Не менее пестрым, чем этнический, был религиозный состав населения империи. Христианство стало господствующей религией еще в IV в. Однако к VII в. в Византии еще было некоторое (весьма небольшое) количество язычников. Религией евреев был иудаизм. Особую его разновидность исповедовали самаритяне. Но большинство жителей империи было уже христианизировано. Еще с первых веков нашей эры христианство разделилось на множество различных направлений. В Византии существовали многочисленные секты, по-своему толковавшие христианскую доктрину. Официальным исповеданием со времени правления императора Юстина I (518–527) являлось православие, признававшее утвержденное Халкидонским собором в 451 г. учение о наличии у Иисуса Христа двух природ – божественной и человеческой, существующих неслитно, хотя и в неразрывном единстве. Православные (халкидониты) имели патриаршие кафедры в Константинополе, Александрии, Антиохии и Иерусалиме. Они составляли большинство населения империи.
В противовес православному вероучению в V в. возникли несторианское и монофиситское учения. Основателем первого был константинопольский патриарх Несторий (428–431), который резко разделял в Христе божественную и человеческую природы, которые соединялись, по его мнению, лишь чисто внешним образом. Хотя его учение было осуждено на Эфесском соборе в 431 г., оно имело последователей на византийском Востоке. Впоследствии, опасаясь преследований, многие несториане переселились в Персию, и к VII в. в Византии их осталось весьма незначительное число.
Крупнейшим (по количеству последователей) после православия христианским исповеданием было монофиситство, в отличие от православия и несторианства признававшее полное слияние божественного и человеческого начал у Христа в единую природу. Хотя Халкидонский Вселенский собор решительно осудил монофиситскую доктрину, монофиситам иногда удавалось во второй половине V – начале VI в. одерживать временные победы над халкидонитами. Однако когда после смерти в 518 г. императора Анастасия, покровительствовавшего монофиситам, на престол вступил Юстин I, халкидонитское исповедание было признано официальным. С тех пор монофиситы окончательно лишились государственной поддержки и в отдельные периоды подвергались открытым гонениям. Тем не менее они не исчезли полностью и к началу VII в. представляли после православных самую многочисленную религиозную общину в империи, особенно на Востоке. Если в Палестине монофиситы не имели существенного влияния, то в Сирии они представляли серьезную оппозицию официальному православию. Там численность халкидонитского и монофиситского населения была примерно равной. В Египте монофиситы явно преобладали над православными. В течение V–VI вв. монофиситство разделилось на множество направлений, различавшихся между собой по частным вопросам догматики. Например, сторонники Севера Антиохийского считали тело Иисуса Христа тленным, а приверженцы его противника Юлиана – нетленным. Севериане были самой многочисленной по числу последователей монофиситской группировкой. В Александрии и Антиохии у них были свои патриархи. В Сирии севериан также называли яковитами по имени эдесского епископа Якова Барадея, жившего в VI в. и много сделавшего для создания монофиситской церковной организации.
Уровень экономического развития Византии был более высоким, чем на Западе. В состав Византийской империи входили страны древней земледельческой культуры. В некоторых областях плодородие почвы и благоприятный климат позволяли снимать по 2–3 урожая в год. В азиатских и африканских провинциях ирригация играла в сельском хозяйстве огромную роль. Главной житницей империи был Египет, где урожайность зависела от уровня разливов Нила. Кроме земледелия, в Византии было широко развито садоводство, виноградарство и культура олив, а на юге – финиковых пальм. Сеяли и технические культуры (лен и др.). Широко было распространено скотоводство.