В 1940 г. было принято еще одно важное решение, коренным образом изменившее организационно-штатную структуру флотов — на них начали формироваться военно-морские базы (ВМБ). ВМБ - это специфическое формирование ВМФ. С одной стороны, это район (пункт) базирования корабельных сил, оборудованный гаванями, рейдами, имеющий полный или неполный комплекс обслуживающих подразделений тыла, с другой, это соединение разнородных сил - надводных подводных, береговой обороны, морской пехоты. ПВО и морской авиации, способное решать оперативно-тактические задачи.
Приказом Наркома ВМФ от 13 марта 1940 г. началось формирование военно-морских баз на Тихоокеанском флоте. В соответствии с приказом на ТОФ была сформирована главная военно-морская база (ГВМБ) - Владивосток и военно-морские базы 3 разряда - Комсомольская. Владимиро-Ольгинская и Петропавловская. В составе Северной Тихоокеанской флотилии были сформированы военно-морская база 1-го разряда Совгавань и военно-морские базы 3-го разряда Де-Кастри и Николаевск-на-Амуре.
Изменения в теории базирования флота были обусловлены количественным и качественным разнообразием промышленной продукции, необходимой для флота, которое привело к распределению заказов флота между многочисленными специализированными предприятиями и резкому снижению роли главных баз флота в постройке кораблей. Если ранее основные задачи баз-арсеналов заключались в создании материальной части флота, запасов для него и подготовки личного состава, в силу чего в них находились адмиралтейства, т.е. государственные судостроительные верфи на которых строился весь флот, то к началу второй мировой войны изменились и задачи и классификация баз. Была предложена новая классификация баз:
1. Главные или тыловые базы флота.
2. Операционные базы флота.
3. Маневренные базы флота.
4. Морские станции или опорные пункты[103].
Изменилось и само понятие «база флота». Если ранее под ним подразумевалось только место базирования кораблей, то ко второй мировой войне под «базами флота» стали понимать обороняемые участки акватории и побережья, на которых концентрировался комплекс баз кораблей различных классов: баз подводных лодок, торпедных катеров, сторожевых кораблей, кораблей ПЛО (противолодочной обороны), баз гидроавиации и т.п.
На главные или тыловые базы были возложены задачи:
а) создание, частичное хранение и распределение мобилизационных запасов по всем видам снабжения флота; снабжение остальных баз флота на данном театре;
б) подготовка личного состава (рядового и младшего начальствующего) по основным специальностям для данного моря; укомплектование кораблей, выходящих из капитального ремонта и вновь построенных;
в) наблюдение за выполнением плана ремонта и сдачи испытаний ремонтируемых и вновь построенных кораблей;
г) капитальный ремонт, большой аварийный ремонт и реконструкция кораблей;
д) полное материальное обеспечение и обслуживание личного состава соединений кораблей, находящихся по дислокации флота в главной базе;
е) хранение кораблей резерва и руководство отмобилизованием торговых судов, привлекаемых по мобилизации в состав флота.
Задачами операционных баз флота являлись:
а) активная оборона определенного участка побережья и флота, находящегося в базе, от нападения противника, осуществляемого соединениями надводных кораблей, отдельными подводными лодками или торпедными катерами и воздушными силами;
б) предоставление отдыха личному составу базирующегося флота, обслуживание его в санитарном и культурно-просветительском отношении, лечение и эвакуация больных и раненых;
в) выполнение аварийного ремонта кораблей, производство их текущего и среднего ремонта;
г) обеспечение базирующегося флота всеми видами снабжения;
д) обслуживание базирующегося флота плавучими средствами, защищенными и оборудованными местами стоянки кораблей, ледокольными и спасательными средствами;
е) участие в подготовке и комплектовании личного состава базирующегося флота;