Непосредственное руководство деятельностью этого рода войск возложено на начальника военной полиции — заместителя генерального инспектора сухопутных войск в аппарате министра армии. Военная полиция организационно представлена отдельными бригадами и батальонами в составе армейских корпусов, а также ротами в составе дивизий. В бригаде может быть от двух до пяти батальонов, в зависимости от числа дивизий в составе корпуса. Количество рот в батальонах и группах военной полиции определяется характером выполняемых задач, возложенных на них. Основной организационной единицей является рота. Ее структура зависит от типа дивизии, специфики и объема выполняемых задач, а численность может быть от 77 до 280 военнослужащих.
В ВВС сформированы эскадрильи военной полиции, которые дислоцируются на авиабазах и других объектах ВВС. В ВМС и морской пехоте ее функции выполняют подразделения сил безопасности, сведенные в два батальона морской пехоты. На всех крупных боевых кораблях и десантных транспортах имеются отряды (группы) морской пехоты, в обязанности которых входит поддержание порядка на борту. Их численность в зависимости от класса корабля может составлять от 5 до 20 человек. Во главе отряда стоит, как правило, офицер, подчиняющийся непосредственно командиру корабля.
В Германии военная полиция является самостоятельным родом войск в сухопутных силах. Вместе с тем она решает задачи в интересах ВВС, ВМС, а также войск союзников по НАТО, находящихся на территории этой страны. В мирное время военная полиция предназначена для охраны штабов, мест расквартирования войск, военно-воздушных и военно-морских баз, других военных объектов, пунктов (районов) отмобилизования и развертывания войск (сил), обеспечения транспортных перевозок, регулирования движения и охраны маршрутов выдвижения войск, поддержания или восстановления порядка и дисциплины в частях и подразделениях, предотвращения преступных акций в отношении военнослужащих и военных объектов бундесвера и союзных войск. В военное время она осуществляет первичный контроль на пунктах сбора военнослужащих, отставших от своих воинских частей, организует охрану и транспортировку военнопленных, оказывает содействие федеральной полиции в регулировании потока беженцев.
Особенностью организации военной полиции бундесвера является отсутствие в структуре министерства обороны, главного штаба бундесвера и главных штабов видов вооруженных сил специальных органов, руководящих деятельностью этого рода войск. Непосредственное руководство подразделениями военной полиции осуществляет командир дивизионного командования (дивизии) через свой штаб.
Численность личного состава данной службы превышает 4,5 тыс. человек. В соответствии с новой организационно-штатной структурой сухопутных сил Германии в каждом из восьми дивизионных командований есть два батальона военной полиции (один из них скадрованный), которые входят в состав полков управления и поддержки дивизионного подчинения. Помимо этого, имеются два отдельных батальона — военной полиции берлинского гарнизона и центрального подчинения в Бонне (сокращенного состава), а также школа военной полиции и штабной службы в г. Зонтхофене.
В состав батальона военной полиции входят рота штабная и снабжения, а также три-пять рот военной полиции (в зависимости от размеров зон ответственности). Батальоны военной полиции, имеющиеся в трех дивизионных командованиях, помимо линейных рот включают по одной учебной, предназначенной для организации начальной военной подготовки военнослужащих. В мирное время численность личного состава такого батальона колеблется от 337 до 499 человек, а роты достигает 81 (4 офицера, 41 унтер-офицер, 36 рядовых). На оснащении подразделений полиции имеются легкое стрелковое вооружение, автомобили и мотоциклы.
Комплектование военной полиции, как и вооруженных сил, осуществляется на основе закона о всеобщей воинской повинности (продолжительность службы десять месяцев), а также за счет набора военнослужащих по контракту (на срок от 2 до 15 лет) и кадровых военнослужащих.
Подразделения военной полиции входили в состав миротворческих контингентов бундесвера, действовавших в мае — июле 1993 года в Сомали, а с 1994-го — в Боснии и Герцеговине.
Они применялись в указанных странах с целью содействия в организации управления подразделениями миротворческих контингентов, накопления опыта использования фельдъегерей в боевых условиях, а также для проверки эффективности национальной системы их оперативной и боевой подготовки. Ее подразделения должны были выполнять широкий круг задач: поддержание воинской дисциплины и уставного порядка в формированиях многонациональных контингентов; приведение в исполнение мер дисциплинарного воздействия к военнослужащим; оказание помощи военным судам; содержание и сопровождение задержанных военнослужащих и военнопленных; несение патрульной службы; рекогносцировка и обозначение маршрутов; регулирование передвижения войск и перевозки воинских грузов; профилактика дорожно-транспортных происшествий и регистрация уже происшедших, включая оформление протоколов; оказание помощи в случае аварий и катастроф; обеспечение безопасности личного состава в ходе учений, включая охрану районов их проведения; контроль за соблюдением войсками экологических норм, а также правил перевозки опасных грузов; обеспечение безопасности транспортировки денег и материальных ценностей, проведение контрразведывательных мероприятий.