В последующие два года Союзники начали терпеть поражения за поражением. Крупнейшие города Пандоры были оставлены врагу, а на захваченной территории был установлен жестокий тоталитарный режим Маквина.
Но, в 1952 году, Союзники решились на проведение операции, которая сумела поставить врага на колени. Новый космический крейсер, который стал прообразом знаменитой "Виктории", вооружился новейшим лазерным оружием.
И, благодаря этому факту, Союзникам удалось заманить Маквина и его армию под предлогом последней битвы. А спустя всего лишь один час "Красный Рассвет" был полностью разгромлен, когда крейсер "Немезида" обстрелял войска с орбиты. Маквин, а также основная верхушка "Рассвета" были убиты, а те, кто сумел спастись ушли в глубокое подполье.
Победа досталась Союзу Пандоры дорогой ценой. Миллионы жизней, подорванная экономика, города в руинах. Но, не смотря на это, уже спустя десяток лет Пандора вновь поднялась, а уровень её технологического развития стал зашкаливать.
Но, "Красный Рассвет" не был уничтожен.
И в начале 2000 года по нашему летоисчислению, фанатики вновь развязали войну, которая теперь происходила не на самой планете, а в космосе.
С самого начала Второй Гражданской Войны, силы были на стороне Союза Пандоры. Вся мощь космического флота пандорян состояла в то время из линейных крейсеров класса "Юнона", соизмеримых по размерам и вооружению с земными кораблями класса "Дедал". Плюс к тому три флагманских боевых крейсера класса "Немезида", первый прототип которого стал залогом в победе в первой войне. И всё это не считая нескольких тысяч новейших истребителей рейдеров, способных развивать немыслимые скорости, а также показывать безумные фигуры пилотажа...
Военно-технологическое превосходство Союза Пандоры, щедро финансированное и к тому же, обладавшее самыми передовыми знаниями, взятыми у Древних, обеспечило несколько крупных побед. В то время, лидером сепаратистов, был бывший глава Центра Научных Исследований Пандоры, Мэр Кринс. В отличие от своих предшественников, он не верил в их убеждения. Но, он мечтал, что с помощью "Красного Рассвета" сумеет завладеть всеми знаниями и технологиями Древних и встать во главе планеты. Его вышибли из ЦНИ за то, что он хотел с помощью источника питания Древних, создать сверхмощную бомбу, способную уничтожать целые планеты.
Силы Кринса сумели завладеть несколькими передовыми технологиями, втайне от Союза. Перенеся всё это в лабораторию на пустынной планете Марлона, находившуюся на окраине солнечной системы, учёные "Красного Рассвета" создали новый тип кораблей. Небольшие, вдвое меньше крейсеров класса "Юнона" они могли точно сбивать любые цели, с помощью всего лишь одной протонной пушки. При этом все корабли сепаратистов были рассчитаны на максимально небольшое количество мест, так как обладали очень ненадёжной защитой. И иногда могли использоваться в качестве таранного орудия смертников.
В течение 2001 года с помощью максимально скоординированных атак "Красный Рассвет" нанёс Союзу несколько сокрушительных ударов. Первыми были сбиты корабли класса "Немезида", не смотря на всю мощи своего вооружения, не способные тягаться с кораблями сепаратистов. Каждый корабль был уничтожен поодиночке, "Красный Рассвет" прекрасно разбирался в террористических атаках, а также атаках из засады. Несколько диверсантов сумели пробраться на корабли и взорвать двигатели, обездвижив судна до прихода основных сил. И полудюжине кораблей сепаратистов оставалось всего лишь добивать ошеломлённого противника сетью ударов из протонных пушек, против которых у Союзников не было никакой защиты.
Системы щита так и не были созданы пандорянами. Неизвестно по какой именно причине это произошло. Может они просто так и не наткнулись на это в базе данных Древних, а возможно были больше заняты созданием оружия. Так или иначе, без щитовой технологии, весь космический флот Союза был уязвим.
Вскоре, начались бомбардировки городов на Пандоре. В итоге погибли многие тысячи человек, среди них были брат и сестра адмирала Гролла. В то время он командовал всего лишь небольшим крейсером. И именно, благодаря его отваге, в начале 2002 года была одержана сокрушительная победа в битве возле Пандоры.
Кринс, обнадёженный своими победами и превосходством решил разгромить силы Союза раз и навсегда. Он собрал весь свой флот и неожиданно напал на Союзников, которые сосредоточили свои силы, окружив планету плотным кольцом.
Но, "Красный Рассвет" сильно просчитался.
На Луне Пандоры к тому времени, было закончена разработка оборонной станции. И в тот момент, когда флот сектантов подошёл к планете, на него обрушился сокрушительный огонь из лазерных пушек.