На помощь десантникам с аэродрома Анапа вылетели 12 Ил-2 из 47-го ШАП ВВС ЧФ в сопровождении ЛаГГ-3 из 9-го ИАП. Они должны были нанести штурмовые удары по вражеским частям, атаковавшим позиции десантников из 31-го стрелкового полка на Эльтигенском плацдарме. Пилоты штурмовиков в условиях облачности плохо видели поле боя и не могли обнаружить главные цели – самоходные штурмовые орудия. Ведущие групп в таких условиях или вообще отказывались от атак, или наносили удары по первым подвернувшимся целям.
Лишь звено во главе с лейтенантом Борисом Воловодовым обнаружило и атаковало штурмовые орудия. По докладам экипажей, прямыми попаданиями реактивных снарядов были уничтожены одна самоходка и две автомашины. Во время второго захода, в 15.08, Ил-2 лейтенанта Воловодова лоб в лоб столкнулся с немецким двухмоторным самолетом, который наземные наблюдатели определили как «Ю-88». Оба самолета рухнули на землю. Воловодов и штурман 1-й эскадрильи младший лейтенант Василий Быков, выполнявший в том вылете функции бортстрелка, погибли.
Летчики 47-го ШАП по возвращении на аэродром доложили, что их ведущий был сбит или зенитками или шальным попаданием из миномета. Однако на следующие утро в полк из вышестоящего штаба сообщили, что «…ваш „Ил“ совершил таран». Основанием для этого послужили сообщения, поступившие из 1-го батальона 31-го стрелкового полка, чьи солдаты были очевидцами случившегося. Позднее Воловодову посмертно присвоили звание Героя Советского Союза, а Быкова посмертно наградили орденом Отечественной войны I степени.
В действительности жертвой тарана стал Bf-110G-2 W.Nr. 5200 «2N+RU» из Kustenstaffel Krim. Оба члена экипажа – пилот обер-лейтенант Хуберт Рейхельт, имевший на счету 5 побед, и бортрадист-стрелок унтер-офицер Р. Шрейбер – погибли. Эта отдельная многоцелевая эскадрилья под командованием гауптмана Ханса Криммлера базировалась тогда на аэродроме Сарабуз, и в ее составе было около десятка Bf-110 и 6 He-111H-6.
Тем временем весь день 3 ноября шла переправа на плацдарм в районе Опасное—Глейки—Жуковка оставшихся подразделений 2-й гвардейской СД генерал-майора Адама Турчинского и 55-й гвардейской СД генерал-майора Бориса Аршинцева. К восьми часам вечера обе дивизии уже были Керченском полуострове. При этом флот понес новые потери, к части из которых приложили руку пилоты люфтваффе.
Около 16.30 у косы Чушка парой Bf-110 из Kustenstaffel Krim были атакованы артиллерийский катер (АКА) № 116 и катер-тральщик КЭМТЩ № 111. В результате на первом погибли три моряка, включая командира катера старшего лейтенанта В.С. Кравцова, а также большинство из находившихся на нем 25 десантников. Поврежденный катер смог дойти до причала на косе Чушка и уже там затонул. Второй катер затонул сразу после атаки «Мессершмиттов», погибли 3 человека из его команды.
Затем в 17.45 в районе Глейки пара Bf-109 обстреляла бронекатер № 112. Погибли 3 моряка, включая командира катера лейтенанта Д.П. Левина, а также 3 десантника. Еще 6 моряков и столько же десантников были ранены. Сам бронекатер получил повреждения и временно вышел из строя.
В ночь на 4 ноября немецкий флот предпринял попытку не допустить дальнейшую доставку войск и грузов на захваченные плацдармы. Пять быстроходных десантных барж (БДБ) должны были блокировать плацдарм восточнее Керчи, а четыре других – Эльтигенский плацдарм. Их должны были поддержать торпедные катера S-26, S-28, S-45, S-47 и S-49, а также два так называемых «раумбота» – катерные тральщики.
Вскоре после полуночи в Керченском проливе произошло несколько скоротечных боевых столкновений, когда противники в темноте теряли друг друга из виду. Сначала в 01.25 в районе мыса Такиль артиллерийским огнем с «раумботов» был поврежден торпедный катер № 81, который после этого ушел в сторону Тамани. В 01.51 в районе Опасное в бою с немецкими БДБ артиллерийским огнем был поврежден СКА № 0112. Он получил надводную пробоину и лишился мачты. Четыре моряка были убиты, а сам катер надолго вышел из строя.
Почти час спустя в районе мыса Такиль в ходе дуэли все с теми же R-204 и R-216 сначала загорелся, а потом в 02.47 затонул торпедный катер № 101 старшего лейтенанта Алексея Макухи. Все семь моряков, находившиеся на его борту, включая командира 2-го отряда ТКА 1-го дивизиона ТКА 1-й бригады ТКА капитан-лейтенанта Владимира Боброва, погибли.
При этом в этих стычках ни один из «раумботов» не получил никаких повреждений. Незначительные повреждения получили БДБ F335, на которой был ранен один моряк, и F578.
Однако эти боевые столкновения в проливе не помешали переправе. Так, за ночь в Эльтиген были доставлены 384 человека, две 45-мм пушки, 18,2 тонны боеприпасов, 10,6 тонны продовольствия и 0,4 тонны медикаментов.