Как и положено сыну банкира, Джон начал работать в 1857 году в филиале Нью-Йоркского банка «Данкан, Шерман и Ко» в Лондоне, где прослужил четыре года. В это же время он пробует свои силы в торговле ценными бумагами, но первая сделка с акциями пароходной компании принесла ему убыток в 1500 долларов. Неудача не остановила Джона. На заемные средства (их дал отец) Морган покупает акции железной дороги Мичигана и продает их через месяц, получив 100 % прибыли.
Джон Пирпонт Морган I
В 1861 году Джон встретил дочь железнодорожного магната Амелию Старджесс. Ее большие голубые глаза пленили начинающего финансиста, и они поженились. Недолго радовались молодожены семейной жизни — через год Амелия умерла от туберкулеза. Морган решился на второй брак не сразу. Только в 1865 году он вновь женится. Его избранницей становится Френсис Луиз Трейси, и в браке рождается четверо детей: Луиза, Джек, Джульетт и Энн. Но он не любит жену, и со временем его миллионы притягивают многочисленных любовниц.
С началом Гражданской войны Джон Морган активно торгует оружием, и делает это не всегда чисто. Его спекуляциями позднее заинтересуется Конгресс, но санкций не последует — Джон воспользуется обширными связями в Вашингтоне и заплатит 300 долларов штрафа.
В 1871 году Морган становится партнером в финансовой компании «Дрексел, Морган и Ко», а после кончины в 1893 году Энтони Дрексела станет полноправным ее владельцем. Контора реорганизуется в банкирский дом, в состав которого входят банки Филадельфии, Парижа и Лондона. К концу XIX века банкирский дом Моргана занимает первое место в мире по объемам капитала. За относительно короткий период времени Джон Морган посредством своего банка участвует создании знаменитых промышленных компаний США: «Ю. Эс. Стил корпорейшн», «Дженерал Электрик», «Америкэн Телефон энд Телеграф», Вестингхауз электрик корпрейшн» и некоторых других. Друзья и враги называли его Юпитером — в честь бога неба и дневного света, отца всех богов. Слияния и скупка компаний становятся фирменным стилем Д.П. Моргана. Этому дают даже название — морганизация. В 1900 году Морган предложил Э. Карнеги приобрести его сталеплавильный бизнес. Карнеги согласился отдать его за 487 миллионов долларов. В начале следующего года в США появилась первая в мире компания с капитализацией более одного миллиарда долларов — U.S. Steel Corporation. Подвергся морганизации и бизнес знаменитого Т. Эдисона — изобретателя лампы накаливания. В результате объединения с конкурирующей фирмой возник гигант General Electric. Заодно Морган провел уличное освещение по Манхэттену.
Успеху Моргана сопутствовал и общий подъем промышленного производства. Капитализация всех акций и облигаций с 1890 по 1915 год увеличилось в США с 200 миллионов до 20 миллиардов. Огромными темпами строились железные дороги, шахты и рудники, заводы и фабрики. В такой ситуации деньги Джона Моргана, и таких как он финансистов с Уолл-Стрит, стали как кровь для кровеносной системы американской тяжелой индустрии.
Как и большинство финансовых магнатов, он собирает произведения искусства, книги, да и вообще ценные вещи, как, например, редкие камни. Но и это не все, Морган слыл заядлым яхтсменом и владел несколькими дорогими яхтами. Его коллекции уникальных книг хватило на целую публичную библиотеку, открытую в 1924 году в Нью-Йорке сыном. Морган щедро выделяет средства Американскому музею естественной истории, Тринити-колледжу и Гарвардскому университету. По всей Америке финансирует он трудовые школы — специальные учебные заведения для рабочей молодежи. Музею «Метрополитен» кроме денег достаются и произведения искусства — живопись, графика и гравюры, а музею естественной Истории — его камни. Личная коллекция живописи Моргана оценивалась в 50 миллионов долларов. Д.П. Морган любил благотворительность. Он выдал инженеру Н. Тесле деньги на его опыты по беспроводной передаче электрической энергии. Фотографу Э. Кертису банкир выделил средства на серию фотографий «Коренные жители Америки»
Личное воздействие Джона Моргана было фантастическим. Кто-то после встречи с ним сказал, что когда пришел Морган, будто «…ураган пронесся по дому». Внешний вид финансиста приковывал к себе внимание — крупный мужчина, с пронзительными глазами и фиолетовым носом, разросшимся к старости до чудовищных размеров. Морган страдал ринофимой — заболеванием сосудов и сальных желез носа. Так, благодаря своему влиянию и своей внешности, Д. Морган сразу стал объектов внимания карикатуристов, изображавших «акул капитализма». Собственно Морган и был такой акулой, грозой мирового финансового океана.