Вопросы касающиеся Первой мировой войны всегда особо рассматривались в отечественной историографии, так как участие Российской империи в Первой мировой войне стало одним из главных факторов, приведших к ее крушению в 1917 году и, как следствие, изменению всей политической карты мира. Роль Дунайской военной флотилии в ходе этой войны была весьма существенной. Дунайская флотилия, преобразованная в Экспедицию особого назначения, сыграла важную роль в сдерживании австро-венгерских сил на балканском театре военных действий.
Рассматривая историю боевого применения российских речных военных флотилий авторы отмечают, что они применялись и в ходе Гражданской войны, и в годы Второй мировой войны и Великой Отечественной войны. И поэтому вполне возможно использование такового исторического опыта и на современном этапе при ситуации, когда боевые действия могут развернуться в приречных районах. Но данный период и тематика не входят в тему исследования.
Следует отметить, что помимо исторического анализа событий, в которых принимали участие российские речные флотилии, в работе рассмотрен процесс их создания для каждой войны, в которой они принимали участие. Также рассмотрены периоды, когда после окончания боевых действий речные военные флотилии не были расформированы и продолжали нести свою службу. При этом показан процесс поддержания их постоянной боеготовности и усиления перед предстоящими боевыми действиями.
Историография дореволюционной эпохи представлена работами, написанными еще в первой половине XIX века. К этому периоду относятся труды историков А.В. Висковатова «Военные действия Российского гребного флота» и «Взгляд на военные действия России на Черном море и Дунае с 1787 по 1791 год», и генерал-лейтенанта А.И. Михайловского-Данилевского «Описание турецкой войны с 1806-го до 1812-го года». Они сыграли ключевую роль в анализе причин русско-турецких войн и в частности в демонстрации в ходе них действий военных речных флотилий. В работе «Военные действия Российского гребного флота» показано боевое применение флотилий в ходе русско-турецкой войны 1735–1739 годов, конкретные их действия в устье Дона, у Геническа и у Виссарионовой косы. В труде «Взгляд на военные действия России на Черном море и Дунае с 1787 по 1791 год» показано боевое применение Дунайской флотилии в ходе русско-турецкой войны 1787–1791 года, детально показан вклад Лиманской флотилии в овладение Очаковым и Дунайской флотилии во взятии Измаила и победе в Мачинском сражении.
Историография второй половины XIX века представлена такими трудами как «Битва и занятие позиций при Шумле 8 июля 1828 года», посвященного событиям русско-турецкой войны 1828–1829 годов с описанием действий в ходе них Дунайской флотилии. Другой работой посвященной данной войне является «Русско-турецкая кампания в Европейской Турции 1828 и 1829 гг». В ней подробно рассказывается о том, как Дунайская флотилия оказывала помощь российским войскам при переправе через Дунай и овладении турецкими крепостями на берегах этой реки.
Особого внимания заслуживают произведения генерал-лейтенанта А.Н. Петрова «Война России с Турцией и польскими конфедератами в 1769–1774 год» и «Война России с Турцией. Дунайская кампания», затрагивающие тему русско-турецкой войны 1768–1774 годов и подробно описывающие действия в ходе нее Дунайской флотилии и повествующие о присоединении к России Крыма и получения выхода в Черное море. В частности в этой работе указано как конкретно помогли Донская и Дунайская флотилии российской армии в боевых действиях на Дону и Дунае, в перевозке грузов, штурме Очакова и Измаила. Генерал-лейтенант Петров помимо указанной работы написал еще труды, посвященные русско-турецкой войне 1787–1791 годов, «Вторая Турецкая война в царствование Екатерины II» и русско-турецкой войне 1806–1812 годов, «Война России с Турцией 1806–1812 гг.» где также рассматриваются действия Дунайской флотилии.
История зарождения регулярного российского Военно-Морского Флота, который, по сути, начался с создания речных флотилий, принявших участие во взятии Азова, описан известным военно-морским историком капитаном 1 ранга С.И. Елагиным в работе «История русского флота. Период Азовский». В этой работе автор подробно описал процесс создания первых российских военных судов в массовом масштабе, в частности создание из них речных военных флотилий для покорения Азова. Им описано как, на каких верфях строились эти суда, как по Днепру и Дону, сражаясь с турецкими гарнизонами, шли они к Азову и, наконец, как была достигнута Азовская победа, после которой был издан указ «Морским судам быть», и началось создание регулярного Военно-Морского Флота.