10 ноября 1941 на основании директивы Ставки ВГК от 10 ноября 1941 фронт был упразднен. 50-я армия вошла в состав Западного фронта, 3-я и 13-я – переданы Юго-Западному фронту. Полевое управление оставалось в распоряжении главнокомандующего войсками Юго-Западного направления.
Командующие: генерал-лейтенант Еременко А.И. (август-октябрь 1941); генерал-майор Петров М.П., врид (октябрь 1941); генерал-майор Захаров Г.Ф. (октябрь-ноябрь 1941).
Брянский фронт второго формирования образован 24 декабря 1941 на основании приказа Ставки ВГК от 18 декабря 1941 в целях развития наступления советских войск на орловско-брянском направлении и разгрома орловско-болховской группировки противника в составе 3,13-й армий из оперативной группы генерал-лейтенанта Ф.Я. Костенко и 61-й армии. В последующем в него входили 40, 48, 38-я армии, 2-я и 5-я танковые, 2-я и 15-я воздушные армии.
В декабре 1941 – феврале 1942 Брянский фронт провел наступательные операции на болховском и орловском направлениях, содействуя Западному фронту в нанесении поражения южному крылу войск немецкой группы армий «Центр». Летом и осенью войска Брянского фронта, прикрывая тульское и воронежское направления, отражали левым крылом во взаимодействии с Юго-Западным фронтом удары превосходящих сил противника. Несмотря на неудачи в этих боях, армии Брянского фронта, сочетая упорную оборону рубежей с нанесением контрударов, добились стабилизации положения в районе Воронежа.
8 июля 1942 в целях улучшения руководства войсками фронт был разделен на Брянский и Воронежский фронты.
Контрудары армий Брянского фронта в августе – сентябре оказали значительное влияние на оборонительные действия советских войск под Воронежем и Сталинградом. В начале 1943 войска Брянского фронта участвовали в Воронежско-Касторненской операции, в результате которой были разгромлены основные силы 2-й немецкой армии и 3-й армейский корпус венгерской 2-й армии. Преследуя отступавшего на курском направлении противника войска фронта вышли на рубеж Новосиль, Малоархангельск.
12 марта 1943 на основании директивы Ставки ВГК от 11 марта 1943 фронт упразднен. 61-я армия вошла в состав Западного фронта, 3, 13, 48-я – Центрального фронта, а 15-я воздушная армия и полевое управление фронта выведены в резерв Ставки ВГК.
С 13 по 28 марта 1943 полевое управление Брянского фронта именовалось последовательно управлением Резервного, Курского и Орловского фронтов.
Командующие: генерал-полковник Черевиченко Я.Т. (декабрь 1941 – апрель 1942); генерал-лейтенант Голиков Ф.И. (апрель-июль 1942); генерал-лейтенант Чибисов Н.Е. (июль 1942); генерал-лейтенант Рокоссовский К.К. (июль-сентябрь 1942); генерал-лейтенант, с января 1943 г. генерал-полковник Рейтер М.А. (сентябрь 1942 – март 1943).
Брянский фронт третьего формирования создан 28 марта 1943 на основании директивы Ставки ВГК от 28 марта 1943 в составе 3, 61 и 15-й воздушной армий. В последующем в него входили 63, 50, 11, 11-я гвардейская армии, 3-я гвардейская и 4-я танковые армии. В марте-июле 1943 войска фронта прикрывали орловско-тульское направление, в июле-августе участвовали в Орловской операции. Во взаимодействии с войсками левого крыла Западного и правого крыла Центрального фронтов разгромили 2-ю танковую армию и нанесли поражение 9-й армии противника, оборонявшим орловский выступ. 1 сентября – 3 октября фронт провел Брянскую операцию, в ходе которой в результате искусно нанесенного флангового удара разгромил группировку противника, оборонявшую Брянск. Преследуя его 9-ю армию, войска фронта в начале октября вышли на рубеж рек Сож и Проня и создали благоприятные условия для дальнейшего наступления на гомельском и бобруйском направлениях.
10 октября 1943 на основании директивы Ставки ВГК от 1 октября 1943 фронт упразднен. Его 3, 11, 50 и 63-я армии вошли в состав Центрального фронта. Полевое управление фронта обращено на формирование полевого управления Прибалтийского фронта, в который вошли 11-я гвардейская и 15-я воздушная армии Брянского фронта 3-го формирования.
Командующие: генерал-полковник Рейтер М.А. (март 1943 – июнь 1943); генерал-полковник Попов М.М. (июнь-октябрь 1943).
БУДАНОВА Екатерина Васильевна (1916–1943), Герой Российской Федерации (1993). Единственная женщина летчик-истребитель в годы войны. Ст. лейтенант, ком. звена 73-го гвард. истребит, авиаполка 6-й гвард. истребит, авиадивизии, совершила 256 успешных боевых вылетов, лично сбила 10 самолетов противника. Погибла в возд. бою 19 июля 1943.