Хотя общий тоннаж транспортного соединения «Балтийское море» к 1 октября 1941 г. составлял уже 732 000 брт и при этом должно было еще осуществлять задачи во время десантных операций, возможности перевозки морем были еще не полностью использованы верховным командованием. Дивизии, действовавшие против Ленинграда, из-за трудностей со снабжением не продвигались вперед, плохое состояние советских автомобильных и железных дорог не допускало увеличения масштаба перевозок. Между тем, если бы здесь действовали более мощные военно-морские силы и несколько соединений авиации, то торговые суда несомненно смогли бы быстро перевезти большое количество довольствия в эстонские порты Финского залива и тем самым обеспечить большее воодушевление наступающих немецких частей. Однако, т. к., согласно немецким планам, сухопутные операции должны были носить наступательный характер, а морские — оборонительный. это противоречие так и не было разрешено и даже наступательная минная война немцев в Финском заливе привела в конце концов к тому, что стало невозможным использовать боеспособные надводные силы в масштабе, необходимом для охранения больших караванов судов.
Финские Аландские острова, согласно договору с русскими от 11 октября 1940 г., были полностью разоружены. Чтобы избежать советской оккупации, финны до начала войны сосредоточили торговые корабли в Або (Турку), Ништадте и в Раума, в то время как оба броненосца стояли в Корпо. Охранение конвоев осуществлялось легкими силами. Перевозка 5000 человек, 24 минометов, 55 полевых и 14 береговых орудий была по приказу назначена в ночь с 21 на 22 июня, однако корабли, уже вышедшие в море, получили приказ вернуться обратно. Лишь в 03.00 22 июня был наконец получен приказ о проведении этой операции, и между 05.30 и 22.30 все части без инцидентов были перевезены на Аландские острова. Одновременно были поставлены минные поля в районе Нихамна и Кекара, а вслед за этим поставлено еще одно заграждение в районе Мякет 24 июня. 1 июля была создана оборона Аландских островов, и финские морские силы передислоцировались в пункты базирования западнее Ханко. Переход дальше на восток мимо Ханко пока не рекомендовался, т. к. там находились минные заграждения русских, а также их береговые батареи и корабли. Этим объясняется слабость финских военно-морских сил в восточной части Финского залива. Лишь 24 августа финские канонерские лодки получили приказ попробовать прорваться на восток. Немецкие тральщики должны были сопровождать финские корабли до границы немецко-финского оперативного района, а там уже финские минные заградители должны были взять на себя эскортирование. Во время плохой погоды 24 и 27 августа были сделаны попытки прорваться, но взаимодействие между финнами и немцами, по-видимому, не было налажено, так как выходы каждый раз признавались неудачными и превращались. 27-го вышли в море финские минные заградители «Руотсинсалми» и «Риилахти» и, не встретив остальных кораблей в назначенном месте, прошли через минные заграждения на восток и достигли Оре. В ночь на 29 августа финские корабли без поддержки немецких кораблей и без всяких инцидентов вернулись на восток. Так еще раз русские упустили возможность с легкостью добиться успеха, использовав свои находящиеся в Таллине и у Ханко ВМС, намного превосходящие силы противника.
Начиная с конца августа, финские войска периодически добивались успеха в сухопутных боях в районе Выборга, на морском фланге, поддерживаемые только 7 старыми торпедными катерами. Все чаще и чаще здесь в операциях использовались канонерские лодки, передислоцированные сюда с Аландских островов. Правда, «Карьяла» 6 октября была атакована немецкими самолетами и получила тяжелые повреждения. Пилот сообщил о 360-тонном корабле, что это якобы был транспорт тоннажем 4000 брт. Оперативный район немецких военно-морских сил тянулся до широты и долготы острова Нерва, однако немецкие военно-морские силы здесь почти не появлялись и финны не должны были здесь действовать. Вообще, финны никогда не были довольны разделением оперативных районов между ними и немцами.
Запланированная финнами высадка на острове Койвусаари была в начале сентября отложена, и приведенные для этой цели в боевую готовность торпедные катера, дозорные катера, канонерские лодки и минные заградители были передислоцированы в базы, расположенные дальше к западу.
Канонерские лодки «Хямеенмаа» и «Уусимаа» в ночь с 10 на 11 октября нанесли удар из Котки по острову Сомерс, обстреляв советские позиции и не попав при этом под огонь советских частей. Лишь после того, как операция была повторена в ночь с 13 на 14 октября, русские ответили огнем зенитных 40-мм орудий.