Руководствуясь этим решением, командующий округом генерал армии Плиев приказал командиру подразделения выставить на мосту 9-10 танков и несколько БТР. При этом военнослужащие были со штатным оружием, с боеприпасами и никакой команды на применение оружия против демонстрантов не получали.
Прибывшая примерно в 10 часов 2 июня к мосту многотысячная колонна демонстрантов проигнорировала требование командования прекратить шествие. Часть демонстрантов беспрепятственно перелезла через установленную на мосту бронетехнику, а часть по мелководью преодолела реку Тузлов вброд. Сомкнувшись на противоположном берегу, колонна продолжила движение.
Упредив демонстрантов, в здание горкома партии и горисполкома прибыли Кириленко, Козлов, Микоян, Ильичев, Полянский, Шелепин, ответственные представители центральных органов КГБ генералы Ивашутин и Захаров, заведующий отделом ЦК КПСС Степаков, заместитель заведующего отделом ЦК Снастин. Когда демонстранты находились у площади Революции (примерно в 4–5 км от здания горкома и горисполкома), Козлов доложил в Москву Первому секретарю ЦК КПСС Хрущеву об обстановке и попросил разрешения отдать через министра обороны СССР и командующего войсками СКВО распоряжение на пресечение с помощью военнослужащих возможных эксцессов.
Как видно из докладной записки и.о. начальника внутренних войск МВД РСФСР генерал-майора Чугунова и начальника политотдела внутренних войск полковника Болдина, адресованной министру внутренних дел РСФСР Тикунову, к рассвету 2 июня 1962 года из Ростова-на-Дону были подвезены и выданы всему личному составу внутренних войск оружие и боеприпасы. В связи со скоплением на центральных улицах Новочеркасска многотысячной толпы и провокационными действиями накалявших обстановку отдельных хулиганствующих групп в 10 часов 2 июня все подразделения названных войск были приведены в боевую готовность.
Для руководства частями и подразделениями войск МВД, привлекаемыми к защите зданий государственных и партийных органов, а также обеспечению безопасности жителей, была создана оперативная группа из офицеров Управления войск, штаба политотдела дивизии внутренних войск. Она размещалась вместе со штабом руководства и первоначально получала непосредственные распоряжения от членов Президиума, секретарей ЦК КПСС и руководства КГБ, но с прибытием в Новочеркасск заместителя министра МВД Ромашова действовала по его указанию.
Вследствие того, что все силы имеющихся подразделений внутренних войск были задействованы, а обстановка все осложнялась, было принято решение сосредоточить в Новочеркасске дополнительные силы внутренних войск МВД РСФСР, дислоцировавшиеся в Каменске-Шахтинском, Грозном и Ростове-на-Дону.
Между тем многотысячная наэлектризованная толпа приблизилась к зданию горкома и горисполкома на расстояние 60-100 метров. Находившиеся здесь председатель горисполкома Замула, заведующий отделом ЦК КПСС Степаков и некоторые сотрудники КГБ предприняли попытку успокоить народ и призвать его к порядку. Но их, вышедших на балкон с мегафоном, забросали палками и камнями. Наиболее агрессивно настроенная группа лиц, прорвав неплотную цепь военнослужащих, охранявших вход, ворвалась внутрь здания и учинила там погром: били стекла и двери, разломали мебель, повредили телефонную проводку, сбросили на пол люстры и портреты. Остававшиеся в помещении представители партийных, советских и правоохранительных органов были вынуждены поспешно покинуть его. При этом один из работников КГБ сильно повредил ногу, что впоследствии обернулось для него ампутацией.
Захватив здание, экстремистские лидеры стали оглашать с балкона всевозможные воззвания и призывы: «Надо послать делегацию к Ворошилову», «Жить не на что», «Наконец-то дождались». Прибывшее на БТР подразделение во главе с его командиром офицером Деминым численностью 45–50 человек попыталось в пешем порядке, вклинившись в толпу, оттеснить ее. Однако солдаты растворились в ней и ввиду своей малочисленности прекратить митинг не смогли. Получив затем команду покинуть место событий, Демин вывел своих людей к оставленной за зданием военной технике. В соприкосновение с демонстрантами он и его подчиненные больше не вступали. Их место у входа в здание горкома партии и горисполкома заняло другое подразделение (с ним прибыл генерал Олешко). В отличие от одетых в полевую форму военнослужащих СА личный состав этого подразделения (около 50 человек) имел погоны малинового цвета и относился к внутренним войскам. Оттеснив от здания митингующих, новое оцепление выстроилось в две шеренги лицом к толпе демонстрантов. А генерал-майор Олешко сумел пройти в здание и пробраться на балкон. Он призвал собравшихся прекратить демонстрацию и погромы и разойтись. Его речь потонула в гуле, выкриках, угрозах расправой. Выставленными вдоль фасада здания военнослужащими из автоматов был произведен предупредительный залп вверх. Толпа шумевших и напиравших на солдат людей отхлынула назад от здания. Однако тут же из толпы раздались возгласы: «Не бойтесь! Стреляют холостыми!» Демонстранты вновь двинулись вперед, намереваясь то ли обезоружить, то ли смять оцепление. Последовал повторный залп вверх и сразу же после него — единичные автоматные очереди по толпе наседавших. 10–15 человек из числа демонстрантов упали. Впоследствии выяснилось, что кто-то из особо буйствующих лиц в толпе попытался вырвать оружие из рук солдат, которые, отбиваясь, произвели выстрелы. И только после этого демонстранты стали разбегаться, возникла давка. Прибывшие санитарные машины увезли убитых и раненых.