Тем не менее, методы хранения ex situ зависят от деятельности человека и от бесперебойного функционирования природоохранных объектов и сооружений.
Наконец, гербарии (см. главу 4) – первый метод консервации видов растений (шестнадцатый век) – и коллекции в спирте необходимы, особенно для проведения таксономических исследований.
Хотя экономические затраты на поддержание коллекций связаны с количеством хранимых образцов, вопрос о количестве особей, представляющих разнообразие и обеспечивающих безопасность образцов, имеет решающее значение. Принцип «основной коллекции» может дать ответ. Нуаро с коллегами разработали метод создания основной коллекции на основе количественных данных (Noirot et al., 1996). Этот метод (оценка основных компонентов) направлен на включение максимального разнообразия из базовой коллекции в выборку минимального размера, избегая при этом дублирования.
Что касается генетических ресурсов растений, каждая система хранения имеет свои преимущества и недостатки, и часто только сочетание этих различных систем позволяет оптимизировать и обеспечить сохранность ресурсов.
Помимо количественного аспекта (количество хранимых видов и образцов), в настоящее время, качество данных и исследовательских программ, связанных с ресурсами, является ключевым элементом при обосновании материальных и человеческих инвестиций. Ценность и точность этих данных также способствуют развитию ресурсов.
Генофонд Vanilla
Род Vanilla, относящийся к семейству орхидей, включает 90–100 видов в зависимости от автора (Bory et al., 2008c). Большинство этих видов дикорастущие; только два из них, V. planifolia и V. tahitensis, выращиваются для производства товарной ванили, при этом V. planifolia обеспечивает 95% мирового производства. Таксономия ванили очень старая, неполная и все еще неточная (Portères, 1954; Rolfe, 1896; см. главу 1). Следовательно, её необходимо тщательно пересмотреть, особенно в свете результатов недавних молекулярно-генетических и цитогенетических исследований (Bory et al., 2008a, 2008b; Cameron, 2003, 2009; Schluter et al., 2007; Soto Arenas, 2003; Verma et al., 2009). Например, несколько недавних исследований происхождения V. tahitensis предполагают, что этот вид является результатом скрещивания V. planifolia и V. odorata (Besse et al., 2004; Bory et al., 2008d; Lubinsky et al., 2008b).
Виды рода Vanilla в основном встречаются в естественной среде обитания в тропических и субтропических регионах американского, африканского и азиатского континентов. Большинству из видов угрожает разрушение их первоначальной среды обитания, которое усугубляется изменением климата. Вид V. planifolia находится под особой угрозой исчезновения, поскольку основной генофонд в регионе его происхождения (южная Мексика) подвергается значительному давлению, связанному с обезлесением и чрезмерной эксплуатацией природных ресурсов (Soto Arenas, 1999). Во вторичных зонах диверсификации, таких как острова Индийского океана и особенно Реюньон – точка входа вида в этот регион в девятнадцатом веке – наблюдается значительная внутривидовая однородность, что указывает на то, что культивирование может опираться на очень ограниченную генетическую основу и, вероятно, развилось от одной особи путем вегетативного размножения. Молекулярные исследования подтвердили очень низкий уровень генетического разнообразия растений ванили (V. planifolia), культивируемых во всем мире (Bory et al., 2008d; Lubinsky et al., 2008a; Minoo et al., 2008a). Процесс вегетативного размножения, преобладающий у выращиваемых видов ванили, не позволяет поддерживать и расширять генофонд. Тем не менее наблюдается интересное фенотипическое разнообразие, которое можно объяснить накоплением соматических мутаций, возможностью естественного прорастания семян в случае полового размножения, а также вариабельным уровнем плоидности, который можно найти у культурных видов ванили (см. главу 2). Однако, из-за сортовой однородности, выращивание ванили особенно уязвимо для экологических опасностей, таких как изменение климата и появление вредителей растений.