Дальнейшее развитие стержневого корня — мощное суккулентное образование, часто превосходящее по размерам стебель растения и напоминающее по форме морковь (в литературе его называют реповидным или редьковидным). Как правило, он образует небольшое количество всасывающих корешков. Такой корень обычно многофункционален. Он, например, может изменяться в объеме, втягивая крошечный стебель растения в землю во время засухи. Хорошо известная в коллекциях Neochilenia napina образует на родине при диаметре стебля в несколько сантиметров корень массой до 50 кг, достигающий 60 см в поперечнике. Copiapoa megarhiza имеет корень толщиной 7–8 см и длиной до 25 см. Аналогичные корни характерны и для многих кактусов Мексики и США, маммиллярий, турбиникарпусов, ариокарпусов, лофофор, педиокактусов и многих других. Roseocactus kotschoubeyanus, Neogomesia agavoides фактически представляют собой корень, «прикрытый» сверху небольшим стеблем. На фотографиях растений, снятых в местах произрастания в сухой период года, роузокактус Кочубея можно обнаружить только благодаря правильным линиям на поверхности почвы, образованным стеблем, который почти полностью скрыт в глинистой земле. Очевидцы, наблюдавшие крошечные крупноцветковые маммиллярии, сообщают, что во время засухи кактус втягивается под землю, и растение впоследствии обнаруживается в углублении только по торчащему цветку. Кроме маленьких «крокусов» таким же образом прячутся в земле и некоторые высокогорные крошечные растения из Боливии и другие кактусы.
У некоторых растений преобладающей функцией такого корня является накапливание питательных веществ и влаги, которая поглощается преимущественно колючками. Видимо, это характерно для кактусов пояса туманов в Чили и Перу, где растения практически не видят дождя, но находятся в условиях высокой влажности и в туманное время полностью покрываются капельками воды.
У некоторых кактусов встречается клубневидный корень, соединенный со стеблем утонченной шейкой. Такой корень образуют некоторые вейнгартии и другие растения. Ф. Буксбаум даже выделил отдельный род по этому признаку — Gymnocactus subterraneus (Rapicactus subterraneus (Bckbg.) Buxb, et Oehme).
Отличительной особенностью некоторых кактусов является способность образовывать в зависимости от структуры почвы и других условий разные типы корней. Такое явление наблюдается у некоторых маммиллярий и лобивий.
Стебли кактусов покрыты колючками, щетинками, пухом, которые появляются из особых органов — ареол. Ареолы — наиболее специфическая особенность кактусов. Они представляют собой видоизмененные почки и размещаются на стебле, ребрах или сосочках. У маммилляриевых ареола разделена. Одна часть располагается в пазухе (аксилле), другая на кончике сосочка. Из аксиллы вырастают цветки, отростки и часто пух и щетинки. У некоторых растений этой группы кактусов при образовании колючек точка роста ареолы делится и из бороздки, возникшей между частями ареолы, появляются бутоны.
Цветы могут образовывать как молодые, верхушечные, так и старые ареолы. У ребюций, например, бутоны часто можно видеть у самого основания стебля.
У кактусов некоторых родов отмечены случаи, когда одна ареола давала несколько цветков (Rhipsalis, Neoporteria и др.). Это связано с последовательным делением ареолы на несколько частей без расчленения ее точки роста.
У многих видов кактусов (Eriocereus, Cleistocactus и др.) старые ареолы долгое время остаются активными и образуют новые колючки и отростки.
Свойство ареол образовывать новую ткань используется в любительской практике при размножении редких растений. Ареолу с кусочком ткани можно укоренить или привить и получить из нее отросток.
Колючки кактусов, прямые и изогнутые, крючковатые, игольчатые и шиловидные, пектинатные (гребенчатые) и волосистые, шерстистые и перистые, плоские и граненые, овальные и круглые в срезе, появились в результате длительной адаптации растений к различным условиям. (У некоторых кактусов, например у Astrophytum asterias, они отсутствуют). Исключительно разнообразные по форме и цвету, колючки конденсируют и поглощают влагу из воздуха, уменьшают испарение воды через кожицу, предохраняют стебель от ожогов и холода, защищают кактусы от животных и даже способствуют размножению. Они образуются из точки роста ареолы. Ювенильные (детские) колючки сеянцев, мягкие и часто интенсивно окрашенные, значительно отличаются от взрослых. Концы их быстро твердеют, а растущее основание некоторое время остается мягким. Точка роста ареолы после образования колючек становится жесткой и у кактусов некоторых родов затвердевает настолько, что колючки можно отделить с большим трудом. У других растений они сравнительно легко отпадают, а у цилиндропунций, например, находятся в своеобразном без усилия отделяющемся чехлике.