В 301 г. при царе Тигране III произошло важнейшее событие национальной истории – в Армении принимается христианство, ставшее государственной религией. Сформировалась армянская церковь, первым главой которой стал Григор Просветитель (Лусаворич). В IV веке персидский царь Шапух II начал войну против Армении, которая длилась с небольшими перерывами 30 лет.
В конце концов, Рим и Персия пришли к соглашению и в 387 г. разделили Армению между собой. Персии досталась большая часть армянской территории. Хотя в персидской части некоторое время еще существовала царская власть, однако положение страны было безнадежным. Города были разрушены, экономика развалена, государственная власть ослаблена. Воспользовавшись этим, Персия в 428 г. упразднила вассальное Армянское царство. Арташир – последний царь из Аршакидской династии – был низложен. Страна распалась на множество княжеств, которые подчинялись правителю, назначаемому персидским царем.
Персидские правители огнем и мечом пытались выкорчевать христианство в Армении и насадить учение Зороастра (огнепоклонство). Местное население отвечало персам многочисленными восстаниями. Важным событием этого периода было отделение армянской Церкви от греческой после Халкидонского собора, состоявшегося в 598 г.
В 1651 г. арабы разгромили персидскую державу. Правитель Армении (мазр) Вараэтироу, надеясь найти покровительство и защиту у Константинополя, добровольно признал над собою власть греческого императора Гераклия, который присвоил ему звание куропалата. Но император не спешил вступаться за армян. А тем временем арабы практически опустошили Араратскую провинцию, в Двине истребили более 35 тысяч человек и вывели в Дамаск огромное количество пленных.
После ухода арабов в Армению вторглась византийская армия. Новый правитель Армении Газамасп Мамиконян стал вассалом Византии.
До 702 г. Армения по-прежнему находилась под властью византийцев и арабов. А с 702 г. по 1021 г. армянские правители были вассалами дамасских халифов. Ашот I (ум. в 889 г.) – потомок древнего и могущественного армянского рода Багратидов, с соизволения калифа Мутамида Биллаха в 885 г. получил корону и сделался основателем третьей великой династии Багратидов, или Багратуни, царствовавшей до 1046 г.
В период с 1021 г. по 1080 г. Армения подверглась нашествию турков-сельджуков и противодействующих им византийцев. В конце концов туркам удалось ликвидировать армянскую государственность в так называемой Великой Армении.
Однако в 1080 г., с падением Великой Армении, государственная история армян переходит в историю Киликии. Государство это просуществовало около 300 лет. Киликия – часть Малой Армении, уже давно служила прибежищем армян, бежавших от преследований. Особенно увеличилось население Киликии после падения Великой Армении. Там возникает новое армянское государство и в 1080 г. первым Киликийским царем был избран Рубен I, основатель новой династии Рубенидов. В царствование его сына Константина I (1095–1100) армяне участвовали в Первом крестовом походе, взяв на себя продовольственное снабжение. Константину также удалось расширить свои границы, освободив армянские города от греческого владычества.
Еще более расширил владения Киликии его сын Торос I (1100–1123). Умело лавируя между турками-сельджуками и греками, он вел удачную политику, направленную на укрепление своего государства. После его смерти престол перешел его брату Леону I (1123–1136). Леон продолжил политику брата, приобретя в борьбе с греками несколько городов и Антиохскую область. Действия Леона вызвали гнев и византийского императора Иоанна Комнина, который с большими силами вторгся в Киликию, захватил Леона и его сыновей и отправил в Константинополь. Там Леон умер в 1136 г., а его старший сын Рубен был ослеплен и убит. Младший же, Торос, прощен и даже принят на службу императора. Вскоре турки-сельджуки напали на Киликию. Иоанн Комнен с войсками двинулся им навстречу. В этом походе император умер, а Торос II вернулся в Киликию и 1141 году занял трон своего отца.
Пользуясь войной Византии с турками, он объявил независимость Киликии. Вскоре новый император Мануил Комнен заключил с Торосом мир. В этот период ряд мелких мусульманских владений объединились под властью султана Нуреддина, захватившего город Эдессу в 1144 г. Это новое государство стало серьезной угрозой Киликии. Торос не замедлил принять участие в походе против Нуреддина в союзе с крестоносцами. Вернувшись из похода, Торос обнаружил, что греки, нарушив договор, опять захватили киликийские города. Он немедленно вернул их, разбив армию императора, а затем, снарядив корабли, сам напал на остров Кипр. Война с Византией продолжалась до конца царствования Тороса, то затухая, то возобновляясь с новой силой.