Примерно тогда же «Хейнкель» Не-111 из II/KG4 проводил разведку над Александрией. Он не вернулся из этого вылета, и позже были подобраны два человека из его экипажа, которые сообщили, что «Хейнкель» был сбит зенитным огнем. Вероятно, его могли сбить и «Фулмары» из 806-й эскадрильи FAA: лейтенант МакДональд-Холл и суб-лейтенант Хогг, взлетевшие с базы Абукир, заметили одиночный немецкий бомбардировщик, который приняли за разведывательный Ju-88. МакДональд-Холл вспоминал:
«Мы заметили 88-й, вероятно, разведчик, и у нас в этот момент было преимущество в высоте. Он сразу же повернул к Криту, но мы вдвоем атаковали его, и видели, как он упал в воду».
Когда эвакуация завершилась, на Крите еще оставалось около 12 500 британских, австралийских и новозеландских солдат, в том числе 226 человек личного состава RAF. Многие из них уже были в плену, но тем, кто еще оставался на свободе, генерал Уэйвелл дал разрешение сдаваться или спасаться своими силами. И к концу 1941 до Египта разными путями и средствами смогли добраться более 1000 сбежавших с Крита, а также из материковой Греции и греческих островов. Некоторые успели спастись быстро, прежде чем немцы полностью оккупировали Крит. Среди них были около 200 австралийцев из 2/11-го батальона, оборонявшего Ретимо, шотландцы из «Черной Стражи» и полка Аргайла и Сазерленда, и несколько человек из RAF, которые смогли добраться до Тимбаки к 1 июня. В этой группе были флайн-офицер Беннет, пайлот-офицер Бартли и рядовые из 112-й эскадрильи RAF. Днем над ними пролетел «Бленхейм» на малой высоте и сбросил некоторое количество продовольствия, в котором они очень нуждались. По прибытии в район Тимбаки они встретили там лейтенанта Форда и его экипаж «Мэриленда» из 24-й эскадрильи SAAF, сбитого 25 мая, и вместе придумали план побега с острова.
Они смогли починить брошенную десантную баржу с пробоинами ниже ватерлинии и погнутым винтом, другие искали в районе Тимбаки горючее и продовольствие. Шесть офицеров (в том числе Беннет, Бартли, Форд и лейтенант Гилл) и 66 солдат решили попытать счастья и вышли в море на барже, у которой был исправным только один мотор. Через три дня их перехватила итальянская подводная лодка, с которой просигналили приказ остановиться. Итальянцы приказали офицерам плыть к подводной лодке, при попытке добраться до нее лейтенант Гилл утонул. Раненому австралийскому офицеру итальянцы разрешили остаться на барже и приказали возвращаться обратно к Криту. Но командование баржей принял сержант Д. МакУильям, и он решил продолжить путь к североафриканскому берегу.
Итальянцы больше не мешали им, и спустя четыре дня баржа благополучно достигла Мерса-Матрух. Позже пришла еще одна десантная баржа, на ней с Крита бежали 142 человека – морские пехотинцы, австралийцы, новозеландцы и коммандос. Они вышли из Сфакии и провели в море восемь дней, за это время два человека умерли от истощения, но остальные выжили и достигли африканского берега в 12 милях к западу от Сиди-Баррани.
Другие позже бежали через Грецию и Турцию, некоторые из лагерей для военнопленных. Около 200 таких беглецов спасли подводные лодки «Трэшер» и «Торбей». Другим помогали бежать агенты Отделения «N» службы MI-9 (отделение британской разведки, занимавшееся помощью беглецам из оккупированной Греции и греческих островов), устроившие секретную базу в районе Чесмо на западном побережье Турции, напротив эгейского острова Хиос. Действуя оттуда, каики и другие малые суда спасали группы беглецов три следующих года оккупации. Одним из тех, кто смог бежать из плена и вернуться в Египет был командир 33-й эскадрильи RAF Хауэлл.
Хотя кампании в Греции и на Крите невозможно рассматривать иначе как катастрофу для Британского Содружества (имевшую особенно тяжкие последствия для греческого населения), которая серьезно ослабила британские позиции в Средиземноморье и на Ближнем Востоке в целом, и стала причиной потери всего, что было отвоевано у итальянцев в Ливии, для держав Оси цена этих кампаний также была высока. Итальянскому престижу был нанесен сильнейший удар. Адольф Гитлер был настолько потрясен потерями своих элитных воздушно-десантных войск, что никогда больше не позволял проводить их крупномасштабные высадки. Балканы стали зоной военных действий, требовавшей постоянной и дорогостоящей оккупации и периодического проведения антипартизанских операций. И кто знает, чего могли бы достигнуть немцы, если бы операция «Барбаросса» против Советского Союза началась на один месяц раньше.
С тактической точки зрения британские потери были тяжелее, и на этой стадии войны их было труднее возместить. Особенно тяжелыми были потери Королевского Флота – следует заметить, что практически все они были понесены от действий авиации противника. В битве за Крит были потоплены три крейсера и шесть эсминцев. Три линкора, авианосец, шесть крейсеров и семь эсминцев получили повреждения, некоторые очень тяжелые. На этих кораблях погибли 1828 человек и еще 128 были тяжело ранены. Также очень тяжелы были потери торгового флота союзников, уже серьезно пострадавшего от действий немецких подводных лодок в Атлантике.