В январе 2004 г. на внеочередной конференции ФДР Владимир Шестаков отказался от президентского поста и уступил его Гордееву, который, таким образом, возглавил обе структуры. Одним из 9-ти вице-президентов ФДР стал Аркадий Ротенберг.
В 2006 г. возглавил созданный тогда же Всемирный фонд развития дзюдо.
В 2006 г. стал одним из учредителей дачного потребительского кооператива «Отечество» во Всеволожском р-не Ленинградской области (другие соучредители — Борис Ротенберг и Григорий Баевский).
В середине 2000-х годов братья Ротенберги создали компании «Трубный металлопрокат» и «Трубная промышленность», которые занимались продажей труб, в том числе и для ОАО «Газпром».
В ноябре 2006 г. СМП-банк братьев Ротенбергов купил блокирующий пакет акций латвийского Multibanka.
В апреле 2008 г. Аркадий Ротенберг купил 20 % долю в офшоре Kadina Ltd (бенефициары — Александр Пономаренко и Александр Ско-робогатько), которому принадлежало 50,1 % акций Новороссийского морского торгового порта (НМТП). В 2011 г. этот пакет был проданы компании «Транснефть» (генеральный директор — Николай Токарев) и структурам предпринимателя Зиявудина Магомедова.
Весной 2008 г. «Газпром» продал структурам Аркадия и Бориса Ротенберга за 8,3 млрд. руб. (практически по стартовой цене) пять своих компаний — «Краснодаргазстрой», «Волгогаз», «Ленгазспецстрой», «Спецгазремстрой», «Волгограднефтемаш». На этой базе была создана компания Аркадия и Бориса Ротенбергов «Стройгазмонтаж». В частности. «Стройгазмонтаж» строила наземную часть газопровода Nord Stream, газопровода Джубга — Лазаревское — Сочи, газопровод Сахалин — Хабаровск — Владивосток.
В начале 2015 г. «Стройгазмонтаж» без конкурса получил контракт на возведение Керченского моста на 228,3 млрд. руб. В конце 2015 г. «Стройгазмонтаж» получил пять подрядов без конкурса от «Газпрома» на строительство части газопровода «Сила Сибири» на 198 млрд. руб.
В конце 2000-х годов Аркадий Ротенберг был совладельцем одиннадцати ликеро-водочных заводов, входящих в состав ФГУП «Росспиртпром». Представители братьев Ротенбергов из компании «ЭнПиВи инжиниринг» входили в советы директоров Астраханского, Череповецкого и Ярославского ЛВЗ, «Мордовспирта», смоленского «Бахуса» и Иткуль-ского спиртзавода (председатель совета директоров «ЭнПиВи инжиниринг» — Игорь, сын Аркадия Ротенберга).
В 2010 г. структуры Аркадия Ротенберга купили у Михаила Абызова контрольный пакет строительной компании «Мостотрест». Часть проектов этой компании была связана с государственными заказами на подготовку к проведению Зимних олимпийских игр в Сочи в 2014 г. В 2013 г. «Мостотрест» без проведения конкурса получил от правительства Москвы подряд на строительство и реконструкцию транспортной инфраструктуры технопарка «Сколково». Общая стоимость работ составила 56,6 млрд, рублей.
В 2007 г. гендиректор «ЭнПиВи инжиниринг» Георгий Коряшкин вошел в совет директоров Северо-Западной концессионной компании (СЗКК), созданной французской компанией Vinci и ее подразделением Eurovia для работы в России. Летом 2009 г. Росавтодор заключил с СЗКК соглашение о строительстве первого участка дороги Москва — Санкт-Петербург (через Химкинский лес).
В апреле 2010 года впервые дал интервью прессе — газете «КоммерсантЪ». В частности, признал, что является миноритарным совладельцем гостиницы «Москва» в центре Москвы (12,5 %, такая же доля на тот момент — у жены партнёра А.Ротенберга по СМП-банку Константина Голощапова) и планирует продать свою долю[210].
В марте 2010 г. братья Ротенберги приобрели 76 % компании «Северный европейский трубный проект» (СЕ 111) — одного из крупнейших поставщиков труб для «Газпрома». В 2012 г. СЕТИ выиграл тендер «Газпрома» на поставку 250 тысяч тонн труб большого диаметра. Стоимость закупки — 20,2 млрд, рублей.
В октябре 2010 г. братья Ротенберги приобрели у структур «Газпрома» 100 % акций ОАО «Теплоэнергетическая компания Мосэнерго».
В 2011 г. структуры Аркадия Ротенберга купили на открытых торгах 100 процентов долей компании «Газпром бурение», которая занималась сервисными работами в интересах ОАО «Газпром».
210
Аркадий Ротенберг: Никто не может сказать, что я кого-то унизил, у кого-то что-то отнял // КоммерсантЪ. - 2010. - 28 апреля. URL:
http://www.kommersant.ru/doc/1361793 (дата обращения: 09.04.2016).