После выплаты огромных возмещений и расходов на те бесчисленные дорогие подарки, которые Али ибн Иса в бытность свою наместником отсылал или сам отвозил халифу, в его казне еще оставались значительные богатства. Как свидетельствует автор «Та’рихи Табари», кроме изделий из золота и серебра, из казны Али было конфисковано восемьдесят миллионов тенег, а изъятые у него и отправленные халифу шелковые ткани и одежды составили поклажу у полутора тысяч верблюдов.
Все эти деньги и имущество представляют яркое свидетельство того, какой степени достигло угнетение народа, какие беззакония чинил Али ибн Иса.
Если меры, принятые халифом по отношению к Али ибн Исе, успокоили население Хорасана и привели к прекращению мятежа в Балхе, то в Мавераннахре мятеж продолжался, расширяясь день ото дня. Вскоре вся провинция, включая и Бухару, оказалась в руках повстанцев. Рафи ибн Лайс назначил правителем Бухары своего брата Бушра ибн Лайса.
После наступления затишья в Хорасане халиф направил Хузайму с большим войском в Мавераннахр. В Бухаре Хузайма захватил в плен Бушра, но мятеж по-прежнему не утихал.
Бушр был отправлен к халифу в Туc. Халиф вызвал мясника и велел ему в своем присутствии разрубить Бушра на четырнадцать частей. После этого он объявил, что такой же казни будет подвергнут каждый несдавшийся мятежник, который попадет в плен. Однако и эти угрозы халифа не подействовали на повстанцев Мавераннахра: мятеж продолжался, и карательные отряды халифских воинов не могли продвинуться вперед. Тем временем Харун ар-Рашид скончался. Вместо него халифский престол в Багдаде занял его сын Мухаммад Амин. Перед смертью Харун ар-Рашид назначил другого своего сына, Мамуна, наместником Хорасана. Мамун хотя и отправил войска в Мавераннахр для подавления восстания, но проявил одновременно склонность к правосудию. Руководил им Фазл ибн Сахл – в прошлом маг-зороастриец, бывший раб Мамуна, принявший под его покровительством ислам, затем служивший у него же секретарем, а в конечном счете ставший его везиром.
По совету Фазла, Мамун каждый день приходил в соборную мечеть. Там же по его приказу собирались ученые и мудрецы из простого народа. В мечети Мамун принимал заявления, выслушивал жалобы населения и выносил приговоры, советуясь при этом с учеными и мудрецами.
Так Мамуну удалось окончательно успокоить население Хорасана; поверили в его справедливость и жители Мавераннахра. В армии, отправленной Мамуном в Мавераннахр для подавления восстания Рафи ибн Лайса, служили рядовыми воинами Асад ибн Саман (прадед Саманидов) и его сыновья – Нух, Ахмад, Яхья и Ильяс. Асад со своими сыновьями выступил в качестве посредников и склонил самаркандцев и Рафи к заключению мира. Таким образом, прекратился, и мятеж в Мавераннахре...
Мамун считал это успокоение населения Хорасана и Мавераннахра временным, он понимал, что в результате любого несправедливого поступка какого-нибудь арабского чиновника народ снова может восстать. Поэтому он решил назначить в Хорасан и Мавераннахр наместниками и правителями, подчиненными его власти, представителей местного населения. К этому мнению он пришел на основании опыта правления в Хорасане и Мавераннахре Бармакида Фазла ибн Яхьи.
Тем временем между двумя братьями – халифом Мухаммадом Амином и Мамуном – вспыхнула вражда. Опираясь на поддержку преданных ему дихканов и войск Хорасана и Мавераннахра, Мамун сверг своего брата и сам стал халифом. После победы он не переезжал в Багдад и оставался в Мерве, опасаясь, что в его отсутствие в Мавераннахре и Хорасане может вновь вспыхнуть восстание, и тогда эти богатейшие провинции, являвшиеся сокровищницей и лучшим украшением халифата, будут им безвозвратно утрачены.
Однако волнения, начавшиеся в Арабистане, вынудили его все же переехать в Багдад, а для сохранения Хорасана и Мавераннахра в своих руках он осуществил обдуманный ранее план и передал власть в этих провинциях местным правителям.
Наместником Хорасана он назначил двоюродного брата своего везира Фазла ибн Сахла – зороастрийца Гассана ибн Ибада. Поскольку Мамун знал сыновей Самана как опытных и способных людей, а в уважении и авторитете, которыми они пользовались среди местного населения, он убедился, когда они успешно справились с посредничеством между ним и жителями Маверанпахра, он поручил Гассану ибн Ибаду назначить каждого из них правителем какой-нибудь области.