Туземцы, хотя и не изменили своего расположения к испанцам, но все же, увидя, что и белые могут быть побеждены, перестали их бояться. Поэтому испанцы стали опасаться, что туземцы в один какой-либо день нападут на них и отберут все товары. Чтобы избежать этого, они свезли все товары с берега на корабль, чем вызвали среди туземцев большое неудовольствие. С каждым днем волнение все усиливалось. Оставаться на острове было опасно. Печальные, потерявшие в короткий промежуток времени своих лучших руководителей, вернулись матросы на корабли.
Значительно поредели их когда-то многочисленные ряды. Самых смелых, самых славных нехватало, и из экипажа, почти в 300 человек, оставалось теперь немного больше ста. Конечно, это было слишком мало для трех кораблей. И так как один из них, "Консепсия", находился в очень плачевном состоянии и совершенно не годился для плавания, его решили сжечь. Осталось теперь лишь два корабля: главный "Тринидад", где капитаном теперь был вместо Магеллана Корвальо, и "Виктория", управляемая Эспинозой.
Покинув Филипинские острова, экспедиция все же не пала духом. Воодушевленная волей и энергией своего бывшего вождя, направилась она далее на запад, в воды, принадлежавшие Португалии.
Спустя несколько дней, перед ними показалось первое за долгое время их путешествия значительное торговое селение, напоминавшее даже город. Это был Бруней, весь выстроенный на сваях, стоявших наполовину в воде. В то время в нем было не менее 25 тысяч домов.
Увидя перед собой этот город, испанцы поняли, что они находятся уже в области, где португальцы бывали не раз.
Король брунейский принял пришельцев сначала очень благожелательно. Испанцы часто приходили в его дворец, где развлекались ездой на слонах. Но и тут вскоре явились мрачные подозрения, которые вскоре и оправдались.
Очевидно, уже и в то время жители островов не очень-то любили своих завоевателей. Однажды несколько матросов, посланных зачем-то на берег, не возвратились. Взамен этого, на следующее утро корабли испанцев были окружены не менее чем двумястами туземных лодок. Одну из лодок удалось взять в плен. В ней оказался сын короля и его приближенные. Испанцы хотели этим воспользоваться, чтобы взамен этих пленников получить обратно задержанных матросов. Но Корвальо позволил принцу перехитрить себя и выпустил его.
Велико было возмущение экипажа, когда они узнали про это. Теперь им надо было уехать, предоставив оставшихся на острове матросов в жертву неизвестности, а, может быть, и смерти.
Лишенный доверия экипажа, Корвальо должен был оставить свой пост капитана, и его место занял Эспиноза. Вместо Эспинозы на "Виктории" капитаном был назначен старший офицер Себастьян Дель-Кано. Этому неизвестному человеку впоследствии одному пришлось, совершенно незаслуженно, принять на свой счет все почести и всю славу за совершенный не им подвиг.
Дальнейшая часть пути прошла без всяких приключений. Наконец, испанцы, выйдя раз утром на палубу, заметили на горизонте смутные очертания четырех островов. По словам сопровождавшего мореплавателей туземного лоцмана, то были Молукские острова, находящиеся недалеко от Индии.
Итак, цель была достигнута: перед путниками расстилалась долгожданная земля. После двухлетних бедствий и несчастий, унесших почти две трети экипажа, уничтоживших три корабля, великий план Магеллана был все же осуществлен. Индия была достигнута с западной стороны.
Когда испанцы увидели, наконец, свою мечту исполненной, они, в порыве радости, забыли про все несчастия и горячо обнимали друг друга под гром пушек.
Пробыв на острове больше месяца, мореплаватели решили, наконец, отправиться в дальнейший путь. По словам Пигафетты, пребывание на этих островах явилось для всей экспедиции самым светлым временем из всего путешествия.
Но как ни не хотелось им покидать этот земной рай, все же надо было спешить домой, чтобы сообщить радостную весть.
Теперь уже предстояла дорога не такая долгая и более или менее знакомая — по Индийскому океану, мимо берегов Африки, а потом по Атлантическому океану, к берегам Испании.
Но в самый день отплытия экспедиции после осмотра кораблей оказалось, что "Тринидад" совершенно негоден более к плаванию. Первая непогода могла похоронить его в водах океана. Это известие, хотя и было неожиданно, однако, не очень-то опечалило путешественников. Многие из них так хорошо себя чувствовали на Молукских островах, что ничего не имели против того, чтобы остаться на них.