Вскоре правительство приобрело развитую организационную структуру, которая почти дублировала довоенную: девять министерств, ряд бюро, комиссий и комитетов. Новыми были Комиссия по делам сентября 1939г. и уже упоминавшийся Комитет по делам края (Польши) под председательством генерала Соснковского. В его состав входили два министра правительства и два члена Рады Народовой. Рада Народова тоже была органом, не предусмотренным Конституцией. РН (Национальный совет Польской Республики) была совещательным органом при президенте и премьер-министре. Председателем первого созыва РН был композитор и политик И. Падеревский, председателем второго созыва Рады Народовой стал С. Грабский из Стронництва народового. Новыми персонами в правящей структуре были уполномоченные правительства— делегаты для Франции, для польских дел на Востоке и делегат на Край (Польшу). Последний становился все более важным лицом, с 1944г. стал считаться вице-премьером правительства с подчиненными четырьмя министрами— представителями всех партий «лондонского лагеря». (После поражения Франции правительство обосновалось в Великобритании, в связи с чем получило свое неофициальное наименование.) Делегат формировал свою подпольную гражданскую администрацию, получившую впоследствии наименование подпольного государства.
Первые декреты правительства возвратили политические и гражданские права представителям оппозиции, осужденным на Брестском процессе 1931—1932 гг. (в основном деятелям людовского и социалистического движения). Декларировалось привлечение к ответственности виновников сентябрьского поражения Польши, как из государственной администрации, так и из руководства армии, вплоть до офицеров, бросивших свои частина произвол судьбы.
В декабре 1939 г. была обнародована правительственная программа послевоенного устройства Польши. Правительство выступало за парламентарную систему в той форме, которая существовала до переворота Пилсудского в 1926 г., за восстановление восточной границы, существовавшей до 17 сентября 1939 г. В области социально-экономической провозглашались принцип социальной справедливости, право всех на труд «с особым учетом прав трудящихся масс на землю и рабочее место». В области внешней политики выдвигалась идея федерации государств Центральной и Восточной Европы.
Положения об участии в войне были более конкретными. Правительство считало своей первейшей обязанностью освобождение земель Речи Посполитой от оккупации путем самого активного участия Польши и ее армии в войне и обеспечение, наряду с непосредственным и широким доступом к морю, границ, дающих гарантию прочной безопасности. Подтверждался союз с Францией и Великобританией. Он должен был основываться на принципах полного государственного равноправия, тесного взаимодействия как в области ведения войны, так и определения ее целей. (Ничего подобного правительство Сикорского у западных союзников не добилось.) Все усилия эмигрантского руководства были направлены на подготовку к захвату власти в момент освобождения страны англо-французскими (как оно надеялось) войсками. Правительство получило поддержку значительной части населения Польши. Действуя вне пределов оккупированной страны, оно могло выступать на международной арене от ее имени, заключать международные соглашения, например, о создании польской армии во Франции, а затем в Великобритании (польско-английское соглашение о взаимном сотрудничестве в политической и военной областях от18 июля 1940 г.), итем содействовать объединению сил поляков за границей на борьбу против германского фашизма.