Война поставила сложные задачи перед прокатчиками. Надо было оперативно перестроиться на прокатку качественного металла, в то время как не хватало специальных прокатных валков, отсутствовали разработанные режимы нагрева прокатки слитков, недоставало опытных кадров для прокатки легированного металла. Но это не испугало прокатчиков. Для прокатки легированной стали на блюминге № 2 перестроена технология производства, разработаны специальные режимы нагрева, увеличено количество пропусков. Площадь цеха, где производилась вырубка дефектов металла и подготовка металла для прокатки на сортовых станах, пришлось расширить более чем в три раза. Было создано совершенно новое хозяйство для легированной заготовки и легированного готового проката. Для этого перестроили цех отделки готового проката. Появился новый, термический цех, переоборудован цех отгрузки. Резко возросла и культура в работе. Например, потери металла из-за оплавленных слитков снизились с 10,4 процента в 1940 году до 2,11 процента в 1941 году.
Быстро изнашивались валки блюминга. Заменить было нечем, да и время не позволяло останавливать стан. Чтобы создать более или менее нормальные условия для работы валков, цех вынужденно перешел на прокатку квадрата 220 вместо 240. Это увеличило срок службы валков почти на одну треть, но повлияло на продолжительность прокатки.
С большим подъемом работали коллективы сортовых станов. На сортовом стане «500» прокатка конструкционной стали к концу 1941 года возросла в 3,5 раза. Здесь освоили прокатку 12 новых специальных марок стали. Прокатчики мелкосортных станов освоили много марок специального металла, в том числе требующих точности выполнения размера профиля, специального режима прокатки.
По плану Наркомата предполагалось катать броневой лист на специальном прокатном стане «1250», эвакуированном из Мариуполя. Монтаж этого стана партком взял под особый контроль. Пришлось строить специальное помещение. Это осложняло работу, удлиняло сроки. Кроме того, производительность стана «1250» не обеспечивала все возрастающие потребности в броневом металле. Пришлось искать другой выход. И он был найден. Заместитель главного механика комбината Н. А. Рыженко предложил перестроить блюминг № 3 на прокатку броневых слитков. Руководство комбината, партком горячо поддержали ценное рационализаторское предложение.
Фронт требовал снарядную заготовку крупных сечений. Специальных станов для ее прокатки Магнитка не имела. Прокатчики рискнули использовать непрерывно заготовочный стан «720». Опыт удался. В ходе войны комбинат получал много заказов на прокатку металла среднего профиля. Сортовые станы были сильно перегружены, а заказы надо выполнять. Выход также нашли. Часть металла передали на мелкосортные станы, хотя они были рассчитаны на прокатку металла мелкого профиля. Советские люди перешагнули через «проектные» возможности и успешно решили и эту задачу.
Правительство высоко оценило творческий труд магнитогорцев. В числе первых, получивших правительственные награды, были директор комбината Г. И. Носов, заместитель главного механика Н. А. Рыженко, начальник мартеновского цеха № 3 В. А. Смирнов, начальник блюминга № 3 Г. В. Савельев, механик блюминга № 3 Н. Р. Ануфриенко, старший сварщик блюминга № 3 Д. Д. Козинцев, начальник механического цеха В. И. Ситько, бригадир ново-токарного цеха П. Г. Орлова, сталевары А. С. Поздняков, Д. Н. Жуков, оператор блюминга № 3 В. Е. Спиридонов, мастер мартеновского цеха № 3 Е. С. Сазонов, токарь основного механического цеха Р. В. Ермаков и другие.
За разработку новой марки броневой стали и процессов ее производства в 1942 году присуждена Государственная премия Г. И. Носову, Н. А. Рыженко, В. А. Смирнову, С. И. Сахину, Е. Е. Левину.
Не менее сложные задачи поставила война перед доменщиками и коксовиками комбината. Родина требовала как можно больше чугуна для выплавки стали, для работы литейных цехов. Коллектив доменщиков горел желанием резко увеличить выплавку передельных и литейных чугунов. Но на их пути появились, казалось бы, непреодолимые преграды. Резко сократилось поступление различных металлических присадок, перестали поступать марганцевые руды с Чиатурских рудников (Кавказ). Во всю ширь встала проблема — перейти на выплавку чугуна с использованием местных марганцевых руд, от применения которых доменщики решительно отказывались в прошлом. Комбинат бросил большие силы на организацию добычи бедных марганцевых руд в 50—60 километрах от города. Буквально через месяц руда стала поступать в доменный цех, и доблестный коллектив доменщиков искусно использовал ее в работе — давал добротный чугун.