Союза генерал-лейтенант авиации А. И. Молодчий ушел в запас по болезни.