Были расстреляны губернский военный комиссар, левый эсер Душин, комиссар труда Работнов, большевик Суворов и многие другие [15].
В первый же день восстания было арестовано свыше 200 человек. Известна судьбы 109 из них — они были заключены на баржу с дровами, получившую вскоре название «баржа смерти» [16]. С 6 до 18 июля — 12 дней — заключенным не давали никакой пищи. При попытке набрать из Волги воды караул открывал огонь.
С началом артиллерийской дуэли мятежников и красных отрядов баржу перевозили в места, по которым велся наиболее интенсивный огонь. Осколками снарядов трое арестованных были убиты, несколько ранены. Вынести тела погибших и похоронить конвоиры не позволили [17]. 16 июля мятежниками были вызваны по списку 22 человека из узников «баржи смерти» и расстреляны [18].
Красные отряды сумели полностью сорганизоваться лишь на третий день ярославского мятежа [19]. В то же самое время набирали силу и белые. Одним из первых своих приказов Перхуров объявил о призыве добровольцев, затем — об обязательной мобилизации мужского населения в свою «армию». Впоследствии полковник утверждал, что под его началом сконцентрировалось 6 тысяч штыков [20]. Современные исследователи на основании архивных данных приводят более скромные цифры — примерно две тысячи штыков, в основном из бывших офицеров [21].
С юга и юго–запада мятежников полукольцом охватывали советские войска. Решительных действий они не предпринимали, ожидая подкреплений. Но центральная власть в Москве запоздала с реальной оценкой происходящего, будучи занята подавлением мятежа левых эсеров.
Лишь 11 июля 1918 года, почти через неделю, Реввоенсовет Республики назначил командующим войсками Ярославского фронта участника Первой мировой войны, штабс–ротмистра (штабс–капитана) А. И. Геккера. К 12 июля численность красных войск у Ярославля довели до 2 тысяч [22]. Поддержку им оказывали три бронепоезда. У белых, удерживающих центр города, бронепоезд был один.
Но и с подходом подкреплений красные не способны были переломить ситуацию. Формально силы Перхурова и Советов были всего лишь равны, на практике же значительную часть прибывших в город «войск» составляли впервые взявшие в свои руки оружие рабочие. Средний и младший командный состав был безграмотен. Донесения красных командиров в Москву содержали такие фразы: «Командование войсками ужасно… Пришлите энергичных опытных руководителей…» Один из командиров писал, что «при энергичном действии командного состава можно было все ликвидировать в один день» [23].
Атака таких частей на закрепившегося в городе противника, войска которого состояли из профессиональных военных, имеющих немало пулеметов, была откровенным самоубийством.
Не предпринимали решительных действий и мятежники, ожидая подхода из Рыбинска Савинкова. Они закрепились в крупных зданиях, превратив их в долговременные оборонительные сооружения. Забегая вперед отметим, восстание в Рыбинске провалилось и подкреплений белые ждали напрасно, но в тот момент никто из белых об этом не знал.
Противостояние приняло позиционный характер. Белые через Волгу вели артиллерийский огонь по красным, красные отвечали артиллерийским обстрелом белых. В Ярославле бушевали пожары, деревянные строения горели, каменные здания были серьезно повреждены.
Преимущество в артиллерии было на стороне Советов. Фактор времени — тоже. 17 июля Перхуров поняв, что далее ждать помощи союзников бессмысленно, бросил свои войска и с группой офицеров на пароходе прорвался по Волге из осажденного города. «Главноначальствующий» перебрался сначала в Кострому, затем в Казань.
Брошенные руководством белые еще несколько дней продолжали сопротивление. 20 июля красное командование издало следующий приказ: «Чрезвычайный штаб Ярославского фронта объявляет населению города Ярославля: Всем, кому дорога жизнь, предлагается в течение 24 часов, со дня объявления сего, оставить город и выйти к Американскому мосту. Оставшиеся после указанного срока в городе будут считаться сторонниками мятежников. По истечению 24 часов пощады никому не будет, по городу будет открыт самый беспощадный, ураганный артиллерийский огонь из тяжелых орудий, а также химическими снарядами. Все оставшиеся погибнут под развалинами города вместе с мятежниками, с предателями, врагами революции рабочих и беднейших крестьян» [24].