В начале второго голодного лета Матвей со стрельцами был отозван в Москву. И теперь за Филаретом по поручению игумена Арефа надзирали только монастырские служки. Он им не доставлял хлопот, потому как был самым послушным и исполнительным монахом и проявлял много рвения в служении Господу Богу.
Однако в Филарете подспудно ещё многое оставалось и от прежнего удалого князя Фёдора Романова. Переболев из-за отлучения от мирской среды, он сохранил жизнелюбие. А его человеколюбие проросло христианским милосердием. Он болел душой за каждого страждущего. Князь Фёдор был любознательным в постижении учёной премудрости, и Филарет не растратил сей дар, но умножил его.
Однажды Филарет задумал узнать, с чего начинался Антониево-Сийский монастырь. И дотошно исполнил своё желание. Он нашёл в монастыре старцев, которые хранили предание об основателе обители преподобном Антонии и в часы свободные от бдения и молитвы они рассказывали Филарету доподлинную жизнь подвижника. И Филарет возлюбил Антония, свершившего подвиг во имя веры.
В миру Антоний, именем Андрей, был сыном земледельца из села Кехты, кое лежало в тридцати верстах от Архангельска. С детства у него пробудилось влечение к живописи, и он пристрастился писать иконы. А повзрослев, после кончины родителей, ушёл в Новгородскую землю, там вступил в услужение к боярину, который держал иконописцев. В дворне боярина он встретил милую девушку и соединился с нею в церкви венчанием. Да недолгим был путь рабы Божьей Аглаи по земной юдоли. Господь взял её к себе за ангельскую кротость. Андрей пред алтарём поведал, что видел, как душа его любимой супруги вознеслась в Царство Небесное. Овдовев, Андрей принял обет безбрачия и служения Богу. Он вернулся в родную Кехту роздал бедным имущество: кое осталось от родителей, и ушёл искать обитель, чтобы принять там постриг.
Однажды, после долгого дневного пути, Андрей уснул в лесу под разлапистой елью и во сне увидел святого мужа. Тот сказал ему: «Ведаю, ты хочешь посвятить себя служению Богу. Иди в Пахомьеву пустынь. Зри на главную ночную звезду и придёшь на реку Кену». Андрей поверил в сновидение и отправился в путь, всё на север по Полярной звезде. Добрался до реки Онеги, вышел к реке Кене и там нашёл Пахомьеву пустынь. Порадовался, потому как без явления святого мужа блуждал бы во тьме лесов.
Как исполнилось тридцать лет, Андрей принял монашеский сан и взял себе имя Антония. Нраву неугомонного, он искал место для подвига. И пробыв в Пахомьевой пустыни совсем немного, уговорил двух иноков, Иоакима и Селесандра, и ушёл с ними в дикие леса. Остановился вначале на реке телексе и основал там пустынь. Три подвижника за зиму срубили церковь во имя Святого Николая Чудотворца, поставили зимник.
Филарет искренне восторгался подвигом подвижников и не ведал ещё, как обернётся всё то, что он узнавал о преподобном Антонии. Но за радение о святом старце он уже ощущал благо: монахи относились к Филарету почтительно.
О новой церкви на реке телексе прослышали в округе. И потянулись к ней богомольцы. Многие же остались в пустыни, приняли иночество. И зародился новый монастырь. Да крутого нраву оказались крестьяне ближней к монастырю деревни, не дали земли монахам под хлебопашество. Антоний осердился на них и ушёл. На прощание сказал: «Живите ни голо, ни богато».
Он добрался до реки Сии, здесь нашёл озеро Михайлово с островами. Ему полюбилось это озеро, окружённое светлыми лесами. В печальной красе озера было что-то таинственное. В нём водилось множество рыбы, была и красная — кумжа. Узрев вдали большой остров, Антоний решил до него добраться и заложить там новый монастырь. А пока построил на берегу озера келью и жил в ней. А как пришли однажды к озеру богомольцы, так нашёл среди них доброхотов и послал их к великому князю всея Руси Василию Ивановичу с прошением возвести на острове Михайлова озера монастырь.