В наступившем 1790 году Дунайская флотилия под командованием генерал-майора Дерибаса приняла участие в штурме турецких крепостей на Дунае — Тульчи, Исакчи и Измаила. Однако вплоть до осени флотилии пришлось пережидать штормовые ветра в Очаковском лимане. Победа над турецким флотом в морском сражении у мыса Тендра, одержанная черноморской эскадрой под командованием контр-адмирала Ф.Ф. Ушакова 29 августа (по новому стилю 11 сентября) 1790 года предоставила новые возможности для ведения боевых действий на Дунае. В современной России день сражения у Тендры стал Днем воинской славы России. Победа при Тендре и последовавшее за ней прекращение штормов, позволили Дунайской флотилии 13 октября 1790 года выйти к Днестровскому лиману. Там ее уже ожидали дубы (вид транспортных речных судов) казаков.
Командующий флотилией генерал-майор Дерибас отправил к Килийскому гирлу Дуная 48 дубов и 12 лансонов для содействия войскам генерал-лейтенанта Гудовича[82]. Остальные суда Дерибас повел к Сулинскому гирлу Дуная. У входа в Сулинское гирло противник выставил по одной береговой батарее на каждом берегу и еще двадцать три судна для закрытия фарватера[83]. Овладеть Сулинским гирлом удалось благодаря тому, что судами флотилии, был высажен десант гренадер, которые овладели турецкими батареями и их же орудиями уничтожили находившиеся там турецкие суда. Затем последовало соединение с флотилией, шедшей по Килийскому гирлу Дуная. Этому попытался воспрепятствовать гарнизон крепости Тульча.
К крепости был выслан авангард флотилии под командованием капитана Ахматова. Ему навстречу выдвинулся отряд из семнадцати турецких судов, но после того как русский авангард уничтожил двух из них, турки обратились в бегство. Продолжив преследование врага до самой крепости, и высадив на берег своих солдат, авангарду флотилии удалось уничтожить еще четыре судна противника. К вечеру, видя, что от русских уйти речным путем не удастся, турки сами сожгли свои суда и отошли в степь. Вскоре и гарнизон крепости последовал примеру своих товарищей и удалился в степь. Через несколько дней, 7 ноября 1790 года важный опорный пункт противника на Дунае, крепость Тульча был взят практически без боя.
Овладение Исакчей было сопряжено рядом неприятных событий, имевших место, когда войска генерал-аншефа Суворова соприкасались с местным населением. По мере приближения русских войск к этой крепости, ее мирное население вместе со своими семьями решили покинуть это небезопасное место и отправились вверх по течению Дуная к Браилову[84]. В погоню за ними Суворов отправил отряд арнаутов (наемники в русской армии — авт.), которые догнали турецкий речной караван в районе Галаца, овладели их четырнадцатью судами, убили сто человек, остальных лиц обоего пола которые не были христианами в количестве девяноста двух человек взяли в плен[85]. Дальнейшая судьба пленных осталась неизвестна.
Когда Дунайская флотилия под командованием генерал-майора Дерибаса в начале ноября 1790 года подошла к Исакче, по ней был открыт огонь с тридцати турецких лансонов и двух больших кораблей противника. Также огонь велся и из крепостных орудий. Часть кораблей Дерибаса заняли позицию, где их не доставал вражеский огонь, но они сами могли поражать противника из-за большей дальнобойности своих орудий. Таким образом, была уничтожена половина кораблей противника. Одновременно другая часть кораблей флотилии обогнула небольшой остров у крепости и вышла в тыл оставшимся турецким судам. Их экипажи были вынуждены сначала отойти к крепости, а затем, спасаться бегством, бросив свои суда. С кораблей Дунайской флотилии был высажен очередной десант, который 13 ноября 1790 года быстро овладел крепостью, при этом двадцать два турецких лансона, стоявших у пристани, были уничтожены, остальные суда захвачены[86].
После взятия Тульчи и Исакчи турецкая крепость Измаил осталась изолированной как с суши, так и со стороны реки и не имела больше возможности получать военную поддержку, пополнять запасы провизии и личного состава. Тем не менее, Турция, несмотря на сокрушительные поражения под Очаковом, в Рымникском сражении и на Дунае, упорно не желала заключать мир с Россией. Единственным способом склонить к этому Османскую империю было овладение ее последней твердыней на Дунае — Измаилом. Овладение последним турецким форпостом в устье Дунае было возложено главнокомандующим генерал-фельдмаршалом Г.А. Потемкиным на войска, возглавляемые генерал-аншефом А.В. Суворовым.