9 марта командование 17-й А, стремясь к дальнейшему сокращению линии фронта и опасаясь удара нависших над ее левым флангом войск 58-й А, стало отводить свои части на новый оборонительный рубеж, получивший наименование «Голубая линия». Он проходил между ранее намеченными позициями «Средний Готенкопф» и «Малый Готенкопф», на флангах выходил на мощные оборонительные узлы, созданные в районах Новороссийска и Темрюка, а в центре – на р. Протоку, представляющую собой достаточно серьезную преграду. «Голубая линия» сооружалась в течение нескольких недель. Ко времени выхода к оборонительному рубежу сов. войск он состоял из двух позиций. Первая имела глубину 1–1,5 км и была оборудована 2–3 траншеями, прикрытыми сплошной полосой проволочных и минных заграждений. За ней проходила вторая, включавшая несколько траншей и подготовленные к круговой обороне населенные пункты. В глубине все доступные для наступления направления и дефиле перекрывались узлами сопротивления и отдельными опорными пунктами.
Войска Северо-Кавказского фронта предприняли попытку с ходу прорвать «Голубую линию», но успеха не добились. Они были измотаны боями, испытывали острый недостаток боеприпасов, горючего, продовольствия. Танковые части фронта из-за отсутствия горючего в течение 10–15 суток не могли не только вести бои, но даже совершить марш к войскам, с которыми они должны были действовать. По этой же причине оказалась прикованной к аэродромам авиация.
Исходя из анализа обстановки и состояния войск командование фронта обратилось в Ставку за разрешением временно прекратить наступление и в течение 10–12 дней подготовить новую наступательную операцию. Предлагалось также расформировать полевое управление Черноморск. группы, а ее командующего генерала И.Е. Петрова назначить начальником штаба фронта. 16 марта Ставка утвердила эти предложения и приказала начать наступление в первых числах апреля, чтобы предоставить войскам больше времени на подготовку. На этом Краснодарская наступательная операция завершилась.
Войскам Северо-Кавказского фронта вновь не удалось выполнить поставленную задачу – окружить северокавказскую группировку противника. Это обусловливалось слабым управлением войсками со стороны командования фронтом и армиями, плохим снабжением наступавших частей и соединений всеми видами материальных средств, тяжелыми погодными условиями. Не сумев окружить всю северокавказскую группировку врага, советские войска теперь должны были уничтожить его силы на Таманском п-ве.
Немецкое командование придавало удержанию Таманского полуострова большое значение. 10 марта 1943 на совещание в ставку Гитлера были вызваны командующий группой армий «А» Э. Клейст, командующий 17-й А генерал р. Руофф и командующий 4-м воздушным флотом генерал В. Рихтгофен. При обсуждении планов на 1943 Гитлер заявил: «…желательно, чтобы Новороссийск был удержан нами и включен в состав Таманского плацдарма, с одной стороны, из соображений политического влияния на тюрков и, с другой – в целях удержания русского Черноморского флота вдали от Крыма». 13 марта группа армий «А» получила приказ Гитлера «удержать во что бы то ни стало Таманский плацдарм и Крым».
Выполняя его, командование 17-й А предприняло интенсивные меры по укреплению «Голубой линии». Ее общая глубина увеличилась до 20–25 км. Главная полоса глубиной 5–7 км включала 3–4 позиции, прикрывалась минными полями (на отдельных участках до 2500 мин на 1 км фронта) и 3–6 рядами проволочных заграждений. В 10–15 км от главной находилась вторая полоса. Обе полосы были насыщены дотами, дзотами и пулеметными площадками, соединенными сетью траншей и ходов сообщения. В глубине готовились еще 3 рубежа и отсечные позиции. Все господствующие высоты и населенные пункты, расположенные в их пределах, были превращены в опорные пункты и узлы сопротивления, приспособленные к круговой обороне.
Особенно сильно укреплялся Новороссийск: на подступах к нему с моря создавалась мощная противодесантная оборона, подходы к порту прикрывались минными заграждениями, огнем артиллерии, минометов и стрелкового оружия. На «Голубую линию» отводились все войска 17-й А. Весной и летом армии Северо-Кавказского фронта неоднократно пытались прорвать оборонительный рубеж противника, но успеха не добились. Это удалось сделать лишь в сентябре 1943.
В апреле-июне развернулись ожесточенные бои за господство в воздухе, получившие в отечественной литературе название «воздушные сражения на Кубани 1943 г.». К середине апреля немецкое командование сосредоточило на аэродромах Крыма и Тамани 820 самолетов 4-го воздушного флота, а также привлекло до 200 бомбардировщиков, базировавшихся в Донбассе и на юге Украины. В составе авиационной группировки были лучшие части люфтваффе, укомплектованные опытными летчиками и самолетами новой модификации. С советской стороны в сражениях принимала участие авиация Северо-Кавказского, частично Южного и Юго-Западного фронтов, Черноморск. флота и группа авиации дальнего действия – всего 1048 боевых самолетов, большинство которых также были новыми. Общее руководство их действиями осуществлял командующий ВВС Красной Армии маршал авиации А.А. Новиков, а непосредственное – командующий ВВС Северо-Кавказского фронта (с мая 1943 командующий 4-й воздушной А) генерал-лейтенант авиации К.А. Вершинин.